Candidatus Nanosynbacter lyticus: TM7x_00805
Help
Entry
TM7x_00805 CDS
T03502
Name
(GenBank) RCC1 repeat-containing protein
Organism
sox
Candidatus Nanosynbacter lyticus
Brite
Ubiquitin system [BR:
sox04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
TM7x_00805
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA06346
UniProt:
A0A6S4GPX9
LinkDB
All DBs
Position
148584..151010
Genome browser
AA seq
808 aa
AA seq
DB search
MIKNKKLLLIKNRRRTAYYFTFGGIIAVFAVMGFIFATSQQSHATIPAGGKQNEIGQVSY
RFYSPSNSANPGAPLAGTNTQAILSKPGADFRLRVGVQNKGLFTKSLAAVGEGHNHGCAI
LSDNKAYCWGEGAWGALGTNSTSDSSTPTPIYTDGDLSGKTIKQIATGDWHSCAIVSDNR
VYCWGYGSNGELGNGTYNQANAPVAVSTSGVMSGKNITQIATGFNHNCALDSDGKIYCWG
QNAYGELGNNSTTISNVPVATSMNEFGGRRVKQIIAGFFYSCALTTDGSVFCWGTTENGR
IGAGQTSGYSARPVQISFGGKKVESISGHATHACAVISGSQGLYCWGKNNRGQIGNGSTT
DSYAPSPASVSGILGGGKTIRQVKANYEHTCVLISSGDVYCWGAGDKGQLGNGSTSDSTS
PVKVNMLSITADNTISDIASGSNYSCALTTRGYVYCWGENSHYQLGNGSSSNALTPTSLS
TPGRTIGDSAIKLRAEYAKKGSAVTCSAVNGAAWRAINGAAKLRYATNGPADGTAITKIS
DDPALPDNTVGTRPQTIVRKNSPWTTFVNTQDIAAGEVGVWDLVLADRGLDRNENYCVRL
VTDTTAAPGTSVDTYDVYPEFKTAPGSLDLRFANSAGTTVVNPTARFADATTSRNSVITG
ASLSDSNSKQIEVVNTQTDAGWSVVLSASNGSTARWQQSGGTKSYMFNGNSDTQGFLSVK
FAAASVITSGNSLSGSSCNTSGVQKGSDLQFQAGGANANSITLMSSSSSTGQLGCAFLLR
NVRLNQTIPAYQSPGVYNLPMTLTVTAQ
NT seq
2427 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaataagaagttattattaattaaaaataggcgccgaacggcatattatttt
acttttggcggtattattgccgtttttgcggtcatgggcttcatttttgctacatcgcag
cagagccatgcgacaattccagcgggcggtaaacagaatgaaattggtcaagtctcatat
cgcttttacagtccgtcaaattcagctaatccaggagctccattagctggtactaatact
caggccatattgtcaaagcctggtgctgattttcgtttgagagttggcgtgcaaaataaa
ggactgtttacaaaaagcctggcagcggttggcgaaggacataaccacggttgtgctatc
ttgtcagataataaggcttattgttggggagagggtgcttggggggcgcttggcactaac
tcaacttccgattcgagcactccgacgcctatttatactgacggcgacttaagtggtaaa
actattaagcagattgctactggagattggcattcttgtgcaattgtttctgataacaga
gtgtattgctggggttatggaagcaatggagagctaggaaatgggacttataaccaggct
aatgcaccggtggccgttagtacttctggggtgatgtcaggtaaaaatattacgcaaatt
gccacaggatttaatcataactgtgcactagactccgatggtaaaatctattgctggggg
cagaatgcttatggtgagctaggtaataattcaacgaccatatctaatgtgccagtagct
acttccatgaatgagtttggagggcgacgagttaagcaaattattgcgggatttttctac
tcgtgcgccttaacgactgacggctcggtattttgttggggtactactgaaaatggtcgg
attggtgccggtcaaactagcggctattctgcgcggccggtacagataagctttggcggc
aagaaggttgagtcaatttctggacacgccactcatgcttgtgctgtaatttcgggttcc
caaggattgtattgctggggaaaaaataataggggacagattggcaatgggtcaactacg
gacagctatgctccttcacctgcctcggtaagtggaattcttggcggcggaaagacgatt
agacaggtaaaagctaactacgagcatacttgtgtattgattagtagcggagatgtttac
tgttggggagccggcgacaaggggcagttaggcaatgggtcaacctcagattcgacgtcg
ccggtaaaagtcaacatgctatcaataaccgctgacaatactataagtgatatagctagt
ggtagtaactactcttgtgctttaacgactagaggctatgtttactgttggggcgagaac
tcacattatcaattgggtaatggctcgtcgtctaatgcgctaacgcctacgtcgttatca
actccagggcgaaccatcggggactcagcaattaaattacgtgccgaatatgcaaaaaag
ggtagcgcggtgacatgttcagcagttaatggggcggcttggcgggctattaatggagcg
gcaaaacttaggtacgccacaaacggtccagcagatggtacggctataactaagatttca
gatgatccagcattaccagataataccgttggtacgcgcccgcagacgattgtcagaaag
aatagtccctggacaacgtttgtgaatacccaagatatagctgctggcgaagtgggggtt
tgggatttggtactggctgataggggtcttgataggaatgaaaattattgtgttcgttta
gttacagacactactgctgcgccgggcaccagtgttgatacgtatgatgtatacccagag
tttaagacggcccctgggtcgctggatcttcgttttgcgaacagcgcgggaacaacagtg
gttaatccaaccgcgagatttgctgatgcgaccacgagcagaaacagtgtaatcacgggc
gcttctctatcggactctaattcaaagcaaattgaggtggtcaatacgcagactgatgct
ggatggagtgtggtgttatcggcttctaatgggtcgactgctcgctggcagcagtcaggt
ggcacgaagtcctacatgttcaatggcaatagtgacacccaagggttcttgtcggttaag
tttgcggctgcctctgtcatcacgtcgggcaattcattgagtggatcgtcgtgtaacact
agtggtgtacaaaagggttctgatttgcaattccaagcgggaggagcaaatgcaaatagt
attacgctgatgagcagcagtagttcaaccggtcagttaggctgtgcatttttattgcgt
aatgttaggctaaaccagactattccggcatatcagagtcctggcgtgtataatttacca
atgacattaacggtgacggcgcagtag
DBGET
integrated database retrieval system