Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_131929
Help
Entry
SPAPADRAFT_131929 CDS
T03101
Name
(RefSeq) guanine nucleotide exchange factor
KO
K20476
RAB6A-GEF complex partner protein 1
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
SPAPADRAFT_131929
Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
Rab associated proteins
SPAPADRAFT_131929
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RIC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18869622
NCBI-ProteinID:
XP_007372202
JGI:
131929
UniProt:
G3AEY6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MVWINGCPQFSIDSPITHEDIIQIIHIPHTPLVTILTPTSVYIFHQFTLLPLTSHVRSPT
SIENNGKNLELKVKHVSVNTSKFQKLNTVNLFIQTDSNYLIIYQCQINYSKSLYEVHNSN
NELIQTGLPLSDTSLKFSLSGLIKSATKSIIHGNEESLVNLENIESINNASLEDELGNSA
IEFVKISIFKILKIGIKLQNFWLQQNSHYLIIFNNNNTDSEDKTEDSRFQVVNIFNFKTD
LFQSSEFSWYKQNSKITYIKFNVFFNYFLFVNRRNELWIMEFDKENKEITTKGHKLLIFE
EEEELTNIQFWFNPQCQLIIIRVNHELRMYKMEQNTIELLKVLDENASPNLVINWSPCGA
YFVITNPNTGYWKLCSKFGNVTFNSEETLQELDDHPEENRKFLKASIISISGNAMNLYLL
SHDKSKLFFINLVRIISDAQRGLLYDNEYISIIQNNRNLIRFPILPKFKKFLSNQEIYNG
NINKSIKSATGKFSLARNDFNQISISYGDCLSVSTPYCSGDDKINHILWFNFKSYFAESM
NIVKHFWFKDYLLVVNRKSKHAFTDDDNPNSVDSNDHLVDEFIVFDTSSTRYGMGGEDIS
FNSDSLLWKYDFKTTFVDIQIGTDVQDKQTCHVVIVTSDYRLIVLDLTMDKTITIKNDET
KFYKIFISVRKTILLSSIKNKVNLDDVIQTSMVNNRHFLFLLDTGDLYLLKNQQSNRQGS
VISNSSMHSGGSTGGNNLYDLIKLNVNIEFFKFKTIRFNKSSIIDFIYLFNSEHILIYDI
NELIDKSYDKSIQTAPQTRDMLIGDDYDDELHPILIESQGMHPIKLDSILEIGQDTYKSL
DLIGLESFAIYKQTTGGLLIKNRVAHKLILNNFIEFDLLHKGDLESSFYKYKQFKNFHYC
LELLLFKNLTLNQSLKRLCQLIEFTDNAEYIYINCLRKIEADYWPRFFDVLETTPVKFMN
RLIEIDNVELCYNYLIIYLNYKTEDETKKDQLNSDDIQVILKIIKMLDKSGRWDWCFELC
RFIKLLEPTGNLLVKIQQELSQ
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatggatcaatggttgtccccagtttctgatagattcccccataacacatgaagat
atcatccaaatcattcatatcccccacacaccacttgttaccattctaacacctaccagt
gtatatatattccatcaattcacattacttcccttaacatcacatgtcagatctccaaca
agtatagagaacaatggtaagaatctagaacttaaggtaaaacacgtaagtgtcaacact
agcaaatttcagaaattaaacaccgttaatttattcattcaaaccgattcaaactacttg
attatatatcaatgtcaaattaattattccaagtctttatatgaggtacataattccaat
aacgagctaattcaaactggattacctttgagtgatacatcgcttaagttttccttatct
gggttaataaaatcagcaacaaaatcaattattcatggtaacgaagagtccctagttaat
cttgagaatattgaaagcataaataatgccagtttagaagacgaattgggtaattctgca
attgagttcgtcaagatttccatttttaagattttgaaaattgggatcaaattacaaaac
ttttggctacaacaaaactcccactatttgataatattcaacaataacaacactgattct
gaagataaaactgaagattctcgattccaagtggtcaatatattcaacttcaaaactgat
ttatttcagtcaagtgaattcagctggtataaacaaaactccaaaattacttatataaaa
ttcaatgtatttttcaactatttcctttttgttaatagaaggaatgaattatggattatg
gaatttgataaagaaaataaagaaataacaaccaagggtcacaaattgcttatctttgaa
gaagaagaagaattgaccaatattcaattctggtttaatcctcaatgtcaattaataatc
atccgagttaatcatgaattgaggatgtataaaatggagcaaaatacaattgaactctta
aaagttctagatgaaaacgcgagccctaatttggtgatcaattggtctccttgtggtgct
tactttgtcattacaaatccaaatacaggatattggaagctatgttcaaaatttggaaat
gttaccttcaatagtgaagaaactttacaagaattggatgatcatccggaagaaaatcga
aagtttttaaaagcatcaattatatctatttccggaaatgccatgaacttgtatcttttg
agtcatgacaagtcaaagcttttctttatcaatctagtaagaattatcagtgatgcgcag
cgtggattactttatgacaatgaatatatcagcataattcaaaataaccgaaacttgatt
agattcccaatattgcctaaatttaagaagttcttatcgaatcaagaaatttacaacggc
aacatcaacaaatcgattaaaagtgctacagggaaatttagccttgctcggaatgatttc
aatcaaatttccatatcatatggtgattgcttaagtgtgtctacgccttattgttctggt
gatgataagatcaaccacatactttggtttaacttcaagagttatttcgccgaatccatg
aatatagtgaagcatttttggtttaaggattatttactagtggttaaccggaaatctaaa
catgcatttactgatgatgataatccaaatagtgtcgattcaaatgatcatttggttgat
gaatttattgtgtttgatacctcgtcaactagatatggtatgggtggagaagatatcagt
tttaatagtgattcattgctttggaagtatgactttaaaaccacgtttgttgatattcag
attggtacagatgttcaggataaacaaacatgtcatgttgttatcgttactagtgactat
cgattaattgttcttgatttaactatggataaaacaataaccatcaagaatgacgaaact
aaattctacaagatttttatcagtgtccggaaaacaatcttgttatcttccataaagaat
aaggttaatttggatgatgttattcaaacaagtatggtcaacaatcgtcatttcttgttt
ttattggatactggtgatttataccttttgaaaaaccaacagctgaatagacaagggtca
gttatcagtaatagctctatgcattcaggaggaagcacaggggggaataacttgtatgat
ttgattaaattgaatgttaatattgaatttttcaaatttaaaacaattagatttaacaaa
tcttcaattattgatttcatatatttattcaacagtgaacatatcttgatttatgatatt
aatgaattgattgacaagtcatatgataaaagtatccagacagcacctcagactagagat
atgcttataggtgacgactacgatgatgaacttcatccaatactaatagaaagtcaagga
atgcatccgattaagttggattcaattcttgaaattggccaagacacgtataagtccctt
gatttgattggtttggagagttttgctatatacaagcaaacgacaggaggattacttatt
aagaatagagtggctcataaattaatccttaacaattttattgaatttgatttacttcat
aagggagatttagaaagttcgttttataaatacaaacaatttaagaatttccattactgt
cttgaattattattgtttaagaacttaactttgaatcagtccttgaaaaggttatgtcaa
ttgatcgaatttactgataatgctgaatacatttatataaactgtttaagaaagatcgaa
gctgattattggccgagattcttcgatgtgttagaaacaactccagtcaaattcatgaat
aggttgattgaaattgataatgttgaattgtgttacaattacttgatcatttatctcaat
tacaagaccgaagacgaaaccaaaaaggatcagttgaattcagatgatattcaagtcatt
ctcaagattattaaaatgttggataaatctgggagatgggattggtgttttgaattatgt
agatttataaaactattagaaccaactgggaacctccttgttaaaatacagcaagagctt
tctcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
