KEGG   Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_132561
Entry
SPAPADRAFT_132561 CDS       T03101                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14312  nuclear pore complex protein Nup155
Organism
spaa  Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa03013  Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:spaa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    SPAPADRAFT_132561
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:spaa03019]
    SPAPADRAFT_132561
Messenger RNA biogenesis [BR:spaa03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     SPAPADRAFT_132561
SSDB
Motif
Pfam: Nucleoporin_C Nucleoporin_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 18869669
NCBI-ProteinID: XP_007372740
JGI: 132561
UniProt: G3AGI9
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1446 aa
MNISASNGSGTSNGTGVRGLPRDAKFITPSLKLKDQVPDSVQFHQDRNIDTTSARGQLSR
RFVQPLGFESKEVNYKINVPDFANIPPLQLGGKFIADLNRIDSITPHDIFYSETVSKTES
GGLDNYYFDYENGLKDFSRFEKVSQLDLPDRFFEEYNSTECITKIGLFPEIERTWIAIDN
KLVFWNYNLPQSSFNTSTQFLTIDQIRHTILTVKLVRPKKGIFLEEINYLLLVSTTVDIN
IFLVKYDKALNNLEIFNPDLSVSTQGLIVNNFTINSKTNDIYFSGEGDGVNIWRLDYSNK
SSFIKNKCDKICLTKGGLSSVIPSKIPGLDLFNQGATTTNSSTSTNENDATVPESIVQLQ
VDGERDILYSLSNKSVIRVYKLQPKQEQITEGSRLTPSQIFKSASSIFVDASNFKVFERF
KIIAIHCISPQESTSIQLIAITSNGCRMLLKLGSTSSFGSLLSTPFSALNALKLNLVNIK
FPPSREIPKINTELDSFTRDRQYLSQLIANQQKSQLLKNTKIAKIISPGVFICVKKTKRS
DKLFIATSNYGYLKKNNKLVEDAEFVKYVSHEDAPFTYIQDIIQLTPSMNATNTPNGYAN
ISASQYTKQPLKFAVLTNFGIVIYQFKTSDQIIKSLKEEVIENFIEENGYEETCSTLLYL
ACSYGHYNSNDLFKRKAQILFSSCGNNARLTDNSQQLGGGPQVTSLVPHHQQLANISSNL
HPTVDQVVLSDRFYGTCLLIARLLRDFWDKKVFNPLEYIKTTPSGDIEVASIKEGNLIIK
GLNIDKKQIEYFIGSIIVLIDFFMENGTNIQGLNAPNYSSDPNQFENEVCLRAEHIAFTS
IIKCLNSMKEALSFLMVLIEEIQINQSNFNEILQFLSLTNQANLLCLTFKDLLLPNRDVK
NLVKDLLSSIINKNILKGGSIDLIASSLQTRCGSFCSTNDVFIFKAIENLTRAKKINSRD
PDLKNKCLTNAVLLFEEAYDSLTLENIENSINIMLDLQFYAGGVGMLLNIAQKLGSNVKS
AAATTSLALTEDNSVKNNQEAIEISKKKTDLYNLVFNILTKVDLKASQITETSNQVLINE
FLEIRDSAYKTCFASQDKEFHYAFYEWFIKQGVNDRLLEINTPFILPFLEEKSENNLVLS
DLLWLYHAKRENYFDAAKILYALSVSEFKLELNQRIEYLSRANGFCSCVCPPNLRQKMIQ
LSAVIQELFDVANVQLDILTRIKADSRISSENKQIAVDSLNFKILTITDLFNNYTDPLGY
YDLCLLIFKISDYKNTDDILKRWELFFDKLYHEYLVEKKGKETFYILLNDAFVSYGARLS
SNDLVFPIDELIKLISKYIQEAIEENPVTQKPPRGIVVDMFIKCGVSYERLYYVMKSLIE
HNTFEIYSGFTNDLRKNEMTYLIKKWYTNDKKLRELIPNDKIANLQEYTLEQDPINEFTN
HGQYVS
NT seq 4341 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatatactggcttcgaatggttctggtacttccaacggtacaggagtcagaggatta
ccacgtgatgccaagtttattacacctagtttgaagttgaaggaccaagttcctgattct
gttcaattccatcaagatagaaatatagatacaacatcagccagaggtcaattatcaaga
cgatttgttcaaccattaggatttgaatctaaggaagttaactataagattaatgttcct
gattttgccaatatccctccgctacaattaggtggtaagttcatcgctgatttaaataga
attgattcaattactcctcatgatattttttattctgaaactgttagtaaaactgaatct
ggtggattagacaattattactttgattatgagaatggattaaaagatttctcaagattt
gaaaaagtgagtcaattggatttgcccgacagattctttgaagagtataactccactgag
tgcataaccaaaataggattgtttcctgaaattgaaagaacatggattgctattgataat
aaattagtgttttggaattataatcttccacaatcttcattcaatacatcaacccaattc
ttaactatagaccaaattagacataccattttaactgtgaagttggttagacctaaaaaa
ggaattttccttgaagaaattaattatttgttattggtatctactacagttgatatcaat
attttcttggttaaatatgataaagcattgaataatttggaaattttcaatccagactta
tcggtttccactcagggcttaattgttaataactttaccataaattcaaaaaccaatgat
atttactttagtggtgaaggtgatggtgtcaacatttggcgtttggattattccaacaag
tcaagctttattaagaataaatgtgataaaatatgtttaaccaaaggtggattatcaagt
gttataccaagtaaaatacctggacttgatttgtttaatcaaggtgccacaactaccaat
agtagtaccagtacaaatgaaaacgatgccactgttcctgaaagtattgttcaattacaa
gtggatggtgaacgagacattttatactcgttgtccaacaaatcagtcattagagtttac
aaacttcaaccaaaacaagagcaaatcactgaaggtagtagattaaccccaagtcaaatt
ttcaaatctgcttccagtatttttgttgatgccagtaattttaaagtatttgaaagattt
aagattattgcaattcattgtatttcacctcaagaatcaacatccatacaattgattgca
atcactagtaatggatgtagaatgctattaaaacttggatcaacttcaagttttggatca
ttactttccacgccattctcggcccttaatgcattaaaattgaatctagtcaacattaaa
ttccctccatcaagagaaatccccaagattaatactgagcttgattcgtttacaagagat
agacaatatttatcccaattaattgccaatcaacaaaaatctcaattgttgaaaaatacc
aaaattgccaaaattataagtcctggtgttttcatttgtgttaaaaagaccaagagatcg
gataagttgttcattgcaacttcaaattatggatatttgaaaaagaataataaattagtt
gaagatgctgaatttgttaaatatgtcagtcatgaagatgctccatttacctatattcaa
gatattattcaattgacaccatccatgaatgctaccaacactcctaatggatatgctaac
atttctgccagccagtatactaaacagcctttgaagtttgctgtattgaccaattttggt
attgtcatatatcaatttaaaacatctgatcaaattattaaatcattgaaggaagaagtt
attgagaatttcattgaagaaaatggatatgaagaaacttgttctactttgttatacttg
gcatgttcttatggccattacaactcaaatgatcttttcaaaagaaaagctcagattttg
ttttcatcttgtggtaataatgcccgattaactgataattctcaacaattggggggtggg
ccacaagtcactagtttggtgccacatcatcaacaattagccaatatcagttctaatctt
catcctactgtagatcaagttgttttaagtgatagattctacggaacttgtttattaatt
gcaagattacttcgtgatttctgggacaagaaagtgttcaatccgttagagtatatcaag
actacaccaagtggagacattgaggttgccagtattaaagaaggaaatcttataattaaa
gggttaaatattgacaagaaacaaattgaatattttattggatccattattgttttgatt
gatttctttatggaaaatggaacaaatattcaaggattgaatgcaccaaattatagttct
gatccaaaccaatttgaaaatgaggtttgtcttagagcggaacatattgcatttacttct
attattaaatgtttgaattcgatgaaggaagccctttcgttcttgatggttttaattgaa
gaaattcaaattaaccaatctaacttcaatgaaattttacaatttttatcattaactaac
caagccaatcttttgtgtttaacttttaaagatttattattgcctaatagagatgttaag
aatttggttaaggatttgttgtcttctattattaataagaatatattaaaaggtggatct
attgatttaattgcatcttcattacaaaccagatgtgggtctttctgttctaccaatgat
gtatttatattcaaagctattgaaaatttaactagagccaagaagattaattcccgtgat
cctgatttaaagaataaatgtttaaccaatgcagtattactatttgaagaagcttatgat
tcattgactttggaaaacatcgagaactcaattaatattatgttggatttacaattttat
gctggtggtgtaggaatgttgttgaatattgcccaaaaacttggatctaatgttaaatca
gcagcagcaactactagtcttgcattaactgaagataattctgttaagaataaccaagaa
gcgatcgaaatttccaaaaagaagactgatttgtataatttggtgtttaacattcttact
aaggttgatttaaaggcttcacaaattactgaaactagtaaccaagttttgattaatgaa
ttcttggagattagagattctgcttataaaacatgttttgcatctcaagataaggaattc
cattatgcattttatgaatggtttattaaacaaggtgttaacgataggttgttggagatt
aataccccatttatattacctttcttggaagagaaatcggaaaataatttggtattgagt
gatttgctttggttatatcatgccaagagggagaattatttcgacgccgctaagatcttg
tacgcattgtctgtgtctgaatttaaattagaattgaatcaaagaatcgaatacctttcc
agggctaatgggttctgtagttgtgtttgtccacccaacttgagacaaaagatgattcaa
ctctctgcagtcatacaagaattatttgacgttgccaatgttcagttggatatcttgaca
agaatcaaggccgattcaagaatcagttctgaaaataagcaaattgctgttgattcattg
aattttaagattttgactataactgacttgttcaataactatactgatccattgggttat
tatgatctttgtttactcattttcaagatttctgattataagaataccgatgatattttg
aaaagatgggagttattctttgataagttgtaccatgaatatttggttgagaagaagggc
aaggaaactttctatattcttttaaatgatgcatttgtatcatatggagccaggttatct
tctaatgacttggtttttccaattgatgaattaatcaagttgattagtaaatatattcaa
gaagcaattgaagagaacccagtaactcagaagccaccaaggggaatagttgtcgatatg
tttattaaatgtggagtttcatatgaacggttatactatgttatgaaatcattaattgaa
cataacacgtttgaaatttattctgggttcactaatgatttgagaaagaatgaaatgaca
tacttaattaagaaatggtatactaatgataagaaattacgagaattgataccaaatgat
aagattgccaatttgcaagagtacacccttgaacaggatcctatcaatgaatttacaaac
catggtcaatatgtttcatag

DBGET integrated database retrieval system