Sitophilus oryzae (rice weevil): 115888622
Help
Entry
115888622 CDS
T07985
Name
(RefSeq) NFX1-type zinc finger-containing protein 1-like isoform X1
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
soy
Sitophilus oryzae (rice weevil)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
ZnF_RZ-type
AAA_19
AAA_30
SLFN-g3_helicase
ResIII
nSTAND3
PhoH
DEAD
AAA_16
AAA_22
NPHP3_N
AAA_25
AAA
LAGLIDADG_WhiA
AAA_5
BAR_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115888622
NCBI-ProteinID:
XP_030764247
UniProt:
A0A6J2YJN7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1984 aa
AA seq
DB search
MGDFNSRKNVNEYSRNPGRTNVRSFGNGASWRPGDRNTAGSSGFNRNNDRRLNQKPSYTN
RPERSMGLRYIEDLLNLDPKAIVFKLSDDKNGFLKLLANKSISNDLIILILKLTHKVCEV
SFNDVKIKLLTNVLRSHFMDKLNSYISSISHQSSVEKNDNSYFWENTENFYKNLLLLATT
VHEMIPSYSENIYRILTTLNVFIPLIEEQHAMHISDGIKGSLKHLLFVLKKDIECLQRKP
SQKDKIVVDELEPPDDFRKIAVVPTAKEILMEESPYLRANIINGAYKNYDHYLDIQFRLL
REDFVSPLRRGIQNFLFNEDKEKQERRKLENIRFYKNVMFLNAEPINENYCYKVQFDFSK
KNTSSFENSKRFMFGSLICFTNDNFQTLLFGKVVERDVNLLNGGIVVIGFESNVNIDFKT
TYLMIESSIYFEPYFHVLNVLKKMNGNNFPMEKYIIRVETNVKPPKYLLQTTSVFYKIDG
TNVSPLNFPVDKSFYNFNDSQMKAFKAALTEEFCIIQGPPGTGKTFLGLKIAHTLLYNHT
AWYKNSPILVICLTNHALDQFLEGILPFTEDIIRVGGQSKNQQLKKFNLAHRRTRHAESG
WSAVSYKYLQFRKHEVNVYMDVLKSIKRLLDQIASKDAIIDFRNFRVIEDFNDTWFAEHL
EEDDILQWLLEGKRINPLKRTTPLVMGTAQKMSNNENEVDNLYASDDDDRRIALDALMAE
FDKFGDIEKETCFIPEPLLCLKELKEELTALDATLNLIKKCPESTSESVIKIEQLEAEIY
DIQSTIEYLETHLSNYSYQRDRRMPPLVNLQHPESVPPARRWLIYFYYLDKLRDHLRDTY
KVVTIKYQEAFRIYNDLRQMEDARIMENCRLVGMTTTGAARLRSTIQSLKNPIVIVEEAA
EVLEAHIIAALTQNCQHLILIGDHLQLKPGAADFEIETKYKLGVSLFERMVNNNIQCYTL
NVQHRMKPEISSLIKPTIYKDLEDHESTLQRDPILGVEKCLYFINHDKPESECQDQSKKN
THEATFLIALARHLILNGYEPEQITILAAYLGQMFDMLNEIEKPHNAMFLKNVRVAVLDN
YQGEECDIILLSLVRSNEENKAGFLKIQNRVCVALSRARNGLYIIGNMNLFLNSNSQNQI
WGKVNEALQSQNAIGDSLTLQCQIHPHNFTQVRSAEDFEIISEGGCSLPCNTLLACEHYC
KRTCHVGDRDHAQFQCNDPCRLLLCDNSEHTCKKRCYEDCGPCHYPVERHLNCGHSVTIA
CHINPDTYKCPELVPTKLPCNHETDKPCSSDPITFPCPYPCNIRVDSCGHTCQRNCHIRK
DPDHLKYTCRSPCALPKVGCTQDEKHMCTFLCYSPCEECIVPVRRERSCGHVFLKIPCNT
IVEDIFCEKKCKKMLACGHPCKSECSAPCGPCLVEVEKEIPVCGHRVTLKCSEEPLQKHC
QNRICPRLLPCGHKCKNVCRSSCTEECTEIIECNIQSPCGHEMKTTLCYLTDKYSPSDLL
SVCPSPCEIKLKCGHQCTGTCGTCKQFRIHKRCAERCGVPLVCDHECPIPCRQACKPCTR
PCELKCLHNRCNRECGEPCVPCKEICPRQCPHVRCNKKCGDICNVDPCIERCSKTLRCGH
QCVGFCGDLCPKLCKICNEEELTEIFLGNEDEPEAIYVMLRDCGHIFEHTDLENWLKTDE
DQIKYKVCPKCKTSITTTQRYSNYIKMTLKDIVEVKLKCLGDETSNEDLRLTIKNRLNLL
KYQYVPLRRIDSNSLTELFTMLEERLKPVRNDRRQPIGLTELNAVKSKIQILSDIKVIFK
DRHIRYTPEEITQLDIILQVLLRSQDDVTDQEIDDLGNEICRLNRIAQYQSIVTNSSFAN
NPDIQSLSENIKEVVFANSRYTKEIDTALAINLKSLSEKVGSVVNITDAERTEIVKAMGM
AKGHWYKCPNGHPYVIGECGGANQIATCFCGAQIGGTDHHLLRSNAHAGEMDGSERHAWP
GGLY
NT seq
5955 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtgattttaattctaggaaaaatgttaatgaatatagcagaaatccaggaagaaca
aacgtacgatcttttggcaacggagcatcttggagaccaggcgataggaatactgccgga
agctcaggatttaatcggaataatgacagacgtttaaaccaaaaaccatcctatacaaat
cggccggaaagaagcatggggcttagatatatagaagacttgctgaatcttgatcccaaa
gctatagtatttaaattgtcagatgataaaaatggttttttaaaacttctagctaataaa
tcaattagcaatgatttgatcattttaatcttaaaattgacacacaaagtttgcgaagtc
tcttttaatgatgtaaaaattaaacttttaactaacgtattacgtagtcatttcatggat
aaacttaactcttatataagttccatatcacatcagtcttcagttgagaaaaacgacaat
agttatttttgggaaaatactgaaaatttctataagaatttgttattgttagcaacaact
gtacatgaaatgattccttcatactctgaaaatatatatcggatattaactactcttaat
gtctttatacctttaattgaagaacaacatgccatgcatatatccgatggtattaaagga
tcactgaaacatttgttatttgttttaaagaaagatatagagtgtttgcaaagaaaacct
agccagaaagataaaatagtggtggatgaacttgaaccccctgatgacttcagaaaaatt
gccgtcgtaccaacagctaaagaaattttaatggaagaatcaccatacttacgtgcaaac
attattaatggagcttataaaaattatgatcactatttagatatccagtttaggttatta
cgtgaagattttgtatctccattacgtagaggaattcaaaattttttatttaacgaggat
aaggaaaaacaagaacgaagaaaattggaaaacataaggttttataaaaatgtcatgttt
ttgaacgctgaaccgatcaacgagaactactgttacaaagttcagtttgattttagcaaa
aaaaatacatcttcatttgagaactcaaaaagatttatgtttgggtctttaatatgtttc
acaaatgacaattttcaaacactactatttggaaaagttgttgaaagagacgtcaacctt
ttaaatggcggtattgtagttattgggtttgagtccaacgtaaacatcgattttaaaact
acttatttgatgatagaaagtagtatttattttgaaccatattttcatgtgctcaatgta
ctgaaaaaaatgaacggtaacaattttcctatggaaaaatacataataagagtagagaca
aatgtcaaacctcccaaatatttattgcaaactacttcagtgttttataaaattgatggt
acaaatgtatcgcccttaaattttccagttgataaatcgttctataattttaatgattca
cagatgaaagcattcaaagctgctctaactgaagaattttgtattattcaaggaccacct
ggaacaggaaaaacgtttttaggtcttaaaatagcccatacgttattgtacaaccatacg
gcatggtataagaattcaccaatactggtcatttgcttaacaaaccatgctttggatcaa
tttcttgaaggaatacttccatttaccgaagacataataagagtgggaggacaatctaaa
aaccaacaactgaaaaaatttaatttggcgcatagacgtaccaggcatgcggagtcgggt
tggtcggctgtttcttacaagtacttgcaattccgcaaacacgaagttaacgtttatatg
gatgtgttaaaatcaattaaacggttattagatcaaattgcttccaaagatgctataata
gattttcggaactttcgggttattgaagatttcaacgacacctggtttgcagagcattta
gaagaagatgatattttgcaatggttattggagggaaaacgtataaaccctttaaagaga
actactccgttagttatgggaactgcacaaaagatgtcaaataacgaaaatgaagtagac
aatctatatgcttctgatgacgatgaccgtagaattgcacttgacgcattgatggccgag
ttcgataaatttggtgatattgaaaaagagacctgttttataccagagcctttgctttgt
ttgaaagaactcaaggaagagttgacggcattggatgcgaccttaaatttaattaaaaaa
tgccctgagtctacttcagaatcagtgattaaaattgaacagctcgaagctgaaatttat
gacattcaatcgactattgagtatttggagactcatttaagtaactattcatatcaaaga
gatagaagaatgccaccgttggttaatttacaacatccagaatctgtgccaccagctaga
agatggctaatttatttttattatttggataagctcagagatcatttaagggatacatat
aaagtagtgacaatcaaatatcaagaggcttttcgaatttacaacgatctacgacagatg
gaagatgctcgcataatggaaaattgtcgtctggtaggtatgaccacaacaggagcagcc
cgattacgtagcaccatacagtccctcaaaaatcctattgtaatagtggaagaagcagcg
gaagttttagaagctcacattattgcagcactaacacagaattgtcagcatcttatatta
ataggtgaccatcttcaacttaaaccaggagccgctgattttgaaattgaaactaaatac
aaattgggtgttagtttgtttgaacgaatggttaacaataacattcagtgttacacttta
aatgtccagcatcgtatgaaaccggaaatatcaagtcttattaaaccaactatttataaa
gatttggaagatcatgaatctaccttacaaagagatcctattttgggagtcgaaaaatgc
ttatattttattaatcatgataaacctgaaagtgaatgtcaagatcaaagtaagaagaat
actcacgaagcaacatttttaattgcactagcgcgacatttaatattaaatggttacgaa
ccagaacaaataacaatcttagcagcttaccttgggcaaatgtttgatatgttgaacgaa
atagaaaaaccgcataatgcgatgttcctaaaaaatgttagagttgctgttttagataat
taccaaggtgaagaatgtgacataatacttctctcgttggtaagaagcaatgaagaaaat
aaagcaggttttttaaaaattcaaaatcgagtttgtgtagctctgtctagagcaagaaat
ggactatacattataggaaatatgaacttatttttaaattctaacagtcaaaaccagatt
tggggtaaagtaaatgaggcccttcaaagtcaaaatgctataggcgattcactaactttg
caatgccaaatacatcctcacaattttacccaagttagatcggcggaagactttgaaata
atttctgaaggtggatgcagtctcccgtgtaatactttgttggcttgtgagcattattgt
aaacggacatgccatgtgggagatcgggaccatgctcagttccaatgtaatgacccttgc
cgcctattattatgtgataattctgaacacacctgcaagaaaaggtgttatgaagattgc
ggaccttgtcattatccagtagagcgtcatttgaattgtggtcactcagttacaattgca
tgtcatattaacccagatacttataagtgtcctgaattagtacctacgaagcttccatgt
aatcacgaaacagataaaccatgctcatcagatccgataacgtttccttgtccttatcca
tgcaatataagagtagactcatgtggacatacatgtcagaggaactgtcatatcagaaag
gatccagatcatttgaagtatacgtgcagaagtccctgtgctttgccaaaagttggctgt
acacaagacgaaaaacatatgtgtacatttttgtgttattcgccctgtgaagaatgcatt
gttcctgtaaggagagagcgctcatgtggacacgtattcttaaaaataccttgtaacacg
attgtagaagatattttttgtgaaaaaaaatgtaagaaaatgctggcttgtggtcatcct
tgtaaaagcgaatgcagtgctccctgtggtccatgtttagttgaggttgagaaagaaatt
ccagtatgcggacatagagttacattgaaatgttcagaagaacctttgcaaaaacactgt
cagaaccgtatatgtccaagattgttaccgtgtggtcataaatgcaaaaatgtttgtaga
tcttcctgtacagaggaatgcacggaaataatagagtgtaacattcagtctccttgtgga
catgagatgaagacaactctgtgctatttgacagacaagtattcgccatccgaccttctt
tcagtatgtccatctccatgcgaaattaaactgaagtgtggtcatcagtgtacagggact
tgtgggacgtgtaagcagtttcgcattcataagaggtgtgctgaaaggtgcggtgttcct
ttagtatgcgatcatgaatgtccaataccatgccgacaggcctgtaaaccttgcactaga
ccatgcgaattaaaatgtttgcataatagatgtaatagagagtgtggtgaaccttgtgtt
ccatgtaaagagatatgcccaagacaatgcccacatgtgaggtgcaacaagaagtgtgga
gatatttgtaatgtagacccctgcatagaaaggtgttccaaaactctccgttgtggtcat
caatgcgttggtttctgcggcgatctatgtccaaaattgtgcaaaatttgtaatgaggag
gaattgacagaaatatttcttggaaatgaagatgaacctgaggcaatatacgtcatgcta
agagattgtggtcatatttttgaacataccgatttagaaaattggttaaaaacagatgaa
gatcaaattaagtataaagtttgccctaaatgtaagaccagcattaccacaacacaaaga
tacagcaattacataaaaatgactctaaaagatattgttgaagttaaactgaaatgtttg
ggcgatgaaacgtcaaatgaagaccttaggttaaccattaaaaaccgacttaatttgtta
aaatatcagtatgttccactacgtagaatagattccaattctctaactgaactgtttact
atgctagaagagcgtttgaaacctgtaagaaatgatcgaagacaacctataggcctaaca
gaacttaatgcagtaaaatctaaaatacagatattatctgacattaaagtgatttttaaa
gatcgacatatacggtacactccagaagaaattacacagttagacattattctgcaagtt
ctgttacgatcgcaagatgacgtaaccgatcaagaaatagatgacctaggaaatgaaatt
tgtagattaaacagaattgctcaatatcagagtatagttacaaattcaagctttgcaaat
aatcccgatattcaatctttatcagagaatattaaagaagtcgtttttgcaaattctaga
tacaccaaagagattgatacggctttggccattaatttgaaaagcctgtctgaaaaagta
ggatctgtagtcaatattactgatgctgaacggacagaaatagttaaagctatgggcatg
gctaaaggacattggtataaatgtcctaatgggcatccttacgttataggcgagtgtgga
ggtgccaatcagattgcaacttgtttttgtggtgcccagataggaggcactgaccatcac
cttttacgtagtaacgcccatgctggtgaaatggatggttctgagcgtcacgcctggcct
ggtggtctttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
