Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_132561
Help
Entry
SPAPADRAFT_132561 CDS
T03101
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14312
nuclear pore complex protein Nup155
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
SPAPADRAFT_132561
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
SPAPADRAFT_132561
Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
SPAPADRAFT_132561
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_C
Nucleoporin_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18869669
NCBI-ProteinID:
XP_007372740
JGI:
132561
UniProt:
G3AGI9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1446 aa
AA seq
DB search
MNISASNGSGTSNGTGVRGLPRDAKFITPSLKLKDQVPDSVQFHQDRNIDTTSARGQLSR
RFVQPLGFESKEVNYKINVPDFANIPPLQLGGKFIADLNRIDSITPHDIFYSETVSKTES
GGLDNYYFDYENGLKDFSRFEKVSQLDLPDRFFEEYNSTECITKIGLFPEIERTWIAIDN
KLVFWNYNLPQSSFNTSTQFLTIDQIRHTILTVKLVRPKKGIFLEEINYLLLVSTTVDIN
IFLVKYDKALNNLEIFNPDLSVSTQGLIVNNFTINSKTNDIYFSGEGDGVNIWRLDYSNK
SSFIKNKCDKICLTKGGLSSVIPSKIPGLDLFNQGATTTNSSTSTNENDATVPESIVQLQ
VDGERDILYSLSNKSVIRVYKLQPKQEQITEGSRLTPSQIFKSASSIFVDASNFKVFERF
KIIAIHCISPQESTSIQLIAITSNGCRMLLKLGSTSSFGSLLSTPFSALNALKLNLVNIK
FPPSREIPKINTELDSFTRDRQYLSQLIANQQKSQLLKNTKIAKIISPGVFICVKKTKRS
DKLFIATSNYGYLKKNNKLVEDAEFVKYVSHEDAPFTYIQDIIQLTPSMNATNTPNGYAN
ISASQYTKQPLKFAVLTNFGIVIYQFKTSDQIIKSLKEEVIENFIEENGYEETCSTLLYL
ACSYGHYNSNDLFKRKAQILFSSCGNNARLTDNSQQLGGGPQVTSLVPHHQQLANISSNL
HPTVDQVVLSDRFYGTCLLIARLLRDFWDKKVFNPLEYIKTTPSGDIEVASIKEGNLIIK
GLNIDKKQIEYFIGSIIVLIDFFMENGTNIQGLNAPNYSSDPNQFENEVCLRAEHIAFTS
IIKCLNSMKEALSFLMVLIEEIQINQSNFNEILQFLSLTNQANLLCLTFKDLLLPNRDVK
NLVKDLLSSIINKNILKGGSIDLIASSLQTRCGSFCSTNDVFIFKAIENLTRAKKINSRD
PDLKNKCLTNAVLLFEEAYDSLTLENIENSINIMLDLQFYAGGVGMLLNIAQKLGSNVKS
AAATTSLALTEDNSVKNNQEAIEISKKKTDLYNLVFNILTKVDLKASQITETSNQVLINE
FLEIRDSAYKTCFASQDKEFHYAFYEWFIKQGVNDRLLEINTPFILPFLEEKSENNLVLS
DLLWLYHAKRENYFDAAKILYALSVSEFKLELNQRIEYLSRANGFCSCVCPPNLRQKMIQ
LSAVIQELFDVANVQLDILTRIKADSRISSENKQIAVDSLNFKILTITDLFNNYTDPLGY
YDLCLLIFKISDYKNTDDILKRWELFFDKLYHEYLVEKKGKETFYILLNDAFVSYGARLS
SNDLVFPIDELIKLISKYIQEAIEENPVTQKPPRGIVVDMFIKCGVSYERLYYVMKSLIE
HNTFEIYSGFTNDLRKNEMTYLIKKWYTNDKKLRELIPNDKIANLQEYTLEQDPINEFTN
HGQYVS
NT seq
4341 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatactggcttcgaatggttctggtacttccaacggtacaggagtcagaggatta
ccacgtgatgccaagtttattacacctagtttgaagttgaaggaccaagttcctgattct
gttcaattccatcaagatagaaatatagatacaacatcagccagaggtcaattatcaaga
cgatttgttcaaccattaggatttgaatctaaggaagttaactataagattaatgttcct
gattttgccaatatccctccgctacaattaggtggtaagttcatcgctgatttaaataga
attgattcaattactcctcatgatattttttattctgaaactgttagtaaaactgaatct
ggtggattagacaattattactttgattatgagaatggattaaaagatttctcaagattt
gaaaaagtgagtcaattggatttgcccgacagattctttgaagagtataactccactgag
tgcataaccaaaataggattgtttcctgaaattgaaagaacatggattgctattgataat
aaattagtgttttggaattataatcttccacaatcttcattcaatacatcaacccaattc
ttaactatagaccaaattagacataccattttaactgtgaagttggttagacctaaaaaa
ggaattttccttgaagaaattaattatttgttattggtatctactacagttgatatcaat
attttcttggttaaatatgataaagcattgaataatttggaaattttcaatccagactta
tcggtttccactcagggcttaattgttaataactttaccataaattcaaaaaccaatgat
atttactttagtggtgaaggtgatggtgtcaacatttggcgtttggattattccaacaag
tcaagctttattaagaataaatgtgataaaatatgtttaaccaaaggtggattatcaagt
gttataccaagtaaaatacctggacttgatttgtttaatcaaggtgccacaactaccaat
agtagtaccagtacaaatgaaaacgatgccactgttcctgaaagtattgttcaattacaa
gtggatggtgaacgagacattttatactcgttgtccaacaaatcagtcattagagtttac
aaacttcaaccaaaacaagagcaaatcactgaaggtagtagattaaccccaagtcaaatt
ttcaaatctgcttccagtatttttgttgatgccagtaattttaaagtatttgaaagattt
aagattattgcaattcattgtatttcacctcaagaatcaacatccatacaattgattgca
atcactagtaatggatgtagaatgctattaaaacttggatcaacttcaagttttggatca
ttactttccacgccattctcggcccttaatgcattaaaattgaatctagtcaacattaaa
ttccctccatcaagagaaatccccaagattaatactgagcttgattcgtttacaagagat
agacaatatttatcccaattaattgccaatcaacaaaaatctcaattgttgaaaaatacc
aaaattgccaaaattataagtcctggtgttttcatttgtgttaaaaagaccaagagatcg
gataagttgttcattgcaacttcaaattatggatatttgaaaaagaataataaattagtt
gaagatgctgaatttgttaaatatgtcagtcatgaagatgctccatttacctatattcaa
gatattattcaattgacaccatccatgaatgctaccaacactcctaatggatatgctaac
atttctgccagccagtatactaaacagcctttgaagtttgctgtattgaccaattttggt
attgtcatatatcaatttaaaacatctgatcaaattattaaatcattgaaggaagaagtt
attgagaatttcattgaagaaaatggatatgaagaaacttgttctactttgttatacttg
gcatgttcttatggccattacaactcaaatgatcttttcaaaagaaaagctcagattttg
ttttcatcttgtggtaataatgcccgattaactgataattctcaacaattggggggtggg
ccacaagtcactagtttggtgccacatcatcaacaattagccaatatcagttctaatctt
catcctactgtagatcaagttgttttaagtgatagattctacggaacttgtttattaatt
gcaagattacttcgtgatttctgggacaagaaagtgttcaatccgttagagtatatcaag
actacaccaagtggagacattgaggttgccagtattaaagaaggaaatcttataattaaa
gggttaaatattgacaagaaacaaattgaatattttattggatccattattgttttgatt
gatttctttatggaaaatggaacaaatattcaaggattgaatgcaccaaattatagttct
gatccaaaccaatttgaaaatgaggtttgtcttagagcggaacatattgcatttacttct
attattaaatgtttgaattcgatgaaggaagccctttcgttcttgatggttttaattgaa
gaaattcaaattaaccaatctaacttcaatgaaattttacaatttttatcattaactaac
caagccaatcttttgtgtttaacttttaaagatttattattgcctaatagagatgttaag
aatttggttaaggatttgttgtcttctattattaataagaatatattaaaaggtggatct
attgatttaattgcatcttcattacaaaccagatgtgggtctttctgttctaccaatgat
gtatttatattcaaagctattgaaaatttaactagagccaagaagattaattcccgtgat
cctgatttaaagaataaatgtttaaccaatgcagtattactatttgaagaagcttatgat
tcattgactttggaaaacatcgagaactcaattaatattatgttggatttacaattttat
gctggtggtgtaggaatgttgttgaatattgcccaaaaacttggatctaatgttaaatca
gcagcagcaactactagtcttgcattaactgaagataattctgttaagaataaccaagaa
gcgatcgaaatttccaaaaagaagactgatttgtataatttggtgtttaacattcttact
aaggttgatttaaaggcttcacaaattactgaaactagtaaccaagttttgattaatgaa
ttcttggagattagagattctgcttataaaacatgttttgcatctcaagataaggaattc
cattatgcattttatgaatggtttattaaacaaggtgttaacgataggttgttggagatt
aataccccatttatattacctttcttggaagagaaatcggaaaataatttggtattgagt
gatttgctttggttatatcatgccaagagggagaattatttcgacgccgctaagatcttg
tacgcattgtctgtgtctgaatttaaattagaattgaatcaaagaatcgaatacctttcc
agggctaatgggttctgtagttgtgtttgtccacccaacttgagacaaaagatgattcaa
ctctctgcagtcatacaagaattatttgacgttgccaatgttcagttggatatcttgaca
agaatcaaggccgattcaagaatcagttctgaaaataagcaaattgctgttgattcattg
aattttaagattttgactataactgacttgttcaataactatactgatccattgggttat
tatgatctttgtttactcattttcaagatttctgattataagaataccgatgatattttg
aaaagatgggagttattctttgataagttgtaccatgaatatttggttgagaagaagggc
aaggaaactttctatattcttttaaatgatgcatttgtatcatatggagccaggttatct
tctaatgacttggtttttccaattgatgaattaatcaagttgattagtaaatatattcaa
gaagcaattgaagagaacccagtaactcagaagccaccaaggggaatagttgtcgatatg
tttattaaatgtggagtttcatatgaacggttatactatgttatgaaatcattaattgaa
cataacacgtttgaaatttattctgggttcactaatgatttgagaaagaatgaaatgaca
tacttaattaagaaatggtatactaatgataagaaattacgagaattgataccaaatgat
aagattgccaatttgcaagagtacacccttgaacaggatcctatcaatgaatttacaaac
catggtcaatatgtttcatag
DBGET
integrated database retrieval system