Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_137464
Help
Entry
SPAPADRAFT_137464 CDS
T03101
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14309
nuclear pore complex protein Nup93
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
SPAPADRAFT_137464
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
SPAPADRAFT_137464
Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
SPAPADRAFT_137464
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nic96
DUF2802
AcnX
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18870046
NCBI-ProteinID:
XP_007375057
JGI:
137464
UniProt:
G3AK83
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
954 aa
AA seq
DB search
MFGIQSKPSSAGITGFGSGQASQPNQAAPAFGSTIASAVNTTSTPAAATTNAATGNNSTF
ALPTSINTTNSSKLLKELLESANNLPKKTDNIELGSIHLTLNELQRKSQQLRKQDDTKKD
VSYTKAHYLLAGSGISAEDIENDLNAIHVPQTAPGAIATDVIAPVTTVTSANIENYLNAK
KDENILNTIEQSLHLASKDFDKFINSNISIDWKLRREELRKAVGLKYNEANNNDSSAKNS
LIWKTKSSSGNILGPLSAKTAAPVRQMTRDKFENHAKIIHALNQARLTKSNFPLCLNFNE
LNKLSSDLKSKQISEIWKILIELTDEKFAKTSQEQKFSNVPKRDLNESIVNNSKTYLEQE
FYNYVDELYLKDTDKPAKFQPASNLNKIGYFIHQIVLKNDPDLVNKTLLVNGTPIWALIF
YLIRAGLYFDAVELATRNRELFHKFDKNFPVYIKKYVDNHTLPSELMEKLHSEFNQQFQF
IINDVDTSINYDPYKYSVYKIIGKCDLSKKALPQSINLSIEDWLWFHLSIINENESSLIF
ENYSLLNLQNKIIQLGPKNLGSSNNPLYLKSLILVGLYELAVQYTYDHVNECDAVHLAIG
LTYYGLLRCSSFNKDVLLSVHNNEYEINFSRLVGSYTRSFKISDPKVACQYLILISLVEP
EVSHEALRELILVSREFGILLGELNQENGTKTPGILEKQRSLIKLDNLEDYYREIIEVSA
TKCEEEGRIFDALLLYQLCCEYDTVVSLINKLLAEIFATTDLSKPIIKFGNYQVISSGYT
TDGSEYKDTIDNNIILLSQHIMKMFNNNSFILSKIAPQKKQTCDLLLPIITIRELFLQKN
WREVITQIGKLGLIPVDPSDDLIKIRTSSELIQNSDMDDNLIKVIPSLLIMVMTSVSHLN
YEILTKKYQCLGNEREELIQWKKVAKNCMIYAGMVQYKMPRETYSLLINLESQL
NT seq
2865 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggtattcaatcgaaaccatcaagtgcagggattactggatttgggtccggacaa
gctagtcaacctaaccaggctgctcccgcctttggtagtactattgcatcagcagtaaat
actacttcgacccctgcggctgctacaaccaatgctgccactggtaacaattctaccttt
gcattacctacatcaatcaatacaactaatagttctaaactattaaaggaattattggaa
tctgctaacaatttacctaaaaaaaccgacaatattgaacttggttcaatccatttgacc
ttgaatgaattgcaacgtaaatctcaacaattgagaaagcaagatgatactaagaaggac
gtaagttatactaaagctcattatttattagctgggagtggtattagtgccgaagatatt
gagaatgatttaaatgcaatccatgttccccaaacagctcctggcgctattgctactgat
gttatagccccggttaccactgttacatcagctaatattgaaaactatttaaatgccaaa
aaggacgagaatattttaaatactattgaacagtcattgcatttggcatctaaggatttt
gataaatttataaactctaatatttcaattgattggaaacttagaagagaagaattgaga
aaagctgttgggttgaaatataatgaagcaaataacaatgattcttctgccaagaactca
ttaatatggaagacaaagtcatcctcaggaaacattttaggtcctttaagtgccaagact
gctgctccagtgagacagatgactagagataagtttgagaatcacgctaaaattatccat
gctttaaatcaagcacgcttaaccaaaagcaacttcccattgtgtttaaatttcaatgaa
ttaaataaattactgagtgatttaaaatctaagcaaatctcagaaatttggaagattttg
attgaattaaccgatgaaaagtttgccaaaaccagtcaagaacagaaattttctaatgtt
cctaaacgcgatttaaatgaatcaattgtgaataacagtaagacttatttggagcaagag
ttttataattatgtggatgagctttacttgaaggataccgataaaccagctaaattccaa
cctgcttctaatttaaataagattggttatttcattcatcaaattgtattgaaaaatgat
cctgatttagttaacaaaactttattagttaacggaactcctatttgggcattaatcttc
tatcttattagagctggtttatattttgatgctgtggaacttgccactcgtaatcgtgaa
ttgttccataaatttgacaagaatttcccggtttatattaagaagtatgttgataatcat
acattgccgtcagaattaatggaaaagttacatctggaattcaatcaacaatttcaattt
attattaatgatgttgatacaagtattaattatgatccatataaatattccgtttataag
attattgggaaatgtgacttaagcaaaaaagcattaccgcaatctataaatttaagtatt
gaagattggttatggttccatttatccatcatcaacgagaatgaatcttcattgatcttt
gaaaattacagtttattgaatttacaaaacaagattatccaattaggaccaaagaatttg
ggatcttcaaataatcctctttatctcaagagtttgattttggtgggactttatgaattg
gcggtccaatacacttatgatcatgttaatgaatgtgatgctgttcatttagctattgga
ttaacatattatggcttgttgagatgttcaagctttaacaaagatgtattactttcagtt
cacaataatgaatatgaaattaactttagcaggttagtagggtcatacactagaagtttc
aaaataagtgatccaaaagttgcatgtcaatatttaatattgataagcttggttgaacca
gaagtttcgcacgaagcattacgtgaattgattttagtatctcgagaatttggaatttta
cttggtgaattaaatcaagaaaatggtaccaagaccccaggaatcttggaaaaacaacga
agcttaataaaattagacaatttagaagattactatcgtgaaatcattgaagtttctgct
accaagtgcgaagaagaaggaagaattttcgatgcattattattataccaattatgttgt
gaatacgataccgtagtatcattgatcaataaattattagcggaaatttttgcaactacc
gatttaagtaagccaattatcaaattcggtaattatcaagttatttccagcggatatact
actgatggtagtgaatacaaagacaccatcgacaataatatcatattactttcacaacat
ataatgaaaatgttcaacaataacagtttcatattgagtaagatagctccacaaaagaag
caaacctgtgatttattattacctataattaccattcgagaattattcttgcaaaaaaat
tggagggaagtgataactcaaattggcaagctaggacttattccagtagatccaagcgat
gatcttatcaagattagaactagtagtgaattgatccaaaatagtgatatggatgacaat
ttaatcaaggttattccgtcattattgattatggttatgacaagtgtgtctcatttgaat
tatgagattttaaccaagaaatatcaatgtttgggcaatgaaagagaagaattgattcaa
tggaagaaggtggccaagaattgtatgatttacgctggtatggttcaatacaaaatgcca
agagagacctatagtttattaatcaatttagagtcacagttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system