Spathaspora passalidarum: SPAPADRAFT_53071
Help
Entry
SPAPADRAFT_53071 CDS
T03101
Name
(RefSeq) protein required for protein sorting at the late Golgi
KO
K20299
vacuolar protein sorting-associated protein 53
Organism
spaa
Spathaspora passalidarum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
SPAPADRAFT_53071
Membrane trafficking [BR:
spaa04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
SPAPADRAFT_53071
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
GARP complex
SPAPADRAFT_53071
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps53_N
VPS53_C
Sec6
Mod_r
DUF1664
Pro_3_hydrox_C
HTH_49
COG4_N
DUF4763
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18871755
NCBI-ProteinID:
XP_007372037
JGI:
53071
UniProt:
G3AGV2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
776 aa
AA seq
DB search
MEDYNYDPTNHLHEIFNSPDSLDELPQLLSHVNQYKLELSKQIKHDINTYNSQPTRIASL
NSNISSLIKSIEEVKSNANETQTSITLMTSSIQQLDCYKKNLVLSMTILKRLQMLINVNN
QLSEIIHTHNYKEIHSLLGVVKQLLTFFKPFKSIDEINQINLLIIHSQNKLIDDIFIDFE
EYVKSHNIDLADQLIYGCEILQLIDVQYKEKLTNWFYNLKLKDFKTIFNNFDEAGSLDNL
NRRFIYFNKILTDIQQNYKDIFPENWKIDHEISIMFCKLTKQDLTNLLPKHKSDSKIILE
NLTKTLEFEKSLNASFQTNEFNQLISSVFEPYLFVWVQEQDKLLNTKILEFSSSSQLPIE
FQESKDILTILKVNNVPNLSNSCTELFKNFHKILTQILKLSNGEILIELAKLFSKYLFEY
HNRILLPLIPMDEDLTTNESLKYLTMILNTGDYLVNNIDDLSNKFQTLVQSQYKSRIPSF
DSSQEIYSQLINKCISKLIVKLTNDYRICWREFFNMNWQSLDQVNDVSSYMSELKSITLK
NIQIILPLIIRESFIRNFNDKLIEHLVHSIANNLKSIKPLTVLSVEQILLDVYSLKDLAL
KLPLYADPNYSEASDKTCSKSYEKFVVSNFHNLESLLKLLIVPSLPIETLIESYFELIGD
KSITNFIKVLNLKEINNQFEYIENFKLQLTIGTGDLQTSNKLLQVLEEEEPIVSGHSSRG
VTPIPEVMSPMLLPAKKNLNQFERNLREFAMTGENHVNKLNENFKNFGKFFRKESD
NT seq
2331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagactataactacgacccaactaaccatcttcatgaaatattcaactctcctgat
tcattagatgaattacctcaattattatcccatgttaaccaatacaaactagaattgtcc
aaacaaatcaaacatgatatcaacacgtacaactcacaacctactcgtatagctctgctc
aattcaaatatttcatcattaataaaatcaattgaagaagttaaatccaacgcaaatgaa
acacaaacatcaattactctcatgacaagctcgattcagcaattggactgctacaagaag
aatctagtattgtccatgacaatacttaagcgattacaaatgttgataaatgttaataat
caattatcagagataatccacacgcataactacaaagagattcattcgctattaggtgtt
gtaaagcaattgttaacatttttcaaaccgttcaagtcgattgatgaaattaatcaaatc
aacttgttaattattcacagtcaaaacaagttgattgatgatattttcattgattttgaa
gagtatgtcaaatctcataatattgatttggccgaccagttgatctacggatgtgaaatc
ttacaattaattgatgtacaatacaaggaaaagttaacaaattggttctacaatttaaaa
ctaaaagactttaaaactatttttaacaattttgatgaagcaggttctttggataattta
aaccgaagatttatttatttcaacaagatattaacagatatacaacaaaactacaaggat
atattcccggaaaattggaaaatagaccatgaaatttccattatgttttgtaagttaacc
aaacaagatttaacaaacttactaccaaaacataaatcagattccaaaattatattagaa
aatttaacaaagacgcttgagtttgaaaaatccttaaatgcaagcttccaaactaatgaa
tttaaccaattaatttctctggtgtttgagccttatctttttgtatgggttcaggaacaa
gataagctcttgaatactaaaatattggaattttcatctagttctcaattaccaatagaa
ttccaagaatcgaaagatattctcaccatacttaaagttaataatgttccaaatttatca
aattcatgtactgagttgtttaagaatttccacaagattcttactcagatcttaaaactt
tccaatggtgaaatattaattgaattggccaagttattcagtaaatatttgtttgaatat
cacaataggatccttctaccattgatacctatggatgaagacttaactacaaatgaatca
ctcaaatatttgacaatgattttgaatacaggtgattatttggttaataatattgatgat
ttatcaaataagtttcaaacacttgttcaatctcaatacaagtcaagaataccatcattt
gactcaagtcaagaaatctactcccaattaatcaataaatgtattagcaaattgattgtc
aaactaacaaatgattatagaatttgttggcgagaatttttcaatatgaattggcaactg
ttggatcaagtaaatgacgtaagttcatatatgtcagaattaaaatccattaccttgaag
aatattcaaataatattaccattaattataagagaaagttttattcgaaattttaatgat
aaattaattgaacatttggttcattcgattgccaataatttaaaatctattaaaccgttg
acagtattatccgttgagcagattttattggatgtgtacagtttgaaagatttagctttg
aagttaccattatatgctgatccaaattatagtgaagcatcggataaaacttgttctaaa
tcatatgaaaagtttgttgtatccaattttcacaatttagaatcgttgcttaaattatta
attgttccctcattgccaattgaaactttaattgaaagttattttgaattaattggtgat
aaatcaatcacaaatttcataaaggtactcaacttaaaggaaatcaataaccaatttgaa
tatattgaaaactttaagttgcaattaacaataggaacaggtgatttacagacaagtaat
aaactattacaagtacttgaagaggaggaaccaatagtttcaggtcatagttcaagaggc
gtaactccaattccagaagtgatgtcacctatgttactacccgctaagaagaatttaaac
caatttgaacgtaacctaagagaatttgcaatgactggtgaaaatcatgtaaataaattg
aatgaaaactttaagaattttggaaagttttttagaaaggaaagtgattag
DBGET
integrated database retrieval system
