Sitophilus oryzae (rice weevil): 115882317
Help
Entry
115882317 CDS
T07985
Name
(RefSeq) putative elongator complex protein 1
KO
K11373
elongator complex protein 1
Organism
soy
Sitophilus oryzae (rice weevil)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
soy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
soy03016
]
115882317
Transfer RNA biogenesis [BR:
soy03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Elongator complex
115882317
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_ELP1_1st
HB_ELP1
Beta-prop_ELP1_2nd
A-sol_ELP1
TPR_ELP1
TPR_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115882317
NCBI-ProteinID:
XP_030756174
UniProt:
A0A6J2XZS6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1155 aa
AA seq
DB search
MENVELSVNLHKFDKNLLKNVTRSSIGDHACCFMTERNELCVADNFKDIKIIELAEYLND
NIVQVKYLSFWHCVFVGTENSFIITDLKTSKTVNLQTPTNNITYLSWNPNETCLIVVDKL
EHIFALNFQVVITNECPKFKFITLRKAHLNDPVPNSVYVGWGSHNTQFKGSKKIQEQTVI
ENPQEYSFPKVSWRGNGEQFVINFWRESKRFLKVFDSNLNPLYQSDVYPNLLPITSFKGQ
GNFIACASEYNEFNKIVIFEKNCLVKSEFLAKHIKGKIKDLQYHPDLHILSIFSECTENI
GYLSVYLYSNGHWYLKQQLNYTHDKQLISFYWTNCYDKNYCNLIVLTSVDIEQHFFKLIF
DRSLESGLIASIDGDKINFTNISEQIIPPPMSSFVLSFDEIVNRVIFNDGALNTCHIILS
NNSIKSYLIKNCHLEEFAEGSSLFSSLNNAFKHSSDSISLYSKEISINNASYNFSLDTNN
DLIVDGNIICNNVYSMIIFRNYLLFTHASSKLYCIRLNLKNISASKWDLKNFYSREVEQG
AKILSITNTFDIVLILPRGNLETITCRLIAIDIIEKLLEANRWDETVKEMRKQRLNWNLL
IDLNPERFCNHIDKFIEAASTISVLNSIVSEFSSENCLKTMYSECLNSEKGFSDIDKKQV
ISKILDKIITLNPIKNLISVVMLQIKHFSLKSALYSVCQVYQIGDMEICKKSVNQILLHH
HVKDVVNESYCLYNLGFLSFIYTCCSEDPRVFEPEIEQLKDLDEIHLRFKMNELGKKFST
ATKYLVRCSNYDSIFIRSFITKHVTQHIAYQSLTPKHANFKLASELFATFLSMRSKHNEA
GFVLERAGLLQESLNHYQKALNWQRLLILFQNLNLDQDSRKDILLNVANNLVSQKRLEEA
VIIYEYYCDERNKAIEVLTQERKFLQAMALAKKYNYKEVIENVIIPSIITYREDLLDRIT
ELGDKFSEYSARLQSLREKKIYKLKQRGLEVDGFIDNDDLHSEYGSIISRDSSLRSSSSS
LGSTQSSRNRRKQEKKKIDLREGGVFEDIALIRQLYLLIVDIFGCGQEVKDISSILTDEE
SFGYAKLLNEKLKNIQDQVILEIPKIWCDTFLNANESPEPDVLGIIQNRSELDIQFRSPP
SSELLTRNWSTLIFS
NT seq
3468 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatgtagaattgtctgtaaacttacataagttcgacaaaaacttgctcaagaac
gtcacgagatctagtatcggtgatcatgcttgttgttttatgactgaaaggaacgagctc
tgtgttgctgacaactttaaggatataaaaattattgaactagcagaatatttgaatgac
aatattgtacaagtgaaatatctcagtttttggcactgtgttttcgtaggaacagaaaac
agctttattataactgatttaaaaactagtaaaactgttaatctccaaacaccaacaaat
aatatcacatacttatcatggaaccctaatgagacatgtcttatagtagtggataaatta
gaacatatatttgcactaaattttcaagttgttattactaatgagtgtccaaaatttaaa
tttatcacattaagaaaagcacatttgaatgatcctgttccaaactctgtttatgtgggt
tggggctcgcataacactcaatttaaagggtcaaaaaaaatacaggaacaaactgtcata
gaaaatccacaagaatacagttttccgaaagtttcatggaggggtaatggagaacaattt
gtaataaacttttggagagagtcaaaaagatttttgaaagtgtttgacagtaatttgaac
cccttatatcagtctgatgtatatccaaatttgttacctataacatcgtttaaaggacag
ggtaactttatagcgtgtgcttctgaatataatgaatttaacaaaatagttatttttgaa
aagaattgtcttgtaaagtctgagtttttagcaaaacatattaagggaaaaataaaggat
ttacaataccatcctgatctgcatatcttatctatttttagtgaatgtacagagaatatc
gggtatcttagtgtttatttatattcgaatggacattggtatctcaagcaacaattaaat
tatacacatgataaacaattaatatcattttattggacaaattgttatgataaaaactat
tgtaatttgattgttttgaccagtgttgatattgagcaacatttttttaaactaattttt
gatagatctttagaatctggtcttatagcttctatcgatggagataaaattaattttaca
aatatttcagaacaaatcatccctcctcctatgtcatcttttgtcttatcttttgacgaa
atagtaaacagagttatttttaatgatggggctttgaatacctgtcatataattttatca
aataattctataaaaagttatttaataaaaaattgtcatttagaggaatttgctgaaggc
tctagtttattttcatcgttaaataatgcttttaagcactcgtcagattctataagccta
tattctaaggaaatctctattaataatgcttcttataatttttctttagatacaaataat
gatttgatagtagatggaaatataatttgtaacaatgtctattcaatgattatatttagg
aactatttattgtttacacatgcttcaagcaaactatactgtattagactgaatttaaaa
aatatttcggcatctaagtgggatttaaagaatttttattcaagggaagttgaacaaggt
gctaaaattcttagtataacaaacacctttgacatagtattaattttacctagaggaaat
ttagaaacgataacgtgccgcttaattgctattgatataattgaaaaattattagaagct
aatagatgggatgagactgttaaagagatgagaaaacaaaggctaaattggaatttgtta
attgacttaaatccagaacgattttgtaatcatattgataaatttatagaggctgctagc
acaatttcagttttaaactcaatagtttctgaattttcctctgaaaattgccttaaaact
atgtattctgaatgtttaaatagcgaaaaagggttctcagacattgacaaaaaacaagtg
atatcaaaaatccttgataaaataataactctaaatcctataaaaaacttaatcagcgtt
gtcatgcttcaaataaaacatttttctttaaaatcagctctatattctgtatgccaggtt
taccaaattggggatatggaaatttgtaaaaaatcagtcaatcaaatattacttcatcat
catgttaaagacgttgttaacgaatcttactgtctttataatttagggtttttgagtttt
atttatacttgttgttctgaagatcctcgtgtttttgaaccggaaatagagcaacttaaa
gaccttgacgagatacatttaagatttaaaatgaatgaactaggtaaaaaattttcaact
gctactaaatacctagtaagatgttcaaattatgactcaatatttatcagaagttttatt
acaaaacatgttacacagcatatagcttatcaaagtctaacacctaagcatgcgaatttt
aaattagcctctgagctttttgctacatttttatcaatgagatctaaacataatgaggct
gggtttgtcttagaaagggcgggattattacaagaatcgttaaatcactatcaaaaagct
cttaattggcaaagactattaattttgtttcaaaacttaaatttggatcaggattctaga
aaagatattttgttaaatgttgcaaataatttagtctctcaaaagagactagaagaagca
gttataatatatgagtactactgtgatgaaagaaacaaagctattgaagtattgactcaa
gaacgaaaatttttacaggcgatggccctagctaaaaaatataactataaggaggttatc
gagaatgtaataattccttcaatcataacatacagagaagacttgttggatagaataaca
gagctaggagataaattttccgaatattcagcaagattacagtctctcagagaaaagaaa
atatataaattaaaacaaagaggtttagaggttgatggattcattgacaatgacgatctt
catagtgaatatggcagtattatttcaagagattcatccttaaggtctagcagttctagt
ttggggtcaacccagtcttctagaaatcgtcgcaagcaagaaaagaaaaaaatcgattta
agagaaggcggcgtttttgaggatatcgctcttataagacagttatatcttttgattgtt
gatatttttggttgtgggcaagaagttaaagatatttcttcgattttgacggacgaagaa
agttttggctacgccaaattactgaatgaaaaattaaaaaatattcaggatcaagtaatt
ttagaaattccaaaaatttggtgtgatacatttttaaatgctaatgaatctccagagccc
gatgttttaggcattattcagaataggtctgaattagatatccaattcaggagtccacct
tcgtcagaattattgactaggaactggagcacgcttatattttcctaa
DBGET
integrated database retrieval system