KEGG   Solanum tuberosum (potato): 102605451
Entry
102605451         CDS       T02981                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
sot  Solanum tuberosum (potato)
Pathway
sot03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sot00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    102605451
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
    102605451
   03041 Spliceosome [BR:sot03041]
    102605451
Messenger RNA biogenesis [BR:sot03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     102605451
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     102605451
Spliceosome [BR:sot03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    102605451
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 BRAP2 Spo7_2_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 102605451
NCBI-ProteinID: XP_006357668
UniProt: M1BGT3
LinkDB
Position
Un
AA seq 534 aa
MGSRKNDFGDGASPGKIFIGGVAKETTREQFVKYFEKYGEIIDSVIMKDRQTGRPRGFGF
ITFADPTVVDTVIAENHIINDKQVEIKRTIPKGSADSKDFKTRKIFVGGIPTTMTEDEFK
NFFSKFGKVTEYEIIRDHVSKRSRGFGFIVFDNEEVVDNLLAEGNRMDMMGTQVEIKKAE
PKKPSNPASAPAYGSNSRGRGYGDSYGGFADSYSGYDSGGFGPASYRSFGSRYGDYGYGG
RYGDFGSSEFGGYRGDPSLGYSSRFGSYAGGYGGGYSSSGLGAYGRGGGYGGYGGAGPGA
GYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYES
GPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGA
GYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYESGPGAGYES
GPGAGYESGPGAGYESGPGAAYESGTGAGYGGSGGLYGSRGGYSGSGRYHPYSR
NT seq 1605 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggttccaggaagaacgatttcggcgatggcgctagtcctggaaaaatctttattgga
ggtgtagcgaaagagacgacgcgagaacaatttgtgaagtactttgagaagtatggggag
ataatagactcggtgattatgaaagataggcaaacaggtagacccagaggttttgggttc
atcacttttgcggatccaacagttgtagacactgttatagctgaaaaccatattatcaat
gacaaacaagttgagattaaaagaaccatcccaaaaggatctgctgattcaaaggatttt
aaaacaaggaagatttttgttggtggcattccaactaccatgaccgaagatgaattcaag
aactttttctctaagtttgggaaagtaacagagtatgagatcatacgagatcacgtgtcc
aagcgttctagaggctttggatttattgtgtttgacaatgaagaagtagttgataatttg
ctggctgagggaaataggatggacatgatgggtactcaggttgagatcaagaaggcagaa
ccaaagaaaccctcaaacccagcttctgctcctgcatatggtagtaattctagggggcgt
ggatatggtgatagttatggaggatttgccgattcatatagcggttatgacagtggaggt
tttggccctgcttcttataggtcatttggatctaggtatggtgactatggatatggtggt
agatatggagactttggcagtagtgaatttggtggttaccgtggagacccctcacttggt
tattccagtcgttttggctcgtatgctggtggttatggtgggggatacagtagcagtggg
ctaggagcatatggccgtggaggtggttatggtggttatgggggagctggccctggtgct
ggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatct
ggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgct
ggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatct
ggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgct
ggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatct
ggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgct
ggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatct
ggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgct
ggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatct
ggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgctggttatgaatctggccctggtgct
gcttacgaatctggcactggtgctggttatggtggatcaggaggtttatatggaagtagg
ggagggtatagtggcagtggccgttaccatccttactccaggtag

DBGET integrated database retrieval system