KEGG   Solanum tuberosum (potato): 102588934
Entry
102588934         CDS       T02981                                 
Name
(RefSeq) glycine-rich cell wall structural protein 1.0-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
sot  Solanum tuberosum (potato)
Pathway
sot03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sot00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    102588934
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
    102588934
   03041 Spliceosome [BR:sot03041]
    102588934
Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     102588934
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     102588934
Spliceosome [BR:sot03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    102588934
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_PARP14_3 RRM_7 RRM_PARP14_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 102588934
NCBI-ProteinID: XP_006357467
LinkDB
Position
Un
AA seq 364 aa
MYQKISGMPLGFGFVTYADTEIADKVLKENHIIDDRKVDVKIPVTYRQRIFVGGLPLSLT
EGELKEYFSSYGNVVGHQIILDKTTGRSQRFGIVSFDKEEAVEKVLSNGHIHELRGKQVE
IKRAKSKRDCAEHTSESQIHHGGSGSKSYYGDGGSLEAFGGGYGGNMGSGYGVYEGYGDY
GGYGKFAGSYGVSPTGFYSGYGYGFWFGEAMYGAAGYEGSTYGIPAYYGGGSGYGNRGNG
SNDGGNGGYGGGGGNGAYAYGNAGAANGRFVPAYYGGGSGYGNSGNGSNDGGNRGYGGGG
GNGANAYGNAGADNGRSVPAYYGGGSDDGSRGNGSNDGCNGGYGGGGENGATGADNGRSH
PSLK
NT seq 1095 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatcagaaaatctctggaatgccactaggatttggatttgttacatatgctgacacg
gaaattgcagataaagttttaaaggaaaaccatatcatagatgatagaaaggtcgacgtg
aagataccagtaacttatagacagagaatttttgttggtggtcttccattatctttaact
gaaggcgagttgaaggaatatttttcttcttatggcaatgttgtggggcatcagatcatt
ttggataaaacaactggtcggagccaacgttttggcattgtgagttttgataaagaggaa
gcagttgaaaaagttttatctaatggccatatccatgaacttcgtggcaaacaagttgaa
attaagagggctaagtcaaagagagattgtgctgaacatacaagtgaaagccagatacat
catggtgggagtggttcaaaatcatattatggcgatggtggttctctagaggcttttggc
ggtggatatggtggaaatatgggtagcggttatggtgtatatgaaggatacggtgactat
ggcgggtatggcaagtttgcaggaagttatggtgtaagtcctacaggattttactctgga
tacggttatggattttggtttggtgaagctatgtatggtgcagctggttacgaaggcagc
acctatggtatacctgcctactatggtggtggtagtggttatgggaacagaggtaacggc
tcgaatgatgggggaaatggaggatatggaggtggtggcggaaatggtgcctatgcatat
gggaacgctggtgctgctaatggaaggtttgtgcctgcctactatggtggtggtagtggt
tatgggaacagtggtaacggctcgaatgatgggggcaacagaggatatggaggtggtggc
ggaaatggtgccaatgcatatgggaacgccggtgctgataatggaaggtctgtgcctgcc
tactatggtggtggtagtgatgatgggagcagaggtaacggctcgaatgatgggtgcaac
ggaggatatggaggtggtggggaaaatggtgccaccggtgctgataatggaaggtctcat
ccttctttgaagtga

DBGET integrated database retrieval system