Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_142465
Help
Entry
SPAPADRAFT_142465 CDS
T03101
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14303
nuclear pore complex protein Nup160
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
SPAPADRAFT_142465
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
SPAPADRAFT_142465
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
spaa03036
]
SPAPADRAFT_142465
Messenger RNA biogenesis [BR:
spaa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
SPAPADRAFT_142465
Chromosome and associated proteins [BR:
spaa03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
SPAPADRAFT_142465
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_Nup120_160
HEAT_Nup120
PALB2_WD40
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18870447
NCBI-ProteinID:
XP_007376806
JGI:
142465
UniProt:
G3ASZ1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1009 aa
AA seq
DB search
MTYSKSNVITYEDHLDVHYVKLPLKYNESTVNLSPKEQFNNSLVKSGKLLKVNSIVDLVS
CSVLQDQKTVKLVPIVKSNSLDFKYQEIQVRLPNTLLVHAITSEQDQIILDLVDETFLFI
NIVVKVNDFIYGNKLSLDKFDSWCHISIPYSFELANSSPYYLNHLNSHNLIVSLSNGQLI
HFKRDEILSDFTVNQIAQHTPFSIFGLFSNKTVKEINGISNNLVVDSVLLSENTLLTLTI
SKWLKVWNLQSGQLLNSVFVGDETDNWLTLIPNKYMQLIQFNNQNYLTLFVNDDTDGYKF
KLFEVDTLTELSQFEFTPSTDVNWFIQDFTVEVKQQLKYHILFKSNVYSILSTYSIATDN
GAIIEITKSITKEDIEEVSPHHTTEYYINKIFNSGLYNQLIVNTSIALLEPHLTHPIEDH
SRNSVSKSFSGANELQFWFKLDSLCQEFLKLSQESLAIVSYENSILSLQVNSLGVFRTSH
YYQQELTPKLTQIFGKFKEIISQKSFHKLHQHLLFSSSLTTDNIGELFQAFISDKLSEAE
IQQLIVTLESIPDIVTIVQSLIGTNSFELIDGDYDKSISLFVKLDAIASFKSIKSSHESI
LINLVVLFVICQTNDELLHMINSIISILKNYDLLELIFNTCFRNGQIESEKISDLGQSLF
WNGVVDHYPKLKSLIASLKLNDSFDLLGNIMSNHEFITNIVIELINREQAKFLYKNFLSK
LNDYNIDDRLLIGLIHLINFNPEQVYNIFKEFAPFRQLTKVKINDTFNPLIQAIYDNKES
DYYHILAQLCQAQSTKNSSTSTTFIQVALKFELAAIETSSNNDYYLNVFDVALSISDYSL
VAQSLPYISDLKPYLTKLITRLISEKRISIIFPPNNQSYVGHFKLIDGILLDMANQENDM
VSALRLYEYLYSWRLLGISEDLADKRGAIESLYAFINRFKDSGVDAKWRLKILEVYMIIL
NVLKGLGDGEQWLLKQGVRRRVITVDDVKIEYLVWLKQLQHDTEMIQVV
NT seq
3030 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatacagcaaatccaatgtcatcacatatgaagatcatctagatgttcattatgtc
aagttaccgttgaaatacaatgaatctaccgttaatctcctgccaaaggagcaattcaac
aacagtctagtcaaatcaggcaagctactcaaagtcaattcaattgtggatttggtgtct
tgttcggtgttgcaagaccagaaaaccgtcaagctcgttccaattgtcaaatcaaactct
cttgatttcaagtatcaggagattcaagtcagattacccaacacattgttggtccatgcc
ataactagtgagcaagaccaaattatccttgacttggtcgatgaaacctttttatttatt
aatatcgttgttaaagtcaatgacttcatatatgggaataaactttcattggataaattt
gattcatggtgtcatatttcaattccttattcctttgaattagctaactcttcgccatat
tatttgaaccatttgaatagccacaatttaattgtatccttgtccaatggtcaactaatc
catttcaaacgagatgaaattttgagtgatttcaccgttaaccaaattgctcaacataca
ccattttcaatctttggattgttcagtaacaaaactgtcaaggaaattaatggaatttcc
aataatttggtggttgattccgttttgttgagcgaaaatactttgctcactttaactata
tcaaaatggttaaaagtttggaatttacaatctggtcagttattgaattctgtctttgtg
ggtgacgagactgataattggttaacattaattccaaacaagtacatgcaattaatacaa
tttaataatcaaaactatttgactttgtttgtcaatgacgatactgatgggtataaattt
aagttgtttgaagtggatactcttactgagttatctcagtttgaattcaccccaagtacc
gatgttaattggtttattcaagattttaccgtcgaagtcaaacaacagcttaagtatcat
atcttatttaaatcaaatgtttattcaattttatcaacttattcgatagcaactgataac
ggggcaattattgaaataacaaagtcaattacaaaggaggacatcgaagaagtttcacca
catcatacaactgagtactatattaacaaaatattcaattctgggttatataaccaatta
atagtcaacacttcaattgctttgcttgaacctcacttgactcatccaattgaagatcat
tctagaaattcggtttccaagtcattctccggtgctaacgaattacaattttggtttaaa
cttgattcgttatgtcaagagttccttaaattgtcgcaagaatctttagccattgtaagt
tatgaaaattccattttaagtttgcaagttaattcattgggtgtattccgcacctcacac
tactatcaacaagaacttacccctaaattgactcaaatctttggtaaatttaaagaaata
atttcccaaaaatcgttccataaattacatcaacatttattgtttagttccagcttgacc
acagacaatattggtgaacttttccaagccttcatatctgataaattgtctgaagctgaa
attcaacagctcattgtaacattagaatcaattcctgatattgttaccattgttcaatca
ttgattggtacaaatctgtttgaattaattgatggtgactatgacaagtctatatcttta
tttgttaaattggacgccattgctagcttcaaatcaattaagtcaagtcatgaactgatt
cttataaatttggtggtattattcgttatttgtcaaaccaatgatgaactcttgcacatg
atcaactcaataatttccattttaaagaattatgatcttttagagttaatatttaacact
tgctttaggaacggtcaaattgaatccgagaaaatttcagatttgggacaatcattgttt
tggaatggtgtggttgatcattatccaaagttgaagagtcttattgcttctcttaagtta
aatgactcatttgatttacttggtaatattatgtccaatcatgaatttataaccaacatt
gttattgaattgattaatcgggaacaagctaaattcttgtataaaaatttcctttccaag
ttgaatgactataatatagatgataggttgttaattggattaattcatttaattaacttt
aatcctgaacaagtttacaacatattcaaagaatttgctccgtttaggcaattaactaaa
gtaaagatcaatgatactttcaatcctttgattcaagcgatttatgataacaaagagtca
gattattaccacatccttgctcaattatgtcaggctcaatcaaccaaaaatagttcaaca
tccaccacgtttattcaagttgcattgaaatttgaactagcagcaattgaaacaagctcc
aacaatgattactacctcaatgtgtttgatgtagcattgtctatatcggactattcttta
gttgctcaatcacttccatatatttctgatttgaaaccatacttgaccaagcttataact
agattgatttccgaaaaaaggatatcaattatattcccaccaaacaaccaactgtatgtt
ggtcattttaaacttattgatggtatattacttgatatggctaatcaagaaaatgatatg
gtatcagctctcagattatatgaatatttatactcgtggagattgttgggtatttccgaa
gatcttgctgataagagaggggcgattgaatcattgtatgcatttatcaatcgtttcaag
gattcgggagtagatgccaaatggaggttaaagattttagaagtgtatatgataatcctc
aacgtattgaaaggattgggtgatggtgagcaatggttattgaagcaaggggttagaagg
agggtgattactgttgatgatgtcaagatcgagtatcttgtttggttaaaacaattacaa
catgataccgaaatgattcaggttgtttag
DBGET
integrated database retrieval system