Solanum pennellii: 107010275
Help
Entry
107010275 CDS
T04130
Name
(RefSeq) glutamate receptor 3.6 isoform X1
KO
K05387
glutamate receptor, ionotropic, plant
Organism
spen
Solanum pennellii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spen00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
spen04040
]
107010275
Ion channels [BR:
spen04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
107010275
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Peripla_BP_6
SBP_bac_3
Lig_chan-Glu_bd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107010275
NCBI-ProteinID:
XP_015065010
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(49969466..49974297)
Genome browser
AA seq
951 aa
AA seq
DB search
MFLSRLHIFVPKFTMRLFWTLILVVLYNGCSSEGVNSTLSARPKVVNIGCMVSFNTLVGK
VTKVAAEAAVEDINSNPDVLGGTKLNMITLDSNASGFLGIVEAIRFMETDTMAIVGPQSS
VIAHVVSNIANELQVPLLSFAATDPSLSSLQYPFFVRTSPSDKFQMEAIAEMVEYYEWRE
VIAIYIDDDFGRNGIAALADQLAKRRCSISYKAAMKPGATLDDARDALVQVALRESRIMV
VHTYPTKGLEIFSMARYLGMIDKGYVWIATNWLSTILDAGSPLSSDEKENLEGAITLRIH
TPGSELKQKFVSRWSNLTRKAGLTGSSRMSTYALYAYDTVWLLARAINEFFNQGGKVSFS
KDPRLTELNSGSMNLDSMSIFDGGKLLRDNIFKVNMTGVTGPFSFTSEKELFRPTFEVIN
VVGTGFRKVGYWSEYSGLSIVPPETLYSKPPNCSSSNQQLHSIIWPGQITEKPRGWVFPN
NGRQLKIGVPNRASFREFVGKVPGIDSFRGYCIEVFTTAIDLLPYAVPYKLVAFGDGHNN
PDDTELIRLITAGVYDAAIGDIAITTNRTKMVDFTQPYIESGLVVVAPVKEQNSNAWAFL
SPFTPKMWCVTGVFFLIVGTVIWILEHRLNDDFRGPPSKQIVTVLWFSFSTLFTAQRENT
VSTFGRIVLLIWLFVVLIINSSYTASLTSILTVQKLSSPITGIESLVNTKEPIGYQWGSF
ARNYLIQELRIDESRLVPLNLPEDYAKALKDGPSRGGVAAVVDERAYMELFLSSRCQFSI
LGQEFTKNGWGFAFPRDSPLAVDMSTAILKLSENGELQRIHDKWLSGIACTSQNTKLEVD
RLQLKSFSGLFFLCGLACFLALLIYFVMLACQYCQYYPNSEVASESSRSGRLQTFLSFAD
EKEESVRSRSKRRQLEVTSVRSIDQDASVNGSRTDRSEIYSNRVVSFGESV
NT seq
2856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcttgtcaagattgcacatttttgtacccaagttcactatgagactattttggaca
ctaattttagtagttctctacaatgggtgttcttcagagggggttaattcaactctttct
gcaaggcctaaagttgtgaacattgggtgtatggtgtctttcaatacacttgttgggaaa
gttactaaagttgctgcggaagctgccgttgaggatataaattccaatccagatgttctt
ggaggaactaaactgaatatgataacattggacagtaatgccagtggatttcttggaata
gttgaggctatccgtttcatggagacggatactatggcaattgttggcccccaatcttct
gttatagctcatgtggtatcaaacattgcgaatgagctgcaggtccctctattatcattt
gcagccacagatccctctctttcttcgcttcagtacccgttttttgttagaacttcacca
agtgataagtttcagatggaagctatagctgaaatggttgagtactatgaatggagggag
gtgattgctatatatattgatgatgattttggaagaaatggtatagctgcattagcagat
cagctggccaagaggcgatgttcgatctcttacaaagcagcaatgaaacctggagcaaca
ttggatgatgcccgggatgctttggttcaggttgctttgagagagtcacgaataatggtt
gttcatacttatcctacaaagggtctggagatattctctatggcacggtatttggggatg
atagataaaggatatgtgtggattgctacaaattggctctcaactatccttgacgctggt
agtcccctttcttcggatgaaaaagagaaccttgaaggggctattaccttgcgtatacac
actccaggttcagaattgaaacagaagtttgtatcacggtggagcaatttgacaaggaag
gcaggacttactggatcttcaaggatgtccacttatgcactctatgcttatgacactgtg
tggttgcttgctcgtgccatcaatgaattctttaaccagggtggaaaagtttcattttct
aaggatccaaggctaactgaactgaatagtggaagtatgaatcttgattctatgagcatc
tttgatggagggaagttattgcgagacaacatttttaaggttaatatgacaggtgtaaca
ggaccttttagtttcacttctgaaaaggaactcttccgccctacttttgaagtcattaat
gtggttggtacaggttttaggaaagttggttattggtctgaatactctggtttatcaatt
gtgcctcctgaaacactgtactctaagccgccaaattgttcctcttcgaatcaacagcta
cacagtataatctggcctggacaaataacggaaaaaccccgtggatgggtttttccaaac
aatgggagacaactgaaaattggagttcctaaccgagctagctttcgtgaatttgttgga
aaggtaccaggcattgactcattcagaggatactgtattgaggtcttcactactgccata
gacttattgccttatgctgtcccttacaagctagttgcctttggggatggtcataacaat
ccagatgatacagagctaatacgcctaatcacagcaggagtttatgatgcagccataggt
gacatagcgattacaactaatcgaacaaaaatggttgatttcactcaaccatacattgaa
tctgggttagttgtagtggcaccagttaaggagcagaattctaatgcttgggcttttctc
agtccatttactcctaagatgtggtgtgtcactggtgtttttttcttaattgtgggcact
gtaatttggattttggaacacagattgaatgatgattttcgtggacctccgagtaaacag
attgtcactgttttatggttcagcttttcaactctctttactgcccagagagaaaacact
gtcagcacctttggccgtattgtccttcttatatggctatttgtggttttgataataaac
tcaagctatactgccagtctcacctcaattcttacagtgcagaaactttcttccccaatt
accggaattgaaagtttagtaaatacaaaggaacccattggttatcagtggggttcattt
gcccgtaactatctgattcaagaacttcgcattgatgaatctagacttgttccacttaac
ctccctgaagattatgctaaagctttaaaagatggtcctagccgtggtggtgttgcagca
gtggtagatgagcgtgcttatatggagcttttcctctcatcgcgttgccaattcagtatt
ctgggtcaagaattcacaaaaaatggatgggggtttgctttccctagggattctcctcta
gcagtagacatgtcaacagcaattttgaaactatcagagaatggagaacttcaaaggatc
catgataaatggctttctggaatagcttgcacttcacagaatacaaagcttgaagtggac
aggcttcagctgaaaagcttctcaggtctattctttctatgtgggttggcatgttttctg
gctctgctcatttattttgtgatgctagcatgtcaatattgccaatactatcccaattct
gaggtagctagtgaaagttcacgatcaggacgactgcagacattcctttcttttgctgat
gaaaaggaagagtcagtgaggtctcgatccaaacgaaggcaactagaggtgacttcagta
agaagtattgatcaagatgcatcagtaaatggttcaagaactgaccgttctgagatatac
tcgaacagggttgtaagttttggagaatctgtatag
DBGET
integrated database retrieval system