Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_51435
Help
Entry
SPAPADRAFT_51435 CDS
T03101
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K10597
ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:
2.3.2.27
]
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Pathway
spaa04120
Ubiquitin mediated proteolysis
spaa04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
SPAPADRAFT_51435
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
SPAPADRAFT_51435
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
spaa04121
]
SPAPADRAFT_51435
Enzymes [BR:
spaa01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
SPAPADRAFT_51435
Ubiquitin system [BR:
spaa04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
U-box type E3
SPAPADRAFT_51435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ufd2P_core
U-box
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18871556
NCBI-ProteinID:
XP_007376196
JGI:
51435
UniProt:
G3AQ71
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1050 aa
AA seq
DB search
MASQDEIRAKRLAKLQQHEAQQAQKKQQTEQELAQQLQQAQQELKVEQGKAQPKEHVPPV
VSAEKELPVVEQELSDHTIADTTATDPFTEWVLTQLEFIFQATIDPEKNKGDLVFLYNLA
YELQQRPHGQITPDDIESIFMEILTEVGIPAKSKSLMEYLYLTYHNAFRIKRTIPLKAHL
YQEKVQFLNQVIKFSVSYGGISFHVVDLFINNDVSKSLEFFVTRFNDVSSFLFDIINNEE
DEASLLELANLIFPYLSFKISTANLGHSSNFIHLLSVYEALVSIKPVAAIFSQVNGFQPP
KQECLDYEHKTLLGPLLRISPLLEDMAVNYFQGVSTQTPMQIHNTYSSIQNEYNVIISHL
FTIVDKLVRGSVKTRTDLVEWFADLINLNHLRRGSHADFKKLSSDGIMYNISIILIKLSL
PFLNYPLFGKIDKIDVDYFRKNRLLDVDEESRVNSTIEEVEEQYSHEEQDTNFISDCFNL
TLAYLHYGIGGIFIKYDRLKQQIKQVQSRIDQIESGQTPPGLNPMMISFLRQELPKLKKT
IEAFKSVKHSIQAIFDFRNLQLEIFDFIIGATTFIIRLIDPSHSYPQSKLSIPIFKISKV
SELDDHDYLKTKTPIPWKYYPEFIVEGIVNYCKFSTNFMGCPLVDNQDKLTCFCEFIIIL
LRCPELVGNPHLKSNLVEILFVGSLPIENANRDGFMISVFNNNKLIIDNILYSLLDFYVM
VEKTGASSQFYDKFNSRYYISVILEQLWKNPSYRFQLKDYSRNNVDFFIRFIARMLNDTT
YLLDETFNVLNEIHNVQQELKKRLTSPGDESMGTDEELEGNLDSLESRAKSYMSLSNKTM
ELFKLFTKEVPQGFMLAEIIDRLASMLNYNLSIMVGPKCSNLKVENPEKYNFEPKKILTL
LCEIYVNLSSQKEFVASVARDERSFNLAYFEKAENILTTKTYVEPKTINALVTFARAAED
QRKLEEMEEMEMGEIPDEFLDPLMFTLMKDPVILPGSRVSIDRSTIKAHLLSDSTDPFNR
MPLTLDDVIDNVELKQQIDEFRQKARQNRQ
NT seq
3153 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaagtcaagatgaaattagagctaaacggttggcaaagttacaacagcatgaagct
caacaagctcagaagaaacaacaaacggaacaagaactagcacagcagttgcaacaggca
cagcaagaattaaaagtggaacaagggaaagctcaaccaaaagaacacgtccctcctgtt
gtttcggccgaaaaggaattaccagttgttgaacaagagttgtctgaccatactattgca
gacacaacagctactgatccgttcactgagtgggtattaactcaattagaattcatattt
caagcaaccattgatccagaaaagaataagggtgatctcgtatttttatataatttggca
tatgaattacaacaacgtcctcacggacagataaccccggatgacattgaatcaattttt
atggaaattttaactgaagttggtatccctgctaaatcaaaatccttgatggaatatttg
tatttaacttatcataatgcgttccgcataaagagaacaatcccattaaaggctcatttg
taccaagaaaaagtgcaatttcttaaccaagtcattaaattttcagttagttatggtggc
ataagtttccatgtggttgatttgtttataaataatgatgtaagcaagtctttggagttc
tttgtaaccagattcaatgatgtttcgtcatttttatttgatattattaataacgaagaa
gatgaagcctctttacttgaattggcaaatttgatattcccttatttgagtttcaagatt
tctactgctaatcttggtcatagttcaaatttcattcatttgttatctgtatatgaagca
cttgtttcaattaaacctgtggctgctattttttcacaagttaacgggtttcaaccacct
aaacaggaatgtcttgattacgaacacaaaactttattaggtccattattgagaatatct
cccttattggaagacatggctgtgaattacttccaaggtgttagcacacagactcctatg
caaatccataatacttattcatcaattcaaaatgagtacaatgttattatttcacattta
tttacaattgttgataaattggttcgaggatcagttaaaacaaggaccgatttagttgaa
tggtttgcagatttaatcaacttgaatcatttaagaagaggttcccatgcagatttcaag
aaattatcaagcgatggaataatgtataatatctccattattttgattaaattgagtctt
ccatttttaaattatcctttgtttggcaaaatcgataaaattgatgttgattatttcaga
aagaatagacttctcgatgttgatgaagaatcaagagttaactctaccattgaagaagta
gaagaacaatattcgcacgaagaacaagacaccaatttcatctctgattgttttaatcta
accttagcatatcttcattatggtattggtgggatctttatcaaatatgatagattgaaa
caacagattaaacaagtgcaatcaagaattgatcaaattgaatcagggcaaactccacca
ggattaaacccaatgatgattagtttccttagacaagaattaccaaaattgaaaaagaca
attgaagcattcaaatcagttaaacattcaattcaggcaattttcgattttagaaatttg
caattggaaatatttgattttataatcggcgcaacaacttttattataagattaattgat
ccatcacattcatatccccagtctaaactctcaattccaatcttcaaaatatcgaaggtt
tctgaattggatgatcacgattatttaaaaaccaaaactccaataccttggaaatactat
ccagaatttatagtggagggtattgttaactattgtaaattcctgacaaatttcatgggg
tgtccacttgttgataatcaagataaattaacttgtttttgtgaatttataattattttg
ttgcgttgccctgaattagttggtaatcctcatttaaagtcaaacttagttgaaattttg
tttgttggatcactaccaattgagaatgctaatagagatggattcatgattagtgtcttc
aacaataataaacttataattgataatatattgtattcgttgcttgatttttatgtgatg
gttgaaaagactggagcaagttcacaattttatgataagttcaatagtagatattatatt
agtgttattcttgaacaattgtggaaaaatccaagctatcgtttccaattgaaggattat
tccaggaataatgttgattttttcattagatttattgcaagaatgttgaacgatactaca
tatcttttagatgaaacatttaatgttttgaatgaaatccataatgttcaacaggaactt
aagaaaagattaacttctcctggtgatgaatcaatggggaccgatgaagaacttgaaggt
aacttggattcattagaatctcgtgccaaatcatatatgtcgctttccaataaaaccatg
gaattatttaaattgttcaccaaggaggttcctcaaggttttatgcttgccgaaattatt
gacagactagcaagtatgttaaattataatctttcaattatggttggtcccaagtgttcc
aacttgaaagttgaaaatccagaaaagtataattttgaaccaaagaaaatattgacctta
ttatgtgagatatatgttaatttatcgtcacaaaaggaattcgttgcatctgtggcgagg
gatgaacgttctttcaatcttgcctattttgaaaaagcagaaaatattttgactacaaag
acctatgttgagcctaaaaccattaatgcattagtcacttttgctcgtgctgcagaagat
caacgtaagcttgaagagatggaagagatggaaatgggagaaatccctgatgaatttttg
gatccgttaatgtttacgttaatgaaggatccagttatattgccgggttctagagtttcg
attgatagatctaccattaaggcacatttattaagtgatctgactgacccatttaataga
atgccattaactttggacgatgtgattgataatgttgaattaaaacaacaaattgacgaa
tttaggcaaaaggctagacagaatcgtcaataa
DBGET
integrated database retrieval system