Solanum tuberosum (potato): 102601968
Help
Entry
102601968 CDS
T02981
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
sot
Solanum tuberosum (potato)
Pathway
sot03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sot00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
102601968
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
sot03019
]
102601968
Messenger RNA biogenesis [BR:
sot03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
102601968
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
PARG_cat_microb
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102601968
NCBI-ProteinID:
XP_006356068
UniProt:
M1B1N0
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
442 aa
AA seq
DB search
MDSDQAKLFIGGISWETSEERMKEYFQGYGDVLQTVVMRDKITGKPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDTHVIDGRTVEAKRALSREEQQGPKSGNMGSARSFGGGGNTKTKKIFVGGLPPTL
TEDGFRTYFETYGNVTDVAIMFDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTYHDLSGKQVE
VKRALPKDGNSGFGGRSTGNGGSGMGGGSYQGYGASGDNPSSYDRMDTSRYMQSQNTGGG
YPSYGSSGYGTAGYGYGSSNNGMGYGAYGSYGGANPGYGGVNPGYGSPAVAAFGNPNVPG
TGYGSGQAGGPRSSWGSQIPSGYGNMGYGNASWGASSAGGAANGGSATGQSPTGATGYGN
QGYGYGGYGGNDGAYGNPSIGGGASGDMQSGGGYMGSGYGDANGNSTLRSDTSQGSGNYG
AQQNGPYGGGYGGAPSRQAQQH
NT seq
1329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaagcaaagctatttattggtgggatatcatgggaaacatcagaggag
aggatgaaggagtattttcaagggtatggtgatgttttacagaccgtagtaatgagggat
aagattactgggaagcctagaggatttgggtttgttgtatttgcagatcctagtgttctt
gatagggttcttcaggatacccatgtaattgatggacgtacggttgaggctaagagggcc
ttgtccagagaggaacaacagggtccaaaatctggaaatatgggtagtgctagaagtttt
ggaggcggtggaaataccaagaccaagaaaatatttgttgggggattgcctcctactctg
actgaggatggctttagaacttactttgaaacttacggtaatgtcactgatgtcgcaatt
atgtttgatcaacagaccaaccgacctcgtgggtttggcttcatttcatttgattctgaa
gacgcagtagatagggttttgcacaagacatatcatgatctcagtgggaaacaagtagaa
gtaaaacgtgctcttcctaaagatggtaattctggttttggtggtcgttccacgggcaac
ggtggtagtggtatgggtggtggaagttaccaggggtatggtgcatctggtgacaatccc
agttcttatgacagaatggataccagcaggtacatgcaatcacaaaacaccggaggtggt
tatccatcttatggttcctccggatatggtaccgcaggttatggttatggatcgtccaac
aatggcatgggttatggtgcttatggaagttacggtggagccaatcctggctatgggggt
gtcaatcctggatatggtagtcctgcagttgctgccttcggaaatccaaatgtgcccggt
actggttatggtagtggtcaagctggtggaccaagaagctcgtggggctctcagattcct
tctggatatggaaatatgggctatggtaatgcatcctggggtgcttcaagtgcaggtggg
gctgctaacggaggatctgctactggccagtcaccaactggggccacaggatatggaaat
caaggttatggctatggtggatatggcggaaatgatggtgcttatggaaatccatctatt
ggaggtggtgcatcgggagacatgcaatcaggtggaggttacatgggcagtggctatggc
gatgctaatggaaattcaacattgaggtctgatacctcacaaggttctggtaattatggt
gctcagcaaaatggaccctatggtggtggctacggtggtgctccaagtcggcaggctcaa
cagcactga
DBGET
integrated database retrieval system
