| Entry |
|
| Name |
(GenBank) hypothetical protein
|
| KO |
| K09800 | translocation and assembly module TamB |
|
| Organism |
sova Sporomusa ovata
|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:sova00001]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:sova02000]
SOV_41260
Transporters [BR:sova02000]
Other transporters
Pores ion channels [TC:1]
SOV_41260
|
| SSDB |
|
| Motif |
|
| Other DBs |
|
| LinkDB |
|
| Position |
complement(4207569..4211900)
|
| AA seq |
1443 aa
MRIKAIALLIIVFIAGLAVFSWWSTYSQTVFAELEGTLAAQLTNSLGTKVTIGQLHTAGL
TSATVDDVTIFDKQGREMAAIKQVTVSYNVLALLRGQTTMDALKKITLSQAAIVLVEEAD
GTWNVACLKQEAKPDSPEFSGNVVLEQASIQVRSRKGQWDFDEIDGQFTIDGSQTVDAIL
TASHNASPLQIQGSLNNSKNSLWLTVKAEQLNPANYQALVPDGTELNFTAGLLKQVEVTV
VKSPKGLRYAGKFGLDNLAAQVAGIPVEQAQGNVMFSNESVYILGSHALVASQPVTVLGK
IGIAGDQPVFDLKVGSPGFDPTVINGNLPVTGIVKFEATVAGTLSDPVVAAKVTAAQGTV
ANYSLQTAKANLRFAGNILTFDNFSASMLGGQVQGQGEFDIVSSRYQLQLAGENLDAAAV
QELPLELSGRGKVSLSVSGQGSDWQSMAGMAAVTLAAGNINGIPYNTMSTLIERSGNKTT
VEYCNAALPTGYVAANGLLQGEQLTMKVSGQGIALQDIDDAIVKNSNFAGIVAFDGEITG
TTAAPAIALTFDIANLKANEQVLGTATGKLTADCQQVTLNQVLLTDGPASHEVTGKILLT
GSEPELNLAVISHAARAETFARMIMPELKVTGNVDHELSLTGPLSNPNFQGKIILTQGSL
YGQLIAKAEGSYERKDGAVTVNNLDVVSLGTSIKLSGTVAADNSLHFAVNAQNVKLGRLR
VNYPYPVIGKVNISGQVTGTVASPRLEGQLEAPLVLLNGQEIKNIFSHLTYQDGHATIRE
LHFAQGTGNYVFAGAADLNTKEIDGLLKVENGELAGILAIANIPERGIRGRLNGEIALNG
SITNPDVLLRGAISRGQIKNYSLDSIDIDAELTNQIITINKFMGKQGVDGILVARGQADL
NGAIDMEFGGRDIETGILPALFDTTVETKGKFSFNAQATGQTADPNVAVSLEIKDGSVAN
AEFDNLYGLFIYNQGSIHVNQLFLARGPYKASAYGVVPLKALNSQGRSKADITDRMDLKL
RLDNADLSILPMLTKEVAWATGPTTGEISVGGTLAQPTLNGQLTVVKGAIKLADLNEPIQ
NVGVDIRFQDDTITINDFDGQMGGGSYALNGSARLNGLALDHYNLKLSLDHLGIKHKYFA
GPLDGVVSLTSEKGKPQLSGKLTIEDATVNIPAVPEGGELAWDTGLDVELVIGNKVRMYN
PYLYDFLAAGKVKFSGTLQKPRAAGRIEARRGTVKYLTNRFNIESGSAEFTQYDSIIPII
KVKANAKLQRTRIDLVINGPATAMDLTLTSDPAMSQQEIMSILTLSGGDFSKSNSQARHD
SVLGHDQLVNLLNTGLQMRFIAEIENSMQNALGVDEFRLAKSSIFDTYSSRESQDNSDSS
FQGYNLEIGKYLTDKLLLSYTMDLDQQKNSVSLRYDLNKRLSVGGTFGGTNNGLFIIETR
TNF |
| NT seq |
4332 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcgaatcaaagcaattgctttacttataatagtatttatagctgggctggctgttttt
agctggtggtcaacctacagtcagactgtttttgccgaactggaaggaactttagctgcc
cagttgactaattcgttgggaaccaaggtaacaattggccaattgcatacggcaggactt
acttcagctaccgtagatgatgtaacgatatttgataagcaaggccgggaaatggcggca
atcaagcaggtcactgtttcctataacgtacttgctttgctgcgtggtcagacgaccatg
gatgctctcaaaaaaatcacactttcgcaagctgcaattgtattagtagaagaagctgat
ggtacctggaatgtggcatgcttaaagcaggaagctaaacctgacagcccggaatttagt
ggtaatgtagtcttagaacaggcaagtattcaagtccgttcacgcaaaggccaatgggat
tttgatgagattgatggtcagtttactatcgacgggagtcaaaccgttgatgcaattttg
accgccagtcataatgcctcgccactgcaaatacaaggctcgcttaacaattctaaaaac
agcctatggctgacagtcaaagcagagcaactgaatccagccaattatcaggcattggtg
cctgacggtacagaacttaatttcaccgccggtttgctcaaacaggtagaggttacagtt
gtaaaaagtcctaaaggcttgcgttacgcaggaaaattcggcctggataacctggcagcc
caggtggcaggtataccagttgagcaggcgcaaggtaatgttatgttttctaatgaaagt
gtttacatattaggcagtcatgcgcttgttgccagtcagccagtgactgtgttaggaaaa
atcggcatagcgggtgaccagccggtgtttgatttgaaggtaggatctcctggctttgat
ccgacggtcattaacggaaatttgccggttaccgggatagttaagtttgaagctacggtt
gccgggacactgagcgatccggttgtggctgctaaagttactgcagcgcaggggacagtt
gccaactattccttgcaaacagccaaggcaaaccttcgatttgcaggcaatatccttaca
tttgataatttttctgccagtatgctaggtgggcaggtacaggggcagggagaattcgat
attgtcagcagccgctatcaattgcagcttgctggtgaaaatttggatgcagctgctgtt
caagagctgccgctggaactaagtgggcggggaaaagtcagtctctctgtcagcgggcaa
ggcagtgactggcaatcaatggccggtatggctgctgtgaccctggctgcagggaacatc
aatgggataccgtacaataccatgtcaactctcatcgaacgcagtggcaacaagacaacg
gtagaatactgtaatgcagcgttgccaacaggctatgttgccgccaatggcttgctgcag
ggagagcagctgacaatgaaggttagcggccaggggatagccttgcaggatattgatgat
gctattgtgaaaaatagtaattttgccggaatagtggcatttgacggtgaaattaccggt
acaacagctgccccggccatcgcccttactttcgatattgccaacctaaaggccaatgaa
caagtattgggaacagccacaggcaagcttacagccgactgccaacaggtaactttgaat
caggttctccttaccgacggccccgccagccatgaagttaccggcaaaatcttgttgaca
ggctctgagccagagcttaatcttgcggtaatttctcacgccgcccgggctgagacattt
gccagaatgattatgcctgaacttaaagtaacaggcaatgtggaccatgagctaagcctg
acagggccgctgagcaatccaaattttcaaggaaaaattatcttgacacaaggcagcctg
tacggtcagcttattgccaaagccgaagggtcttatgaacgtaaagatggtgctgttact
gtcaataatctggatgtagtatcactgggtaccagcataaaactatctgggacagtggca
gctgataatagtttacattttgctgtaaacgcccaaaatgtaaaacttggcagactgcgg
gtaaattacccttatccagttataggcaaagtgaatattagtggtcaagtaacaggtact
gtggctagccccagactagaaggacaactggaagcgccgctagtcctgctgaacggtcag
gagattaaaaacattttttcgcacttaacatatcaagacggacacgccactatccgcgaa
cttcattttgctcagggtaccggcaactacgttttcgcgggggccgctgatctaaataca
aaagaaattgacggcttgctcaaggtggaaaatggtgaattggccggtattttggcaata
gccaatataccggagcgaggtattcgcggccggcttaacggagaaattgccttaaatggc
agcataaccaatcccgacgtgctattacgcggcgccatctccaggggacagatcaaaaac
tattcgcttgacagtattgacattgatgctgagcttactaaccagattattactatcaat
aaatttatgggtaaacaaggggttgatgggatacttgttgccagagggcaggccgatctg
aacggggctattgatatggaatttggtggccgcgatattgagaccggaattttaccggcc
ctgtttgatacaaccgttgagaccaaagggaaatttagctttaatgcccaggctaccggc
caaacagccgaccccaatgtagccgtatcgttggagatcaaagacggtagtgttgcgaac
gctgaatttgataatctctacgggttattcatctataatcaaggcagtattcatgttaat
caactgtttttggcgcgcggaccttataaagccagtgcctatggcgtagtaccgttaaaa
gccctcaatagccagggccgcagcaaggctgatataaccgatagaatggacctgaaactg
cgccttgataacgcggatttaagtatactgccgatgctgacaaaagaagtggcctgggct
actggtccaactaccggtgaaatcagtgttggcggcacattggcccagccaaccttgaat
ggtcagctaacagtagtcaagggcgccattaaattggctgaccttaatgaacctatccaa
aatgtaggggttgatattcggtttcaagatgatacaattactataaacgactttgatgga
caaatggggggcggttcctatgcgttaaacggttctgcccgtctaaacggcttagcgctt
gatcattacaacctcaaactaagcttggatcatttgggaattaaacacaaatactttgcc
ggaccgctggatggtgtggtatcattaactagtgaaaaaggaaaaccgcagctatcaggg
aaactgaccattgaagatgctaccgttaatataccggcagtgcctgaaggtggcgagctt
gcttgggataccgggctggatgtcgagctggtgattggcaataaagtccggatgtataat
ccctatctctatgatttcctggccgcgggtaaagtgaagttttccggtacattacaaaag
ccgcgagccgccggccgcatagaagcaaggcgcggtacggtaaaatacctgacaaaccgt
tttaacattgaaagtggcagcgccgaatttacccaatacgattcaattataccgataatt
aaggtaaaggctaacgccaaactgcaacgaacccgcattgatctggtgatcaatggccct
gctacggcgatggatctcactttaacctctgacccagccatgagccagcaggaaattatg
tcaatattgacgctcagcggcggtgatttttctaaatcgaatagtcaggccagacatgac
agtgtgttaggccatgatcagttagtcaacctgctgaataccggcttgcagatgcgtttt
attgccgagatagagaattccatgcaaaatgctttgggggttgatgagtttcggctggca
aaatcatcaatatttgatacctatagtagtcgggaaagtcaagataatagtgatagcagt
ttccagggatacaatctggaaataggcaaatatctaacagataaattgctactaagctat
accatggatcttgatcagcaaaaaaatagtgtaagtctgcgttatgatttgaacaagcgt
ctttctgtcggaggaacctttgggggaacgaataatggactattcataatcgagacaaga
actaatttctaa |