Solanum pennellii: 107020489
Help
Entry
107020489 CDS
T04130
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1
Organism
spen
Solanum pennellii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
107020489
NCBI-ProteinID:
XP_015076365
LinkDB
All DBs
Position
5:76916260..76924594
Genome browser
AA seq
1431 aa
AA seq
DB search
MAAAGDGRPASSSAYEGGGAGGKFRRRPFRKNQTTPYDRPPTDLRNPSWLTKLVVDPATK
LITSGARRFFSSIFQKRLTPAPTPLPLPPMPLPPPPEARQESKDVQQESCLNDHAGAVVA
TGHEVCKAACSSEDGAFSELEQLLKQKTFSRDEIDRLTELLRSKAVDTPAGNDKGAVATP
VTSSRVPKGNVASAAELAKAYMDTRPSKVSPTILSSQSQVVRVDTPVLKSVSYSQNLPIA
PVTTKTAGLVGVRANGFTPPRSRGRSAIYHMARAPYSRLRLTDGQMASSSTHNAYSGPSL
SESVLEHDGYFGSKQPLKRRSSALEDDIGSVGPIRRTRQKPNLLSHGISRPNLGGVASAA
ADVPTRYAHISSNPSETAAKILEHLENLTPKEKSSESRLTAGSDKTPKKLSPNMLHGQAL
RSLESLDSPKLLQSAQDSHKLENWSEVIPTNDHDSSLQKQGVIEQHRQNESINRPTVVPK
KNEKNSFEDAQHAQPGVETADSLDKKSSVQPQKKHAFRMSALEDSFEMDEDINFDNPASQ
LAEGRDKMGISGAEKKSLSTDEALNKPAALSETNATLGILNKRNDMKAPDAALISISSPS
FLSSSDSQSPEVVAPSFGLNKSKESSGDKVPALLFSSSFPLSGLKPESSSSLSNPAFGLA
GASLELFESDNSQKDGKSNEKLEPLLSGLSPSPLFAAPSSTSTFSNGQFAPSPAISATSL
LASSNSPKDVQSYSSSEVAHSTSISAAVGGGLFGFAAASSVSTEPLTKSGPSEVPSMVST
LSTASTADNADLKAKAANSDNLSSSSPFAGSSFASTSPGNSIFGFSSSGMSTVTTASDQS
QSSVFSTGAQSLVSAQTSLTGSDNTRVSQSVPAHFGSSTTSPVVGNSGMTSFSSVGSASS
NTGIVSAAASDSNPVGSSAAAVGNFSFGASSSTSSTMSSSVGPSSGTAQLSFTFGASPAV
HAATTALATSSNATSAIFSFGNNSSSSSANAVDTSTRPSPSTFNFGGSSSASSLKSVGMS
NSAAPGIFSFGGGSSASSTNAVGTSTNATPSVFSFGGGSSAPSTNTISTSTNATPGVFSF
GGGSSASSTNTVSTSTNATPGVFTFGGGSSASSTNTVSTSTNATPGVFSFGGGSSASSTN
TVSTSTNATPGVFSFGGNSSASPTNTVSTSTSATTGIFNFGASSSVPSTNTVSTSTSAAP
GVFSFGASSSVPSTNAVNASSTVSPSPFAFGASSASSQTSSAAGILGSNWQAPKSPGFSS
PFSSATPTAFAFGASSSSFTPPATTAAVFGSAPSTPSGPSFPFGSTSLTNPSTQSIFGNS
TSPFTASPGNNNQMSMEDSMAEDTMHSSSPAVAFGQPSVSPTPGGFMFGSTPNPFQFGGQ
QNQAAAAAQNPSPFAASGSLGAGGSFSLGSNGPDKSGRKIVKINRNKNRRK
NT seq
4296 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggcggcgggagacggcagaccggcgagttcctcagcctacgaaggcggaggagct
ggaggaaagttccggagacgacctttccgtaagaatcaaactactccttacgatcgacca
ccgactgacctccggaaccctagttggctcacaaagctcgttgtcgatcctgccacgaag
ctcatcacttccggtgctcgacggttcttttcttcgatcttccagaaacgtcttacccct
gctccgacaccattaccactacctccgatgccattgccacctcctccagaagcaagacaa
gaatcaaaggatgtgcagcaggagtcttgtcttaatgatcatgctggagcagtcgtagcc
actggacatgaagtttgcaaagctgcatgcagttctgaggatggtgcattctcagagctt
gagcaactgttgaaacaaaagacattcagcagagatgaaattgaccgcttgacagaactt
ttgcgttccaaagctgtagatacccctgctgggaatgataagggtgctgttgctactcct
gtcacaagttcaagagtccctaaagggaatgttgcatctgctgctgaacttgcaaaagct
tacatggacactaggccatcaaaggtgtcaccgacaattcttagttcgcaaagtcaagtt
gtgagagtagatacaccggtgctaaaaagtgtttcatattcccaaaatttgcctattgca
ccagtgactacaaagactgctggtcttgttggggtccgagcaaatggatttacccctcca
aggtctcgtggaagatctgcaatatatcacatggctcgcgcgccatactccagacttcgt
ctaactgatggtcaaatggcaagtagctccacacataatgcttatagcgggccttcttta
tctgagtcagtcttggagcatgatggatattttggctctaaacagcccctcaaacggaga
agttctgctctggaagatgatatcggctctgttggccccattcgtaggactcgacagaaa
ccaaatctcctatcacatggaatttcacgtcctaatcttggaggagttgcttctgctgct
gctgacgtgcctacaaggtatgctcacatctcttccaatcccagtgagacagctgcaaag
atattggagcatcttgaaaatctgactccaaaggagaagtcatcagaatcaagactaact
gcagggagtgataagacacccaagaaattgtcaccaaacatgcttcacgggcaagctctt
agaagcttggagtctttggattctcccaagctgctacagagtgctcaagacagccataag
ttggaaaattggtctgaggttatcccaaccaatgatcatgattctagtttgcagaagcaa
ggcgtaattgaacaacatcggcaaaatgaatctattaacaggccaactgttgtaccaaag
aaaaatgaaaaaaattcatttgaagatgctcaacatgctcaaccaggtgtggaaactgct
gattcactggataagaagtcttcagttcaacctcagaagaagcatgcttttaggatgagt
gcacttgaggattcattcgagatggatgaggatataaactttgacaatcctgcctctcaa
ttggctgaaggaagagataagatgggtatatctggtgctgaaaagaagtctctgtctacc
gatgaagccctgaacaaacctgctgctctttctgaaacaaatgctaccctggggattttg
aacaaaagaaatgatatgaaggctcctgatgctgctcttatcagcatcagcagccccagt
ttcctgtccagttctgattcccagtcacccgaggttgttgcaccatcatttgggttaaac
aaatcaaaggagtcgagtggtgacaaggttccagctcttctattttcatcatcatttcct
ctctcagggttaaagccagaaagctcaagcagcttatcaaaccctgcttttggcctggct
ggtgcttcattggaactctttgagtcagataactcacagaaggatggaaaaagcaatgag
aaattagaacctttattatctggtttatcaccttcacctttatttgctgctccatcaagc
acttctaccttcagtaatggacagttcgcacctagtcctgctatctcagccacttctctc
ttggcatcaagtaattccccaaaggatgttcagtcttacagttcaagtgaggttgcccat
tccacaagcatttcagctgctgttggtggtggtctgtttggttttgctgcagcatcttca
gtatcaactgaacctcttaccaaatctgggccctctgaagttccatcaatggtgtcaacg
ctatcaacagcttccactgcagacaatgcagacctgaaagccaaagcagctaattctgac
aatttgagtagcagttcaccttttgcgggctcatcatttgcatctacaagtcctggaaat
agtatttttggttttagttcatcaggaatgtctacagttactacagctagtgaccaatct
cagagttccgttttcagcactggagctcagtcacttgttagtgctcaaacttctctcact
ggatcagacaataccagagtctcacagagtgttcctgctcattttgggtcatctactaca
tcaccagtagtgggcaattccggaatgacatctttctcctctgtcggttctgcttcaagt
aatactggcatcgtttctgctgctgcttcagatagcaaccccgttggctccagcgctgct
gccgttggaaattttagttttggggcaagttcttcaacctcatctacgatgagcagttct
gtcggacctagcagtgggacagctcagctgtcgttcacttttggtgctagtccggcagtt
catgcagccaccactgcacttgctacttccagcaatgctacttctgctatatttagtttt
ggtaataattcttcatcttcctcggcaaatgccgtcgacacctctacccgccctagtcct
agcacatttaattttggtggtagttcttcagcttcctcattgaagagtgtcggcatgtct
aatagtgctgctcctggaatatttagttttggtggtggttcttcagcttcttcaaccaat
gctgttggcacctccacaaatgctactccttctgtatttagttttggtggtggttcttca
gctccttcaaccaatactatcagcacctccaccaatgctactcctggtgtatttagtttt
ggtggtggttcttcagcttcttccaccaatactgtcagcacctccaccaatgctactcct
ggtgtatttacttttggtggtggttcttcagcttcttccaccaatactgtcagcacctcc
accaatgctactcctggtgtatttagttttggtggtggttcttcagcttcttcaaccaat
actgtcagcacctccacaaatgctactcctggtgtatttagttttggtggtaactcttcg
gcttccccaacaaatactgtcagcacctctaccagtgctaccactggcatatttaatttt
ggtgctagttcttccgttccgtcaacaaatactgtcagtacctccactagtgctgcccct
ggcgtattcagttttggtgctagctcctcagttccgtcaacaaatgctgtcaatgcctcc
agcacagttagtcctagtccatttgcttttggtgccagctctgcctcttcacaaacttcc
agtgctgctggaattttaggttccaattggcaggcccccaagtctcctggctttagttcc
ccatttagttctgctacccctactgcatttgcatttggagcatcttcatcttcttttact
cctccagccaccactgctgctgtctttggatcagcacccagtacccctagtggaccatcc
tttccatttggttcaacatctttgacaaatccgtctacacagtccatatttgggaactct
acttctccttttactgcttcccctgggaataataaccagatgagcatggaagacagcatg
gccgaggacactatgcattcatcttcccctgcagttgcttttggtcaaccttctgtctcg
cccacacctggcggtttcatgtttggttcaacacctaatccattccagtttggtggccag
cagaatcaggcagctgctgctgctcagaatccatctccatttgcagcatcaggcagttta
ggtgctggagggagtttctcattgggtagcaatggtcctgacaaatcaggtcgaaagatt
gtcaaaattaatagaaataagaacagaaggaagtga
DBGET
integrated database retrieval system