Solanum pennellii: 107007166
Help
Entry
107007166 CDS
T04130
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat extensin-like protein 4
Organism
spen
Solanum pennellii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_1
LRR_14
LRR_4
LRRNT_2
LRR_ComC
LRR_LRWD1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107007166
NCBI-ProteinID:
XP_015061149
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(1506771..1509782)
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MKEKTQTPICSLFFLVLCFLCCSVFTEHTNAEFTVSENGPLTDSEAQFIKRRQLLYYRDE
FGDRGENVKIDPSMVFENDRIKNAYIALQAWKQAIISDPFNITMNWVGPNVCSYTGIFCA
PALDNPKIRTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLTDLGIFHINSNRFCGTIPRKLSKLKILF
ELDLSNNRFAGKFPYVVLSLPKLIFLDIRFNEFEGNVPSQLFDKPLDAIFINHNRFAFEL
PENFGNSPVSVIVLASNRFHGCLPASIGNMSNLNEAILMNNGLRSCLPAEIGLLKNLTVF
DVSFNQLMGPLPENFGGLVNLEQLNVAHNMLSGTIPKSICQLPKLENFTYSYNFFTGEPP
VCLGLPEFHDQRNCLPNRPVQRSPGQCKAFLSRKIHCSAFKCHKFVPVLPPPPPLSPPLP
APPPPVVVPISPPPSPVYSPPPPVYNPPSPSPPPPPPSPPPPSPPPPVYSPPPPPPSPPP
PPPPPPPSPPPPSPPPPVYSPPPPVYSPPPPPPSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPSPLPY
CVRSPPPPPPNSPPPPPHNSPPPPLAHSPPPPSPYYYNSPPPPPPNSPPPPPNSPPPPPP
TYIYSSPPPPNSPPPYVYSSPPPPHSPPPPSPLPCIEPPPPPPPCIEPPPPPSPSPSPPP
PPMYHYNSPPPPSPSPPPPPVYYYNSPPPPSPSPPPPPVYYYNSPPPPPPSPPPTPVYEG
PLPPVIGVQYASPPPPPFY
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaggagaaaactcaaacacccatttgttctctgttttttcttgtgctctgttttttg
tgttgttcagtgtttactgaacacacaaatgctgagtttactgtttctgaaaatggtcct
ttaactgattctgaagctcagttcatcaaacgcaggcagcttttgtattacagagatgag
tttggtgatagaggtgaaaatgtgaaaattgatccatctatggtgtttgagaatgacaga
atcaagaatgcttatattgctttacaagcatggaaacaagctatcatttcagatcccttt
aatatcactatgaattgggttggtcctaatgtatgcagctacaccggaatcttctgtgct
ccggcgttggataatccgaaaatccgtacagttgccggcattgaccttaaccatggtgac
attgcagggtatctcccggaagagcttggtcttcttacagatcttgggattttccatatc
aattccaatcgtttctgtggtacaataccgagaaagttgagcaagttgaagatactgttc
gagctggatctgagtaataacaggtttgccgggaagtttccttatgttgttttgagttta
cccaagttgatatttttggatattaggttcaatgaatttgaaggtaatgtaccttcgcag
ctttttgataagccattagacgccatttttattaatcataatcgttttgcgtttgagttg
ccggagaactttgggaattcgccggtttctgtgatagtactggcgagtaaccgttttcat
gggtgtcttccggcgagtattgggaatatgagtaatcttaatgaagcgattttaatgaat
aatgggttgcgttcttgtttgccggcggagattgggttgttgaaaaatttaactgtgttt
gatgtgagctttaatcagttgatgggtccgttgccggagaattttggtggtttggtgaat
ttggagcaattgaatgttgcacataatatgctttctggtacgattcctaaaagtatttgt
cagcttccgaagcttgagaattttacctattcttataatttcttcaccggtgaaccgccg
gtatgtttggggttgccggagtttcatgatcaacggaattgtttgcccaacagaccggtg
caacggtctccgggacagtgtaaggcatttttgtctagaaaaattcattgtagtgctttt
aagtgtcataaatttgttcctgttttgccacctccaccaccactttcgccgccgttgcct
gcccctcctccgcctgttgtggtgcctatttctcctcctccgtcgcctgtttattcgcct
ccgccaccagtttataatcctccttcaccttcaccacctccaccaccaccctctccacct
cctccatcacctcctccaccagtctattcaccacccccaccacctccatctcctcctcca
cccccacccccaccaccaccatctccacctccaccatcacccccaccaccagtttattca
ccaccgccaccagtttattcaccgccaccaccgccaccatctccccctccaccatcacct
ccacctcctccgccacccgtttattcaccaccaccacctcctccatcaccattgccttat
tgtgtacgctcacctccacctccaccaccaaattctccacctcctccaccacataattca
ccacctccaccgcttgctcactcgcctccacccccttcaccttattattacaattcacca
ccacctccgcccccaaattcgccacctcctccaccaaattcacctcctccaccaccacca
acatacatttactcatcacctccgccaccaaattcaccaccaccatacgtgtactcttca
cctccgccacctcattcccctccacctccgtccccattgccttgtatagaaccccctcca
ccacctcctccttgcattgaaccacccccaccaccttccccttcaccatctcctcctcca
ccaccaatgtatcattacaattctccgcccccaccatctccatcacctcctcccccaccg
gtatattactacaattctccacccccaccatcaccatcacctcctccaccaccagtatat
tactacaattctccacccccacctccaccatcaccaccgcctactccagtatacgaaggg
ccattgccaccagtaataggagttcaatatgcttcaccacctccaccacccttttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
