Sphingobacterium sp. DR205: G6053_18555
Help
Entry
G6053_18555 CDS
T06466
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
spdr
Sphingobacterium sp. DR205
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spdr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spdr02000
]
G6053_18555
Transporters [BR:
spdr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
G6053_18555
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
STN
FecR_C
CILP
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIH34774
UniProt:
A0A6G7BY69
LinkDB
All DBs
Position
complement(4273850..4277206)
Genome browser
AA seq
1118 aa
AA seq
DB search
MKKTNQRKIVIMSFGFGLPLFLICFSFSLLKAEIALSQTVASKKICMDVTTNNIQEAFNM
IEKQVNVSFTYKKDLLSIPLQIALNVKDTPLKTVLEEIRKQTDLDFKEIDGNVIAVRYQP
GSLGVKQKAARQNIVKGSVVSAGDGNPLPGISVHVKGTNRTSVTDDRGNFTLSDIPGDAV
LVFTYIGYEKQEIPVNNRGFMQIRLIESYTDLDEVVVVGYGTQKKVNLTGSVSSVSATDI
EDRPITQASQALAGLATGVSVSQSAGRPGNDAASIRIRGQGTFSGAGNDPLVLIDGLAAS
MNDIDPNNIKSISVLKDAASASIYGTRGANGVILIETKRGTSGRLRVSYNNTIGWQKVTE
LPDFVASDEYATLFNEANTNVGQALTYTPEEIDKFRSGVDPDNYPNVPHLKNLLSSGSGF
QMNHNVSFSGGSDKNSYLFSLGYLDQDGVVAKNNYHRYNFMLNSDSKILDNLTLKVNMTG
NSAQTNEPRQFDGEMMSMIGFAVRQGPIYAGRKSDGTFGYQDNFSPEAWLSSESFVNRAN
KFFLGGAELAWEIVPGLTWSGKAGYNYNNFTNNSFASDFIFDQNKKVGPNNLTVNSGDNS
LLTLQSLLQYNRTYGKHAINALAGFSEEKFRSDWTTAFRDDFPSNLLHELNAGSSANMQS
SGSAAEWALRSFFGRVNYILSDRYLFEVNARYDGTSRFPSEGRWGLFPSVSAAWRISEEP
FFKEHVTGVDNLKLRASWGTLGNQNIGNYPYQNVLSLGNNYPIGGVLLPGARLTTLANSD
ITWETTEVRGIGLDFSLMKGKLAFVMDYFDKRTRDILYNLTVSSVLGLTPSEVNAASVRN
NGFEFLMDYRTSIGKLNIGFSPNFTYTKNRVTKLADGLTQDIAKNLFVGQPLGAIYGYVA
DGLFVDENDIAAYPTQPYAAQPGFVRYADISGLNGTPDGVVDPANDRTIIGNTVPKFSYG
ATIRFDYQGVDLSVLLHGLAGFDRQMGSYQAFAFYNGGQIQRWQADNRWSADNPDRNAEY
IKLTSLNMGSGTIMPSTFWNRNASFLRLKNIQLGYSFPEKITRKMRLDRLRIFFSGQNLF
SLSSFYQGWDPEMGQGTGDNTPFYPITSVYTFGLNVNF
NT seq
3357 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaactaatcaacgaaaaattgtaattatgtcgttcgggtttggattgccttta
tttttgatctgtttttcgttttccttgttaaaggcagagattgctctttcccaaacggtg
gcttccaaaaagatctgcatggacgtgacaaccaataatattcaggaagcttttaatatg
attgaaaagcaagtcaacgtctcctttacctataaaaaggatttgctttccataccattg
caaatagcccttaatgtcaaggatactcctttaaaaacggttttggaagaaatccgtaag
caaactgaccttgattttaaagaaatagatggaaatgtaattgctgttagatatcaacca
ggttcgctcggagtgaaacaaaaggccgcccgccaaaatatcgttaaggggtctgtcgtt
tctgccggcgatgggaatccgctaccgggtatcagtgtacatgtaaaaggaacaaacaga
acttccgtgacagacgacagagggaatttcaccttgtctgatattccgggcgatgcggtt
ttggtattcacctatattggctatgagaagcaggagattcctgtaaataacaggggattt
atgcaaattagactaatcgaatcttatacagacctggacgaagttgtggtagtagggtat
ggcacgcagaagaaggtgaatctaaccggttccgtttcgtccgtttctgctactgacatt
gaagacaggcccattacccaagcctcgcaggcgctagccggtttagcaacaggtgtttcg
gtttctcaaagcgcaggacgtcctggaaatgatgcagcttcgatacgcatcagagggcag
ggaaccttttcgggagctggaaacgatccgttagtactaatagatggtctggcagcttcg
atgaatgacatcgatcctaacaacataaagagcatttcagtgttaaaagacgctgcgtca
gcctctatatatggtactcgtggtgcaaacggggttattctgatcgaaacgaaacgcggc
acaagcggtagacttcgggtttcgtacaataacactataggctggcagaaagtgacagaa
ctccccgattttgtagcatcggacgaatatgcgaccctatttaatgaggcaaatacgaat
gttggccaagctttaacctatacacccgaagagattgataagttccgatcgggtgttgat
cccgacaattatccgaatgtaccgcacctgaaaaacctgctttcttcgggctcgggcttt
cagatgaaccacaatgtttctttttccggtggctcagataagaactcctacctattttcc
ttaggctacctggatcaggatggtgttgttgccaaaaataattatcaccgctataacttc
atgctgaattcggatagtaaaatactggataaccttacgctgaaggtgaatatgacgggt
aacagtgcacaaaccaatgagccaaggcaattcgatggcgaaatgatgagcatgatcggt
ttcgctgtcagacagggacctatttatgcaggtagaaagtcggacgggacctttggctat
caggacaatttcagtccggaagcatggctttcgagcgagtctttcgtaaaccgtgcaaac
aagttttttttagggggagctgagcttgcctgggaaatagtacccgggcttacctggagt
ggtaaagcgggatacaattataataattttacgaacaatagctttgcatctgattttatt
tttgatcaaaataagaaagttggtcccaacaatcttaccgttaattcgggcgacaactcg
ttattaacgcttcaatcattgttacagtataacaggacttatgggaaacacgcaatcaat
gcattagcaggtttctcagaagaaaaattccgctcagactggaccaccgctttccgtgac
gattttccgagtaatctgttgcacgagctaaatgcagggtcatcagccaatatgcaatcg
tccggctcggcggctgaatgggccttgcgctcattctttggacgggtaaactatatatta
tcagatcgttatctgtttgaagtgaatgcaaggtatgacggaacttcccgcttccccagc
gaaggacgttgggggctgtttccctctgtttcggcagcctggcggatctctgaagaacct
ttctttaaagagcatgtgactggagtcgataacttgaaattgcgggcatcttggggaacg
ttgggaaatcagaatatcggtaattatccctatcagaatgtgctgagtttgggcaacaat
tatccgatcggtggtgtattgctcccaggtgcgcgcttaactaccttggcaaacagcgat
attacatgggaaacaacagaggtaaggggaatcggtctcgatttctcacttatgaaagga
aaacttgccttcgtgatggactattttgataagcgtacacgggatattctatataatttg
acggtttcaagtgtgttgggattgacaccatcggaggtaaatgccgcatctgtacggaac
aacggatttgaatttctgatggattatcgtacctctatcggaaagttgaatatagggttc
agtccgaattttacctatacgaaaaaccgggtaacaaaactggcggatggtctaacgcaa
gatattgcaaaaaacttgtttgtggggcaaccattgggagctatttatggctatgtagcc
gacggccttttcgttgacgaaaacgatattgcagcctacccaacgcaaccctatgcggcg
caacccggttttgtgcgatacgccgatataagcggcctcaacggtactccagatggagtt
gtcgatccggcaaatgaccgaacaattatcggcaataccgtgcccaagtttagctatggc
gccaccataaggtttgattaccaaggtgtggatctttctgttctacttcatggattggca
ggttttgatcgtcagatgggctcttatcaggcattcgcattttataatggaggacagatt
cagcgatggcaggccgataacagatggagtgccgacaatcctgatcgaaatgcagaatat
attaaattgaccagtttaaatatgggttccggaacgattatgccatctacattctggaat
cggaacgcaagttttcttcgcctcaagaatattcagctgggttactcttttcctgagaaa
attaccaggaagatgcggttggacaggctgcgtattttcttcagcggacagaatttattt
tccctgagcagcttttatcagggctgggatcctgagatggggcagggcacaggcgataac
acacccttttatccgataaccagtgtgtacacttttggcttgaatgttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system