Sporomusa paucivorans: SPX_39790
Help
Entry
SPX_39790 CDS
T11736
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
spax Sporomusa paucivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XEQ99087
LinkDB
All DBs
Position
4294515..4297883
Genome browser
AA seq
1122 aa
AA seq
DB search
MDTVGLQLEKLAAGTVVPNANVIFDNIVSTFGPVSYNPVSGVITISKAGRYLINWWVATQ
SSLGSPGMVFAIVTSDSVVIPANSPIKTGEVVGFALIEAAAPVTVSLVSQSANEVAYSSL
VPTKAFLAITEVPEELNGITGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTG
PTGDTGATGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGTTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTG
LTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGNTGPTGDTGPTGDTGPTGNTG
PTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGNTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGNTGPTGDTGPSGGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPT
GDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGTTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGAT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGATGDTGPTGDTGPT
GDTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGGIISAFGALTSSVGTLALTATAVEVPMPNQSTASDGLD
FTTANNITITEDGTYRIDISALGAFSDAGTVTISFGIDGVPQTVTSQSMEVLGGEPITFS
LIDYYVLTAGNQLSVQMSSSVAGDFTFPAAGSGAVLSVERVA
NT seq
3369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggatacagtcggtcttcaacttgaaaaactagcagccggaacagtcgtcccaaacgct
aatgtaatatttgataatatagtgagtacttttggacctgtaagttataatccggtttca
ggagtaataaccatatccaaagcaggaagatatctgatcaactggtgggtagcaactcaa
tcatcgctaggatcaccgggtatggtttttgccattgtaacctcagacagtgttgtaatt
ccagcaaattcaccaataaaaacaggggaagtcgttgggtttgcacttattgaagcagca
gccccagtcactgtcagcttagtaagccaatcagcaaacgaggtagcatattcttcgttg
gttcctactaaagcatttttagcaataactgaggttccagaagaattaaacggtatcact
ggcgatacaggtcctaccggtgacactggacctactggcgacactggacctaccggtgat
accggacctactggtgacacaggggctaccggcgatactggacctactggtgatacaggg
cctactggcgacacaggggctaccggcgatactggacctactggtgacacaggggctacc
ggcgatactggacctactggtgacacagggactaccggcgatactggacctaccggtgac
acaggggctaccggtgataccggacctaccggcgatactggacctactggcgataccgga
cttactggtgacacaggggctaccggcgacactggacctaccggcgataccggacctact
ggtgatactggacctactggcgacacagggcctactggtgatactggacctaccggcaat
acagggcctactggcgacacagggcctactggtgatactggacctaccggcaatacaggg
cctactggcgacacagggcctactggcgacacagggcctactggtgatactggacctacc
ggcaatacagggcctactggcgacacagggcctactggcgacacagggcctactggtgat
actggacctaccggcaatacagggcctactggcgacactggaccctctggcggaccaact
ggcgacactggacctaccggcgatacaggacctaccggtgacactggtcctaccggtgat
actgggcctactggtgatactgggcctactggtgatactgggcctaccggtgatactgga
cctactggcgacactggggctactggtgatacaggacctaccggtgacactggacctact
ggcgatactggggctactggcgacactggacctaccggcgatacaggacctaccggcgat
acaggacctaccggtgacaccggacctaccggtgatactgggactactggcgacactggt
cctactggcgatactggtcctactggtgataccggacctaccggtgatactggggctacc
ggtgatactggtcctactggcgatacaggtcctaccggtgatacaggtcctactggtgat
actggtcctactggtgacactgggccaaccggtgatacaggtcctactggcgacactgga
cctactggtgatacaggtcctactggcgacactggtcctactggcgacactggtcctact
ggcgatactggacctaccggtgatactggtcctactggcgacactggggctaccggtgac
acaggtcctactggcgacactggtcctactggcgatactggacctaccggtgatactggt
cctactggcgacactggggctaccggtgacactgggccaaccggtgatacagggcctact
ggcgacactgggcctaccggtgataccggacctactggcgacactggacctaccggtgat
accggggctactggcgacactggacctaccggtgataccggggctactggcgacactgga
cctaccggcgataccggacctaccggcgatactggacctaccggtgatactgggcctact
ggtgatactggacctactggtgataccgggcctactggtgacaccggacctactggggac
actgggcctactggggacactgggcctactggtgacaccggacctactggtgacactggg
cctactggtgataccgggcctactggtgacaccggacctactggtgacactgggcctact
ggtgatactgggcctaccggtgataccggggctactggcgacactggacctaccggcgat
accggacctaccggcgataccggggctactggcgacactggacctaccggtgataccgga
cctaccggcgatactggacctaccggtgacactggacctaccggtgacactggacctacc
ggtgataccgggcctactggtgacaccggacctactggtgacactgggcctactggtgat
actgggcctactggtgatactgggcctactggtgatactgggcctactggtgacactggg
cctactggtgatacaggacctactggtgacaccggacctactggtgacactgggcctact
ggtgatactgggcctaccggtgataccggggctactggcgacactggacctaccggtgat
accggggctactggcgacactggacctaccggcgataccggggctactggcgacactgga
cctaccggcgataccggacctaccggcgatactggacctaccggtgacactggacctacc
ggtgatacaggacctactggtgataccgggcctactggtgataccgggcctactggtgac
accgggcctactggcgatacaggacctactggtgacaccggacctactggtgatacagga
cctactggtgatacaggggctactggtgacactgggcctaccggcgatacaggacctact
ggcgataccgggcctactggtgacactgggcctaccggcgatacaggacctactggtgat
actggaggtataatcagtgcttttggggctttgacctcatcagtaggaactcttgcattg
acggctacagccgttgaagtgccgatgcccaatcagagtactgcctcggatggtcttgat
tttacaacagcgaataacattacgatcacggaagatggaacctatcgtattgatatcagt
gcccttggcgcctttagtgatgctggaaccgttaccattagctttggcattgatggcgtt
ccacaaacagttacgtcacagtcaatggaggtgcttggcggagagcccattacctttagt
ctgattgactattatgttcttactgcaggaaaccaattgtcggttcaaatgagctctagt
gtagcaggtgatttcacttttcccgctgcgggttcaggtgcagtcttatccgttgaacgg
gtcgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system