Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_145485
Help
Entry
SPAPADRAFT_145485 CDS
T03101
Name
(RefSeq) vacuolar membrane-associated protein IML1
KO
K20404
SEA/GATOR complex protein SEA1/DEPDC5
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
SPAPADRAFT_145485
Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
Autophagy
Other autophagy associated proteins
SEACIT/GATOR1 complex
SPAPADRAFT_145485
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
IML1
DEP
DEPDC5_CTD
IML1_N_fung
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18870689
NCBI-ProteinID:
XP_007372300
JGI:
145485
UniProt:
G3AF99
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1504 aa
AA seq
DB search
MFNSNSKNNTRPGLTTSGGPINSSSTFPTSSASSTRSIKRQMSAASHATLTIGSSRISSG
TQSNFMNRKVGSTITVGRRNNHDLDSLHKESQLRVGTTPAHPGIISKSSSTNAIPLDKDE
NKYPIQLTVWFHELRASPEDIIIDSSAFPGGVQIGQVFELQALEGSAKRKKKLIFIVNEH
NLREHLEETRVTIPTKSKFQISLLSNPLQNLLDLPARSQVQIKKVPKLEDVTVELVEIFI
KDVNLTRDSMWNFSSQLVGTCGYVDQRLTYLSNRTGIIKYMYKNGKEVFSGYISQDTKII
FRSESAKLTVLIQLSSEMWHFEENGEIMFHKLVNNLFPRIFRRWRDKNTHHSITIVLFAS
VDLTDIPWTVLSEGERPPNRRDYYRVVVDQVNILYWDRIMANLRLEFANFKRDIMLNRQE
NFSYKIEGDSLPSVKGNFLEAVNVGLTLLIDRFRNTDLKHSLSHFIMITAGTGLFDVDYD
LLLETSKKITGIDTSLDIICLSQPPLHVTPLFRYLKEGKVCYCVPNWCDISFYRDKSAAN
GQWIPRCKIYELQMMGVMENEVNDARIPRFHANNNDRSILDVMNDYDEAIFKPINHVAPS
SPISFKTQEPKFEPPPVKDSQATLSLIFNPRPALMPSDSTTSTSAAVGTVARPNTDVSAL
STLYTLNKNTEGKPPSPGAPSIKSLTPVSTLRIIHSHRKESDAGPRIIKSDKFLKQASED
TLVRKPPQVISTSGAATINTIEEKKLLRNRKKSSILVEPELTKSTDLFWWEISNPSQELN
NNVLLRSQVSRWSNVFPSKAKRKMIKWRSFQAPAALPISTEVFPSPRQLESDYTFQIYTV
FLNYENYLELSTTSQLMKEMIQLRLLLGFQICYGERVKRAEMERKPAGSPESVIKYFPES
SCLGSRIYMMLDDEIHRIFCDYSGNLNVQLYRRTDKDNIPHKITLGQSKIKPYFPLIRTR
YADDYTPTMVDSISVQPQKYNWNQFDQLIAGFDDAMPESKKEFHKMKFVVLPTDIPKNAY
FISNENLSPEEIRVEGLRKLIAVIERGTYKKNNTSVKSKKEERFSDMIFYTGNLYDFLKE
EADNYDMTGAQPTLMLPENVRFDKSIKLADLAKEMQGPSGLKLVDRTWHFKRHLDCFVGS
ELVTWLLECFEDIDSREEATSYGQSLMTRGLFKHVESRHGLLDGYYFYRFADEYFEKTAR
TWFGTKRDGQLTPKKSDNDLPKLPGVDDLQKLTKISSRNVESESSSMTDSGSRRRRKFIL
SKSIKFDVDPLKKSYRPELVTVHYDRVHNPEHCYHIRLQWLNTTTKFIEDTITAWSRLCE
RHGLKLIETPWKELCAVPTISPFHSFVEMILSLDPWLDPEFVDDTILSSNRYYFHLYFLK
KLEFLLDNRSTSFFSNENVDITYSWGKPTFKYAQFIHKTGAYIIELRSSGGFFLAPNNIH
LTRINSSMPSKGDYDNANPSKINTLDSQKVMLKFRAACQNKEFLREIFREAKETWKEQYL
SPIS
NT seq
4517 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gcatgttcaattcaaactcaaagaacaacaccaggcctggcctcacaacaagtggtggcc
ccataaattctagtagtacttttcccacatcatcagcatcctcaactagatctatcaagc
gacaaatgtcagcagcaagccatgccacactcactattggatcttctagaatatcatcag
gaacacaatccaatttcatgaataggaaagttggcagcacaattaccgttggccgacgaa
ataatcatgatttagacagcttacataaagaaagtcaactaagagtaggtacaacccctg
cacacccaggaatcatttccaaatcatcgtctactaatgctattcctttagataaagatg
aaaataagtatcccatccaattgactgtttggtttcatgaattgcgtgccagtcccgaag
acataataatagattcaagtgcattcccagggggtgttcaaataggacaagtgtttgaat
tacaagcattggaaggaagtgccaagaggaaaaagaagttgatatttatagtaaatgaac
ataatttacgtgaacatttagaagaaacaagagtcacaataccaaccaaatcaaaatttc
aaatctcccttctttcaaatccgttgcaaaatttgcttgatttgcctgctagaagtcaag
ttcaaattaaaaaagttcctaaattagaagatgtcactgttgaattagtagaaattttca
taaaggatgttaatttaactcgtgattctatgtggaatttttcatcccaactagttggaa
catgtggatatgtcgatcaaagattaacttatttgagtaatcgtacggggataataaaat
atatgtataagaatgggaaagaagtattttcaggatatataagtcaagacaccaaaatca
ttttccgttcagaaagtgcaaagttaaccgtattaattcagttatcgctggaaatgtggc
attttgaagaaaatggagaaattatgtttcacaaattagtcaataatttattccctagaa
ttttccgaaggtggcgagacaaaaatacccatcattcaataacaattgtcttgtttgcaa
gtgttgatctaacagatataccatggaccgtgctttctgaaggggaacgacctcccaaca
gacgtgactattaccgggttgttgttgatcaagttaatatcttgtattgggatagaatta
tggctaacctaagattggaatttgcaaattttaagagagatattatgttgaatcgacaag
agaacttcagctacaaaattgagggagattcattaccttcagtcaaagggaatttcctcg
aggcggttaatgttggattaaccttgttaatagacagatttagaaacactgatcttaagc
attcattaagtcatttcatcatgatcactgctgggacaggattgtttgatgttgactatg
atttattattagaaacaagtaagaaaattaccggtattgacaccagtttagatatcattt
gtttaagtcaacctccattacatgtcacaccattgtttagatatttaaaagagggaaaag
tttgttattgtgttcctaattggtgtgatatttcattttatagagataaatcagctgcga
atggccaatggattccaagatgtaaaatatatgaattacagatgatgggagttatggaaa
atgaagtcaatgatgcaaggataccaagatttcatgctaataataatgatagatcaatat
tggatgttatgaatgattatgatgaagcaatttttaaaccaataaatcacgtagcaccac
tgtcaccaataagcttcaagactcaagaacctaaatttgaaccaccgccagtgaaagatt
cccaagctacactttcattgatatttaatcctcgtcctgcattgatgccttctgatagta
caacctcaacttccgccgctgttggaacagttgccagaccaaatacagatgtatctgccc
tttcaacattatacacattaaataagaatactgaaggtaaaccaccaagcccaggagcac
catctattaaaagtttaactccagtttctacattgaggataatacatagtcatagaaagg
aaagtgatgctggacctcgaataatcaaaagtgacaaatttttaaaacaagcaagtgaag
ataccttagttcgaaaaccaccacaagtgatatccacatcaggagctgctacaatcaata
ctattgaagaaaagaagctactcaggaaccgaaagaaatcttcaatactagtagaacctg
agttaacaaaatcaactgatttattctggtgggaaatttctaacccttcgcaagagttga
ataataatgtattacttagatcacaagttagtagatggagtaatgtgtttccttccaaag
ctaaaaggaaaatgattaaatggagatcatttcaagcacccgctgcattacctatcagta
ctgaggtattccccagtcctaggcaacttgaaagtgattatacattccaaatttatactg
tatttttaaactatgaaaattatttggaattatcaactacttctcaattaatgaaagaaa
tgattcagttaagattattattagggtttcaaatatgttatggtgaaagagtcaaacggg
ctgaaatggaaagaaaaccagctggaagtccagaaagtgtaattaagtacttccctgaaa
gttcttgcttaggatcaagaatatatatgatgttagatgatgaaattcataggattttct
gtgattatagtgggaatttgaatgttcaattatatagaagaacagataaagataatattc
cacataagataacattgggacaatccaaaataaaaccatatttcccgttaattagaacaa
gatatgctgatgattatactccaacaatggtagattcaatttctgttcagcctcagaaat
ataattggaaccaatttgatcaattaattgccggatttgatgatgccatgcccgaaagta
aaaaggaattccataaaatgaaatttgttgttttgccaactgatatacctaaaaatgcct
attttatatccaatgaaaatttaagtccggaagaaatcagagttgaagggttaagaaaat
taattgcggttattgaaagaggtacctataagaaaaataacacgagtgttaaatcaaaaa
aggaagaacgattttctgatatgatattttataccggcaatctatatgatttcttaaagg
aagaagcagataattatgacatgacgggtgctcaaccaactttaatgcttcctgaaaatg
ttcgatttgacaagtcaatcaagcttgccgatctagcaaaggaaatgcaaggtccatctg
ggttaaagttagttgatagaacttggcattttaaacgacatttagattgttttgttggaa
gtgaattggtaacatggcttttggaatgttttgaagatattgacagccgtgaagaagcta
ctagttacggacaaagtttaatgactagggggctattcaaacacgtggaactgaggcatg
gtctattggatggatattatttctatcggtttgcggatgaatattttgaaaagactgcaa
gaacatggtttggtacaaaacgtgacgggcagcttactcccaagaaatctgataatgatt
tacctaaacttccaggggttgatgatttgcaaaaactcacaaagatctcttcaaggaatg
tagaatcggaatcatcatctatgactgattctggaagtagaagaagaagaaaattcattc
tcagtaagtcaatcaaatttgatgttgatccattgaagaaatcctaccgtccggaattgg
taactgttcattatgatcgtgtacataaccctgaacattgttatcatattcgtttgcaat
ggttgaatacaactacaaaattcattgaagatacaattacagcctggtctagattgtgcg
agagacatgggttgaaattaattgaaaccccttggaaagagttatgtgctgtgcctacaa
tcagtccatttcattcattcgttgaaatgatattactgcttgatccttggttagatccag
agtttgtagatgatactatcttatcatcaaataggtattatttccatttgtatttcttaa
agaaattggagtttttattggataaccggtcaacttcattctttctgaatgaaaatgttg
atattacttatagttggggtaaacctactttcaagtatgcacaattcatacacaaaacag
gagcatatattattgaattaagaagtagtggtgggtttttcttagcacctaacaatatcc
atttaactagaattaattcatcaatgccttcaaagggggactatgataatgccaaccctt
ctaagattaacaccttagattcacaaaaggttatgttaaaatttagagcagcatgtcaga
ataaagagttcttacgagaaatatttagggaagccaaggaaacttggaaagagcaatatc
tttctccaatctcatag
DBGET
integrated database retrieval system
