Shewanella putrefaciens CN-32: Sputcn32_1368
Help
Entry
Sputcn32_1368 CDS
T00513
Name
(GenBank) SNF2-related protein
Organism
spc
Shewanella putrefaciens CN-32
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SWIM
Mu_Gam-Sipho_Gp157-TOTE
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABP75096
UniProt:
A4Y563
LinkDB
All DBs
Position
1553486..1556707
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MNRLSPQEPIQLTQASVESLFTPPTLMRARDYVMKGRVLNVKANADFRHIEGLVSGTERA
PYRQDIRLVSVNHKLIMNGFCSCPATGHCKHIAAVLYSLLSDKTVEDQRITQWLHLLDEA
DDLKLYDVDTLYEDRVLYVLSKDDNGVFVEFRRGKLAKKGGYNKGSKVALSDVQYFMPAW
IGSDDVLILNLVMSTRRHGASRLYLKAQLGAVALERMLATERCFWEESRIPLSQGEAVSP
VFVWSDIDSEHKQIQLVLPNKDNWELISTAPPAYIELDYFKVGAVKTDISIDKLMLLNHM
PPVPSSQIETVSHKLIKHFSAKVVPTPLPIDFVELQAPLQIRLTLTSLDLPEHAMAQPFV
LLEYVYQDVVLGGRYIDEPLSLVTQGGKTYQVMRQVALEKDAITRLMALEFAELDPSFFP
NSNSLSSIWSLGPLPEAIKKWLRFIELCIPALEDLGYQVCYAENFSLNVIDTPLAIELDD
SEEGWFSLSLNADIDGQSIPMLPLIATWLKQHGEPADDAELLLPSPNGDWLKVKASVIKP
LVSIILELFESHKGHSVALPKYRAHLLNDFVESEIRLLNGERVRSLAAKLDQFQGVVEVD
LPQQLQAELRHYQHQGLNWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTIQTLAFLLKQQALKSTGAS
SSPSLIICPTSLVGNWAKEATKFAPSLKLVVIHGAARKPLLECLNEFDVVVTTYPLMMRD
SEYYQPHIFEHIVLDEAQQIKNAQAKVTQIIKELRSPFKLCLTGTPLENHLGELKSLMDF
CLPGLLGTNAFFNKSFRHSIERYGDTDKARALSQRIAPFVLRRTKDEVVSELPAKTEIAQ
ILELEKDQRNLYESIRLVMEKKLRDLFANQGVNSSHIEFLDALLKLRQACCDPRLVKLEQ
AQKVKNNAKLDWLKQNLPEMVQEGRKVLIFSQFTSMLTLIEAELQSLNIDYSKLTGQTRW
RQAQIDRFQDGDTPVFLISLKAGGTGLNLTAADTVIHYDPWWNPAAEKQATDRAHRIGQD
KPVFVYKLIAEGTVEEKIQEMQQHKQNLADSILEGKGKGAWQGSADELLSLFS
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcgtttatccccccaagagccaattcaattgactcaagcctccgttgagtcatta
ttcacgccgccgacgttaatgcgagcccgtgattatgtgatgaaagggcgggtattaaac
gtaaaagcaaacgctgattttcgccatattgaaggtttggtcagcggtactgaacgtgct
ccttatcgacaagatatccgtcttgttagcgttaaccataagctgatcatgaacggtttt
tgttcctgtcctgcaacggggcattgcaaacatattgccgccgtactttacagtttgctc
agtgataaaacggtagaagatcaacgtattacccaatggctacatttactggatgaagcc
gatgatcttaaactttatgacgttgatacgctttatgaagatcgtgtgctctatgtgctt
tcgaaggatgataatggtgtatttgttgaatttcgccgaggcaaattggctaagaaaggc
gggtacaacaaagggtcaaaggttgcgctatccgatgtgcaatattttatgcccgcttgg
atcggttctgatgatgtgcttattcttaacttggttatgtcgacccgtcgccacggtgct
tcacgtctctatttaaaagcgcagttaggtgcggtcgcgttagagagaatgcttgcgacc
gaacgttgtttttgggaggaaagccgtattcctctgagtcaaggggaggcggtaagtcct
gtttttgtctggagtgatattgatagtgagcataaacaaatacagttggtgttgcccaat
aaggacaattgggagctgatctccaccgcgccacctgcttatattgagttggattacttt
aaggtaggagctgtaaaaacagacattagtatcgataagttaatgttgttaaatcacatg
cctccggtgccaagttcacagatagaaacggtgagtcataagctgataaaacatttctcc
gccaaagtagttcccacacctcttccgattgattttgtagaacttcaggcacctttgcag
ataaggttaacgctaacgtcactggacttaccagagcatgcgatggctcaaccattcgta
ttactggaatatgtttatcaagatgtggtgcttggggggcgttatattgatgagccgcta
tctttagtcactcagggaggcaaaacataccaagtcatgcggcaggtcgcgttggaaaaa
gacgcgattactcgtttgatggcgttagaatttgctgaacttgatccctcatttttccct
aatagcaatagcctaagtagtatttggagtttagggcctttacctgaagccattaaaaag
tggttaaggtttattgagctctgtattccggccttagaggacttggggtatcaagtctgt
tatgccgaaaactttagcttaaatgtgattgatactcctcttgctattgagcttgatgac
tcagaggaaggctggttttccctatctctcaatgcggatattgatggccaaagtattcct
atgttgcccctcattgccacttggcttaaacagcatggggaacctgcggatgatgctgaa
ttattactcccaagcccaaatggtgattggttaaaagtcaaagccagtgtgattaaacca
ttggtgagcattattttagaactatttgagagtcacaaaggccacagtgttgcgttacca
aagtatcgagcccatttgctgaatgattttgtcgagagtgaaatacgtttattaaatggt
gagcgggtgagaagtctggcggcaaaattggatcaatttcagggtgtagttgaggtggat
ttacctcagcaattacaagctgaattacgacattatcaacatcaaggtttaaattggctc
tgttttttaaaggaatatcagcttggtggcattttggccgatgatatgggactcggtaaa
acgattcaaacattggcctttttactcaagcagcaagcgcttaagtccacgggagcgagt
tcctcaccaagtttaatcatttgtcccacgagtttagtgggtaactgggccaaagaggcg
actaagtttgccccttcattaaagctggtggtgatccatggtgcagcccgtaaacccttg
cttgagtgcttaaatgaatttgatgttgttgtaacgacctatccgttaatgatgcgtgat
agcgaatattatcagccgcatatatttgaacatattgtcttagatgaagcccagcagatt
aaaaatgcccaagcaaaagtgactcaaataattaaagagttacgctccccattcaagtta
tgtttaacaggaacgccactggaaaatcacttaggtgagcttaagtctttgatggatttt
tgtttgccagggcttttagggacaaatgccttttttaacaaatcctttagacatagtatc
gagcgttatggcgatacagataaagcaagggcattgagccagcgtattgctccttttgtg
ctgcgtagaacaaaagatgaagtcgtcagtgaattaccggcgaaaaccgaaatcgctcaa
atcttagaacttgagaaagatcagcgtaatctctatgagagtattcgcttagtcatggag
aaaaaactgcgggatctatttgcaaaccaaggtgttaacagtagccatattgaattttta
gatgcgctgttaaagctacgtcaggcctgctgtgatccgcgtttagtcaagttagagcaa
gcacaaaaagtaaagaataatgctaagctggattggcttaagcaaaacttgcctgagatg
gtgcaagaaggccgtaaggtattgatattcagccagttcactagcatgctgaccttgatt
gaagcagagctgcaatcgttaaatattgattacagtaaactgacaggacaaacccgttgg
cgtcaagcgcaaattgatcgatttcaagacggtgatacacctgtgtttttaatcagttta
aaggccgggggaacagggctaaatctcacggctgccgataccgttattcattacgaccct
tggtggaaccctgccgcagaaaagcaagccacagatagggcacatcgtattggtcaagat
aagccagtatttgtgtataaattaattgctgaaggtactgttgaggaaaaaatccaagaa
atgcagcaacataagcaaaatttggccgacagtattcttgaagggaaaggcaaaggggca
tggcagggtagtgccgatgaactgttatcgctttttagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
