Solanum tuberosum (potato): 102604539
Help
Entry
102604539 CDS
T02981
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
sot
Solanum tuberosum (potato)
Pathway
sot03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sot00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
102604539
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
sot03019
]
102604539
Messenger RNA biogenesis [BR:
sot03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
102604539
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
NTP_transferase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102604539
NCBI-ProteinID:
XP_006354447
UniProt:
M1BFS0
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
475 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFQGYGDVLQTVVMRDKISGKPRGFGFVVFADPNVL
DRVLQDEHVIDGRTVDAKRALSREEQQGSKSGNTNSARNFGGGGNTRTKKIFVGGLPPTL
TEEGFRQYFESFGNVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQKPFHDLNGKQVE
VKKALPKDANPGAGGRSMGGGGGSGMGGGSYQGYGGSGNNPSSYDSRMDSNRYMQTQNAG
AGYPYGSSGYGTPGYGYGPSNNGMAYGGYGSYGGANAGYGGANPGYGAAAVAAAYGNPNA
ASAGYGSGPAGGPRSTWGSQGPSGYGNMGYGNAPWGAANAAAGGGGPASGGSGQSPTGTA
GYGNQGYGYGGYAGNEGAYGNQSGYGAVGRASGAPSGNSPVGGGAAGDMQSGAGGYMNSG
YADASGNSSYGNSAWRSDNSQSSGNYGAPPNGAHGGQVGYGGGYGGAPSRQAQQQ
NT seq
1428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctttttattggtgggatttcatgggaaacaactgaggag
aagcttaaggagtattttcaaggatatggagatgttttgcagacagttgttatgagggat
aagatttctgggaagccaagaggatttgggtttgttgtttttgcagatcctaatgttctt
gatagggttcttcaagatgaacatgttattgatggccgtacggttgatgctaagagggcc
ttgtcgagagaggagcagcagggctcaaaatctggaaacacaaatagtgccagaaatttt
ggaggtggtggaaataccaggaccaagaaaatttttgttgggggattgcctcccactttg
accgaggaaggattcagacaatattttgaaagttttggtaatgtcactgatgtagtaatt
atgtatgaccagcagaccaaccgacctcgtgggtttggtttcatctcatttgattccgaa
gatgcagtagatagagttttacagaagccctttcatgatctgaatggtaaacaggtagaa
gtaaagaaagctcttcctaaagatgctaatcccggtgctggtggccgttccatgggcggc
ggaggcggtagtggtatgggtggtggaagttatcaggggtatggtggatcaggtaacaat
cccagttcttatgacagtagaatggattccaacaggtacatgcaaactcaaaatgctgga
gctggctatccttatggttcatctgggtatggtaccccaggctacggctatgggccatcc
aacaatggtatggcctatggcggttatggaagttatggcggagcaaatgcgggctatggg
ggtgccaatcctggctatggtgctgctgcagttgctgcagcgtatggaaatccaaatgca
gccagtgctggttatggaagtggtccagcgggtggaccaagaagcacatggggctctcag
ggtccttctgggtatgggaatatgggctatggtaatgccccttggggtgctgcaaatgct
gctgctggtggtggtggacctgctagtggaggatctggtcaatctccaactggaaccgca
ggatatgggaatcaaggttatggttatgggggttatgctggtaatgagggtgcttatgga
aatcaatctggttatggtgctgttggacgtgctagtggtgctcctagtggtaactcacct
gttggaggtggtgctgcaggagacatgcaatcaggtgctgggggttacatgaatagtggc
tatgctgatgcaagtggaaactctagctatgggaattcagcatggagatctgataactca
caaagttctggtaattatggtgccccaccaaatggagctcatggtggccaagttggatat
ggtggtggatatggaggtgcccccagtcggcaagctcagcagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
