Solanum tuberosum (potato): 102596521
Help
Entry
102596521 CDS
T02981
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
sot
Solanum tuberosum (potato)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pollen_Ole_e_1
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102596521
NCBI-ProteinID:
XP_015159515
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1553 aa
AA seq
DB search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NT seq
4662 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggcttctcgctggcggccccggccggggtcgtcattatttgccacatatcttagtg
gcattgttggccattttggctgttgttgatattgtttctgctgacccttacatatatgca
tctccacctccaccttatgagtacaagtccccaccacctccttctccctctccaccacca
ccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtac
aagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccacca
cctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacct
cctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccacca
ccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtac
aagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgcca
cctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccc
tctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacctcctccaccacca
ccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtac
aagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccacca
cctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacct
cctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccacca
ccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtac
aagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgcca
cctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccc
tctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacctcctccaccacca
ccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtac
aagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccacca
cctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacct
cctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccctctcctccacca
ccatacttgtacaagtccccgccacctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtac
aagtccccaccacctccatcaccctctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgcca
cctccaccacctcctccaccaccaccatacgtgtacaagtccccaccacctccatcaccc
tctcctccaccaccatacttgtacaagtccccgccacctccatcaccttctccaccacca
ccatacgtgtacaagtccccaccacctccttcaccatctccaccaccaccatactactac
aagtccccaccacctccttcaccgtctccaccaccaccatactactacaagtctccacca
cctccatcaccatctcctccaccaccttactactataaatcacctcctccaccctcacca
tcgcctcctccaccatattactacaagtccccaccacctccatcaccttcaccaccacca
ccttactactacaagtcccctccaccacctgatccctcaccaccaccaccttactactat
aagtctccacctccaccttcaccatcaccacctccaccttattactacaagtctcctcca
ccaccttcaccatcacctccaccaccatactactattcttccccaccaccaccaaagaaa
tcacctcctccaccatactactactcttctcctccaccacccaagaagtcacctccacct
ccatactactacagctctccaccaccaccagttaagtctcctcctccaccatactattac
tcctcaccaccaccacccaagaagtcaccaccaccaccatactactactcctcgccacca
ccacccaagaagtcacctcctccaccatactactacagttctccaccaccaccagttaag
tcaccaccacccccatactactactcttcccctccaccaccagttaagtcacctccttca
ccatactactacacttcccctccaccacctacttcttactatcctcctcatcatcccttg
atcgttaaggttgtcggaaaagtctattgctacagatgctatgactggaaatacccaaag
aaatcccatgacaagaagcacctcaaaggtgctgttgttgaggtaacatgcaaggttggt
gacaagaaaatcaagagctatggtaccactaagattaatggaaagtatagcatcactgtt
gaaggatttgattatgccaaatatggagcagatgcatgcaaggctaaactccacaaagca
ccaaaggattcaaaatgtaacatccccacagatcttcattggggcatcaagggtgctaac
ctcaaagtgaagtcaaagaatcattatgaagttgtgctctctgctaaaccatttgcttat
gctccaaaaactccatatgaagaatgcatgaagcctaagccaaccccaactccttactac
tacaaatctcctccaccaccatcaccaaaatacgtgtacaagtccccacctcctccatcc
cccaagtacgtgtacaagtcaccaccacctccatcaccaaagtacgtgtacaagtcacca
ccacctccatcaccaaagtacgtgtacaagtcaccaccacctccatcaccaaagtacgtg
tacaagtcaccacctcctccgtcacctaaatacgtgtacaaatcaccaccacctccatca
ccaaagtacgtgtacaagtcaccacctcctccatcacctaaatacgtatacaagtcacca
ccgcctccatcaccaaagtacgtgtacaagtcaccacctcctccatcacctaaatacgtg
tacaagtcaccaccacctccatcaccgaagtacgtgtacaaatcaccacctcctccatca
cctaaatacgtgtacaagtcaccaccacctccatcaccgaagtacgtgtacaaatcacca
cctcctccatcacctaaatacgtgtacaagtctccaccacctccctcacctaagtacgtc
tacaagtccccaccaccaccatcacctaagtacgtctacaagtccccaccaccaccacca
tactattacaagtctcctccaccaccatctccatcaccaccacctccatactactacaaa
tctcctccaccaccatcaccatcacctccacctccctactattacaagtctccaccacca
ccatcgccatctcctcctccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccatca
cccccacctccctactattacaagtctcctcctccaccatcaccatctcctcctccacca
tactactacaagtctccaccaccaccagacccatctcctccaccaccatactattacaaa
tctcctccaccaccatctccatcaccgccacctccatactactacaaatctcctccacca
ccatctccatcacctccacctccttactactacaagtctcctccaccaccatcgccatct
cctcctccaccatactactacaaatccccaccaccaccttccccatctcctcctccacca
tactactacaaatccccaccaccaccttccccatctcctcctccaccatactactacaaa
tccccaccaccaccttccccatctcctcctccaccatactactacaaatccccaccacca
ccttccccatctcctcctccaccatactactacaaatccccaccaccaccttccccatct
cctcctccaccatactactacaaatccccaccaccaccatccccatcacctccacctccc
tactactacaaatcaccacccccaccatctccatctcctcctccaccatactactacaag
tctccaccaccaccttccccatctcctcctccaccatactactacaaatccccaccacca
ccttccccatctcctcctccaccatactactacaagtctcctccaccaccatcgccatca
cccccacctccatactactacaaatcaccaccaccaccatccccgtcacctccacctccc
tactactacaagtctcctccaccaccatcgccatctcctcctccaccatactactacaag
tccccaccaccaccatcaccgtctcctcctccaccatactactacaaatcaccaccaccc
ccatctccatcaccaccacctccctactactaccactctcctcctccacctgtgaagtct
cctcctcctccatactactacagctcacctcccccacccgtaaaatcacctccccctcca
gtatacatctacggttctccaccaccaccagtccactactaa
DBGET
integrated database retrieval system
