KEGG   Sphingobacterium sp. DR205: G6053_27400
Entry
G6053_27400       CDS       T06466                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
spdr  Sphingobacterium sp. DR205
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:spdr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:spdr02000]
    G6053_27400
Transporters [BR:spdr02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   G6053_27400
SSDB
Motif
Pfam: Plug TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg TTR_TEN1-4 Dockerin_1 Rho_GDI EF-hand_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: QIH36366
UniProt: A0A6G7C2U8
LinkDB
Position
complement(6437320..6440493)
AA seq 1057 aa
MKNILRYGTVVMAQLALTQVLYAQELLKGKVVDDKSQPISGVTILVNGKGSGTTNQNGEF
GIVAKPGDKITFNSIEYLTKTLNVANLSFLQVNLTPKQESLDEVVVIGYGTQKQKNLTAP
VSKFKAENLDERPIARVDQALIGQIAGVRVKQSTGVPGKGLSVQVRGSGSISAGTEPLYV
VDGFPLQNAKTNTSGGYSSGNPLDNMNPNDIESVEVLKDAAAAAIYGSRAGNGVVLITTK
RGRTGEAKLSLNSYVGISSPYRKLDMLNGEEWIDRQIEMINAQWVASGTGRLATQSNEER
RKILGLQDGTFNTSYMYDDRWLQPGHPGLYMIDWQDEAYRKGITQNYQVTGSGGTEYVNY
YVSGNYMNQQGIVHGLNYKNYTARANVEVKANKKLSFGLNLAPSYSIGNDPDVEGKDNIM
HQIYSMSPVQDNPAGTVNVLDNDKYPWSVSTNDPIAKLKNYLGENKISRLLGTIYGQYHI
LDHLTFKTTVNLDQTDSRSNRFEPYTIAGSLANRLTNPNQATYGSNSVYRRQTFVNENTL
NYSVNIGKHDITALVGQAYNFDKLETSSITSKDGYINSSIKTLNGAVATVASTGATQSIL
LSYFGRVQYAFDGKYLFSASLRRDGSSRFGANTKWGLFPSLSLGWRLSDENFMKSLSFIN
DLKLRGSFGTAGNNNIDDYKSIPLLGIYNYVGNDKSVPGQAPKNIANPDLKWEKSRTYDV
GLDFGLFGSRVTGSFDWYTRKSSDLLLNVPAMYVTGFGSYLNNAGELKSNGWDLEITSHN
IKKADFSWSTSFNISHSANKVTKLDGGQTDLLIPSSFDIQHSLLRVGEPLYSIYVVQQNG
ILSQQDIDNGAALFGNEKAGDPRYVDANGDGVIDANDRVIVGHPNPDYVWGITNNFKYKN
FDLSFMFQGQNGGHIYSLLGRALGRTGQGASDNALGFYRDRWRSEEDPGEGRVGKAYSTF
GRIKNTDWLYSSDYWRLRNITLGYNIKDMKLGSQSKLSMVRLFMTLENFWGKDKYDGGVN
PESSNTNLSGSDTYPEAGDYGGLAIPKTITFGLNVNF
NT seq 3174 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaatatcttacgatatggtaccgtagtaatggcccagttggctttgactcaggta
ttatatgctcaagaactgctgaagggaaaagttgttgacgataaaagtcaacctatcagc
ggagtgactatccttgtcaacggcaaaggtagtggaacaacgaatcaaaatggtgaattt
ggtatcgttgccaagccaggggataaaattaccttcaattcgatagaatacctcactaaa
accctcaatgtagctaacctatcgtttttacaagtgaacttgacacctaaacaagaatcg
ctcgatgaagttgttgtcattggctatggcacgcaaaaacagaaaaatctgaccgctccg
gtttctaaatttaaagctgaaaatttggatgaacgcccgatagcccgtgtggaccaagcc
ttaattggacaaattgccggggtacgggtcaaacaatcgacgggtgtccctggcaaaggt
ctcagtgtgcaagtccgtggttcggggtcgatctccgcaggtacagaaccgctatatgtg
gtggacggttttcctttgcaaaatgcgaaaacaaatacatctggaggttattcctccggg
aatccattggataatatgaatccaaatgatattgaatcggtcgaagtattgaaagatgcc
gcggccgcggcaatttacggatcgcgtgcagggaatggggttgtattgattaccaccaaa
cgtggacgtaccggcgaagcaaaactaagtttaaactcttacgtaggtatttcgtcgcct
taccgcaaactggatatgctcaatggagaagaatggatcgatcgccagattgaaatgatc
aatgcccaatgggtagcgtcgggtacaggcagattggccacccagagtaatgaagagcgt
cgcaagatcttagggttacaggatgggacctttaatacgtcgtatatgtacgacgaccgt
tggcttcaaccggggcacccagggctatatatgatcgattggcaagatgaggcttatcgt
aagggaatcacacagaattatcaagtcaccggttcgggggggacagaatatgtcaattat
tatgtttcggggaattatatgaaccagcaggggattgtgcatggcttaaattataaaaat
tatacagcgcgtgccaatgtggaggtgaaagccaataaaaagctaagttttggtttgaat
ttagcaccttcttattccattggtaacgatccggatgtcgagggaaaagataacatcatg
catcagatttactcgatgtcgcctgtgcaagataatcctgctgggacggtgaatgtactt
gacaatgataagtatccttggagtgtgtcaactaacgatccgatcgctaaattgaaaaac
tatctgggcgaaaataaaatctcgcgtttactcggaactatctatggacaatatcatatc
ctggatcatttaacgtttaaaacaacggtcaatttggatcaaacagatagtcggagtaat
aggtttgaaccctatacgatcgctggatcattagcaaacaggctcaccaatccaaatcag
gcaacctatggctctaacagtgtataccgtagacagacctttgtcaatgaaaatacactg
aactactcggtcaatatcgggaagcatgatattacggctttggtaggccaggcctataat
ttcgataaattagaaacttcatcgattacttcgaaagacgggtatatcaatagttcgatt
aaaacattgaatggcgctgtcgctactgttgcttcaaccggggcaacacaaagtattttg
ttgtcctatttcggtcgtgtccaatacgcctttgatggaaagtatctattttcggcaagt
cttcggcgagacggctcttctcgcttcggggccaataccaagtggggtttattcccctcc
ctttcattgggctggcgtctgtcggacgaaaattttatgaaatcgttgagctttatcaac
gatttaaaactgcggggtagttttggtacagctgggaacaataatattgacgattataaa
agtattcccttgctgggcatctataactacgttggaaatgataagtcggtcccggggcaa
gcgccaaaaaatattgcgaatcctgatctaaaatgggaaaaatcgcgtacttacgatgtt
ggattggacttcggactttttggctctcgagttaccggatcttttgattggtatacgcgg
aaaagcagcgaccttttgttgaatgttcccgccatgtatgtaaccggatttggctcttac
ttaaacaatgcgggcgaactaaaaagcaatggctgggatttggaaattacatcgcataac
ataaaaaaagcggatttctcatggtcgacatcgtttaatatcagtcatagtgccaataag
gtaaccaaattggatggcggtcagacggatttattgatcccatcttctttcgatatacag
catagtctcttgcgcgttggagagccgctatatagtatctatgtagtccaacagaatggg
attttgagccagcaagacattgacaatggagctgcattatttggcaatgagaaagctgga
gatccacgttatgtcgatgccaatggtgacggtgtgattgatgccaatgaccgtgttatc
gtcgggcaccccaatccggattatgtttggggtattaccaataattttaaatacaaaaac
tttgatttgagctttatgttccaagggcaaaatggtgggcatatttattctttgttgggt
agagcactgggacgtacgggacaaggtgcttcggacaatgcattgggcttctatcgggat
aggtggcggtcggaagaagatccgggagaaggtcgcgttggaaaagcctattcaaccttt
ggacgtattaaaaatacagattggttgtattcttcggactattggagactgcgtaatata
accttaggctataatatcaaagatatgaagttgggcagccaatctaaactcagtatggtt
cgcctgtttatgactttggagaacttttgggggaaagacaaatatgatggtggagtcaat
cctgagtcgtccaacaccaatctgagcggaagtgatacctatccagaagctggagattat
ggtggtttagcgattccgaagacaatcacctttggtttaaacgtaaatttttaa

DBGET integrated database retrieval system