Solanum pennellii: 107014610
Help
Entry
107014610 CDS
T04130
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
spen
Solanum pennellii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spen00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
spen01003
]
107014610
Glycosyltransferases [BR:
spen01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
107014610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107014610
NCBI-ProteinID:
XP_015070073
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(63360595..63366546)
Genome browser
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MKMASKSFKASRSSLSTSSDLPDPQHGKPPLPPHVTFQRRTSSGRYVNYSRDDLDSELSS
SDYMNYMVHLPPTPDNQPMDSISQKVEEQYVSSSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANHP
QMAGAKGSSCAIPGCDAKVMSDERGIDIVPCECDFKICRDCYLDAVKTGDGICPGCKEQY
KVTDWEETNGNNRPLPLTGPGGMSRMERRLSIMKSTKSGLIRSHTSEFDHNRWLFETKGT
YGYGNAIWPKEGGFVNGKDDDIMEPTELMSKPWRPLTRKLKIPAAILSPYRLLIVIRFVV
LGLFLAWRVNHPNNDAVWLWGMSVVCEIWFAFSWILDQLPKLCPINRATDLSVLKDKFET
PSPGNPTGRSDLPGVDMFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGAL
LTFEAMAEAASFANLWVPFCRKHNIEPRNPESYFNLKKDPYKNKVKQDFVKDRRRAKREY
DEFKVRINSLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKQQRQKTDDEPLENVKIPKATWMADGTHWP
GTWLNSGPEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDDPLHGNNEDGIIDLTDVDIRLPMLVYVSREKR
PGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGAFILNLDCDHYVYNSQAIREGMCFMMDRGGDRLCY
VQFPQRFEGIDPSDRYANRNTVFFDGNMRALDGLQGPMYVGTGCLFRRVALYGFDPPRSK
DHQSGCCSCCYGRKKKHVNTSEEHRALRRGDSDDEEMNLSLAPKAFGNSAVLIDSIPVAE
FQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPREHLDASTVAEAISVISCWYEEKTEWGQRVGWIYGS
VTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNA
LLSSSKMKFLQKIAYLNCGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLVYLLII
TVTLCLLAVLEVKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVVAGIEISFTLTS
KSAGDEEDDDFADLYLVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSVIPQWSRLLGGVF
FSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGTTQIGGSFQF
P
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatggcttcaaaatcattcaaagctagtagatcatctctgtcaacatcctcagat
ttgcctgatccacagcatgggaaacccccacttcctccacatgtgactttccaacggcgt
acttcttccggccgatatgtgaactactcaagggatgatcttgatagtgaacttagcagc
agtgactatatgaactatatggtacatctccctccgactcctgacaatcagcccatggat
tctatttctcagaaggtcgaagagcagtatgtatccagttcacttttcacgggtggtttt
aattctgttacacgtgctcatcttatggacaaggtgattgaatcagaggcgaatcatccc
caaatggcgggtgcaaaagggtcgtcgtgcgctatccctggatgtgatgctaaagtgatg
agtgatgaaaggggcattgatattgttccatgtgaatgtgatttcaagatatgcagagac
tgttacctggatgctgtcaaaaccggtgatggtatatgtccggggtgtaaggagcaatat
aaagtcactgactgggaggaaactaatggaaacaatcgtccgcttcctctcactgggcca
ggtgggatgtcaaggatggagagaaggttgtcaattatgaaatcaactaagtcgggattg
attaggagccatacttcagagtttgatcacaaccgttggttgtttgaaacaaagggcaca
tatgggtatggaaatgctatatggccaaaagaaggtggatttgtaaatggaaaagatgat
gatattatggagcctactgaactgatgagcaaaccatggaggccacttacgcgcaaattg
aaaattcctgctgctatcctaagtccttatagacttttgatcgtcattcggtttgttgta
cttggactttttttggcatggagagtgaatcatcccaacaatgatgcagtttggttgtgg
gggatgtctgttgtttgtgaaatatggtttgctttctcttggattcttgatcaattgccc
aagctttgcccgatcaaccgtgcaactgatcttagtgtcttgaaagacaaatttgaaaca
ccaagcccaggcaatcctactgggagatctgatctccctggtgttgatatgtttgtctct
accgctgatccagagaaggaaccccctcttgtgactgctaatactatattgtccattcta
gctgcagattatcctgtagaaaaacttgcttgttatgtctctgatgatggaggtgccctt
ttgacctttgaggcaatggcagaagctgcaagttttgctaatttatgggtaccattttgt
cgtaaacataacattgaacctagaaatccagaaagttacttcaatttaaagaaggatcct
tacaaaaacaaggtaaagcaagactttgttaaggatcgtaggcgggcaaagcgtgagtat
gatgagtttaaggttcgtatcaatagcttgccggattccattcgccgtaggtctgatgct
tatcatgcaagggaagaaattaaggccatgaagcaacagaggcaaaagactgatgatgaa
cctttagagaatgtaaagatcccaaaagctacgtggatggcagatggaacccattggcct
gggacatggttgaattctggaccggagcattccaagggggatcatgctggaataatacag
gtgatgttgaaacctccaagtgatgatccactacatggtaacaatgaagatgggattatt
gacctgactgatgttgatatccgtcttcccatgcttgtttatgtttcccgtgagaagcgt
cctggctatgatcacaataagaaagcaggtgctatgaatgccctggttcgagcatctgcg
atcatgtccaatggtgcatttattcttaaccttgattgtgaccattacgtttacaactcc
caggctatcagggaaggtatgtgttttatgatggataggggaggggatcgtctttgctat
gttcagttcccacagaggtttgagggcattgacccatctgacaggtatgccaatcgtaat
actgtctttttcgatggtaacatgagggcccttgatgggctacagggtccaatgtatgtg
ggaactggatgtctctttcggagggtagccctttatggttttgatccacctcgctccaag
gatcaccagtccggttgctgtagctgctgctatggtcgcaaaaagaagcatgttaataca
tcagaagaacatcgggccttgcgacgaggtgattcagacgatgaagaaatgaatctctca
ctggctcccaaggcttttgggaactcagcagttcttattgattcaattcctgtggcggag
ttccaaggtcgtcctttggcagatcacccagctgtgaagaatggacggcctcctggtgct
ttgaccattcctcgagagcatcttgatgcatcaacagttgcagaggccatcagtgtcatc
tcctgctggtatgaggagaagacagagtggggacaacgtgtcggatggatttatggttca
gttactgaagatgttgtgacaggatacaggatgcacaacagaggttggaagtcagtttat
tgtgttactaaacgtgatgcattccgtgggactgcccctattaatctcactgataggctt
catcaggtccttcgatgggctactggttcagttgaaatcttcttctcccggaacaatgcc
cttctttccagttcaaaaatgaaattcttacagaaaattgcttacctcaattgtggaatc
tatcccttcacatcaatcttcttaatcgtctactgtttccttccagcactgtccctcttc
tccggtcagttcattgtccaaacactcaatgtcacctttcttgtgtacctcctgattatt
acagtcaccctctgcctgcttgcggtgctcgaggtcaagtggtcaggcattgagctggaa
gagtggtggaggaatgagcagttctggctgatcggagggacaagtgctcacttggctgct
gtgcttcaggggctattaaaagttgttgctgggattgaaatttccttcaccttgacgtca
aaatcagctggtgatgaagaagacgatgactttgctgatctgtatctcgttaagtggaca
tccctcatgattccaccaattacaatcatgatggtgaacttgatagcaatagcagttggt
tttagcaggacaatatatagtgttataccacaatggagtcgtctactaggaggtgtattc
ttcagtttttgggttttagcacatctctatccctttgcgaaaggtcttatgggcagaaga
ggcaggacaccaaccattgtctttgtatggtcaggacttatcgcgatcaccatatccctt
ctttgggttgcgattaatcctccagcaggcactacccaaattggaggatcattccagttt
ccgtga
DBGET
integrated database retrieval system
