Shewanella putrefaciens CN-32: Sputcn32_0330
Help
Entry
Sputcn32_0330 CDS
T00513
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
spc
Shewanella putrefaciens CN-32
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spc02000
]
Sputcn32_0330
Transporters [BR:
spc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sputcn32_0330
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF2490
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABP74062
UniProt:
A4Y279
LinkDB
All DBs
Position
354269..356326
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MEHRAFKKNIIAAIISSLGVSSAYAAVEAESTEPIEKITVYGEKIERSLKDTTSSVSVID
KDSLDSGQYQSVSDALSEIPNVVVLTGSVPDIRGVSGNGSASGFNSFTGGARARVSTLVD
GVAEPFVADLTGDTGLWDIQQVEVFRGPQSTINGRNSIGGTVFIKTEDPTFDWRGAARLG
YRDQNNYVDSAVMVSGPILDDELAFRLSGQNVTGETYNKGLVYETNPAPFDLNELITNRW
RGKFLWQPSAVEELKVLYSFSYNDEKGDSGRNYFSGDDPWAYRPILQRYIETESTTHSVK
VDYDLGSGRALDLVVAYMDYDWGSKSYEALVTAQQYVDMKDESYTVDGKYSFGLNDRDFN
GFIGLAYYERSQDFGSTGSSVYTGDDSSSSLSIYGELTYGLAESLWLTVGGRVMRDEQKR
NFSMLYRGTQLEEKLDNDSTITLPKLVLQYAITDNTTLAASARRGYNSGGGALSLAESEY
YYYDEEFVDTYELSARSMFLGGNVNLSANLFYNDFDGYQASNQARKITNVDKAVTYGIET
ELSAMLTANWQVIAGVGLLDSEIKKVDSSYGDIVGNQLNSAPHVTANLGVKYWLNDAFSV
GVSGNYVGEYFADIDNTESRIAGDYVVARLSVDYQKDNWRISGFINNMFDEQAMTVNEPP
SANYVNGYAAIIDPRNLGVSVMYSF
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacaccgggcatttaagaaaaatattatcgccgctattatttcgagtttgggagta
tcttctgcttatgcagcagttgaagcagaatcaacggaacccattgaaaagattaccgta
tatggtgaaaaaattgagcgtagcttgaaagacaccacctcatctgtttctgttatcgac
aaggattcactggatagcggtcagtatcaatctgtgtcagatgcattatctgaaatccct
aacgtcgtcgtgctgactggctctgtgcctgatattcgcggtgtttccgggaatggctcc
gcctctggatttaactcttttactggtggtgctagggcgcgggtttctacacttgtcgac
ggtgttgctgaaccttttgttgccgatcttactggtgatacaggtttatgggatatacag
caagttgaagtatttcgaggtcctcagtcgacgatcaatggccgtaatagtattgggggc
actgtatttatcaaaacagaggatccgacatttgattggcgtggcgctgcacgtttaggc
taccgagatcagaataactatgtcgacagtgctgtaatggtatccggtcctattttagac
gatgagttagcgtttaggctaagtggccaaaacgtgacaggagagacctataataaggga
ttggtatatgaaaccaaccctgccccgtttgatctaaatgagttaattacaaaccgttgg
cgtggcaaatttttatggcagccaagcgctgtcgaggagctcaaagtactttatagcttt
tcctataacgacgaaaaaggtgattcgggtcgtaactatttttcaggtgatgatccatgg
gcatatcgaccgattctccaacgttatattgaaacagaatcgacaacgcattcagtcaaa
gttgactatgacttaggttcgggtagagcgttagacttggttgtggcttatatggactat
gactggggttctaagtcctatgaggctttagtaacagcacagcaatatgtcgatatgaaa
gacgagagctataccgttgatggtaaatatagttttggcttaaatgaccgtgattttaac
ggatttatcgggcttgcgtattatgaacgtagccaagattttggtagtacaggaagttct
gtttatacgggtgatgacagcagttcctctttatccatttatggtgagttaacctatggt
ttagccgagtcgctttggcttactgtaggcggtcgcgtgatgcgcgatgagcaaaaacgg
aatttttcgatgttatatcgtggtactcagcttgaggaaaaactcgataacgacagcacc
attaccttgcctaagttggtattgcaatacgccatcacggacaataccaccttagctgcc
agtgctcgccgtggttataactctggggggggagccttatccttagctgaaagcgaatat
tattactacgatgaggaatttgttgatacctatgaactcagtgcgcgaagcatgttttta
ggtggcaatgttaatttgagcgctaacttattctataacgatttcgatggttatcaggca
tccaatcaagcccgtaaaattactaatgttgataaagcagtaacttacgggattgaaact
gagttaagtgcaatgctaaccgctaactggcaggtgattgcaggtgttggtttgctcgac
agtgaaatcaaaaaagttgattccagttatggtgatattgttggcaatcaacttaattcc
gctccccatgtgacggcgaaccttggggtcaaatattggctaaatgatgccttctccgtt
ggcgtatcaggtaactatgtgggggaatattttgcagatattgataatacagaatcaagg
attgcaggtgattatgtggttgctcgtttaagtgtcgattatcagaaagataactggaga
ataagtgggtttatcaacaatatgtttgatgagcaagcaatgacagtgaatgagccacct
agtgctaattatgttaatggttatgccgctattattgatccacgcaatcttggggtatcg
gttatgtatagcttttag
DBGET
integrated database retrieval system