Solanum pennellii: 114075238
Help
Entry
114075238 CDS
T04130
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC114075238
Organism
spen
Solanum pennellii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RVT_2
gag_pre-integrs
rve
Pol_BBD
Retrotran_gag_2
rve_3
RVT_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114075238
NCBI-ProteinID:
XP_027769493
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(59450236..59464620)
Genome browser
AA seq
2605 aa
AA seq
DB search
MAANLRFNCTNNMAEYEACILGFKMAIDMNVHELLVIGDSDLLIHQRYLETGSYPEDATS
NQKKSIHRMALNFFLSGEILYRRTPDLGLLRCVDAFEVANLIEQIHAEVCGTHMNGLTLT
RKILRASYFRITMENDCFKFGVPESIIIDNGVSLKNHLMRVIYEYKGKFAPNWKGPYMVR
KILSGGALVLSEMDGTHGRNRSTQMLSRDTMHELQLLCFDISKFLRSMNMEKSREEKVLP
KFNGVPVDARIISYYLYQRLESMNGLFQSISNNMKSIRNVQLDSKMKDLLFVKKMHLPVF
ASNKPQSLNDEEWEFEHLQGVLDQLSGMGVKFDDEIQGLWLLNTLPDSWETLRVSLTNSA
PSGVVTMEYTKSGVLNEEMRRRSQASSSSASHSDVLVTEDRGRNKSRGQNDRGKSRSKSK
SKYKNITCDYCHKNGHIMKYCYKHKRDMRQQKREGDNENRVAVVANDDLLVSCDANAINL
VRDESSWFVDSGATSHVIGIGTVCLESNNGSKLVLNNVKHAPDVRLNLISVGYLDDEGYV
NTLGVGQWKLTRGLMVVARGDKLSNLYVFQGSMSRDSVNLVENDTSSELWHRRLSHMSEK
GIDSLAKKNLLSGVKQAKLKKCVHCLAGKQKRVSFQSHPPSRKLDLLELVHSDLCGPFKV
RSHGGALYFVTFIDDHSRKLWVFPLKSKDQVLDVFKSFQALVERQTGKTLKCIRSDNGGE
YIGPFDRYCREQGIRHQKTPPKTPQLNGLAERMNRTLVERVRCMLSDAKLSDSFWAEALN
TAAYVINLSPAVALDGDVPDRVWTGKNVSYDHLRVFGCKAFVHKKLVRSRDVVFFEDQTI
EDFDKADKADFQSSESLVDVDPVPLTIAPEENLHNDENQVDNEDGDHVQNDRHDVVDAPV
QDDVRIPSSRYSPNEYVLLTDGGEPESLDEAMESEEKERWFDAMEDEIKSLHDNHTFDLV
KLPKDRKALKNRWVFRVKHEDGNPVPRYKARLVVKGFNQKRGVDFDEIFSPVVKMSSIRV
VLGLAASLDLEVEQMDVKTAFLHGDLDEEIYMEQPEGFEVKGKENYVCKLKKSLYGLKQA
PRQWYRKFGSFMSQQGFKKTSSDHCVFVQKFSDGDFIIVLLYVDDMLVVGHNTCRIQKLK
QELSKSFAMKDLGPARQILGMQIVRDRKAKKLVLSQEKYIQKVLRRFSMDKAKVVSTPLA
MHFKLSTKQCPSSDDEKEDMKKVPYASAVGSLMYAMVCTRPDIAHAVGVVSRFLSNPGRE
HWNAVKWVMRYLCGTSSLSLCFGTGKPILCGYTDSDMAGDVDTRKSTSGYLVTFAGGAVS
WQSRLQKCVALSTTEAELIAVVEACKELLWMKRFLGELGCAQERYVLYCDSQSAIHLGKN
STFHGRSKHIDVRYHWIRDVLDSKLLELEKIHTNDNGSDMMTKALPRGKFEDCCMVMKDL
LFVKKMHLPVFASNKPQSLNDEEWEFEHLQGVLDQLSGMGVKFDDEIQGLWLLNTLPDSW
ETLRVSLTNSAPSGVVTMEYTKSGVLNEEMRRRSQASSSSASHSDVLVTEDRGRNKSRGQ
NDRGKSRSKSKSKYKNITCDYCHKNGHIMKYCYKHKRDMRQQKREGDNENRVAVVANDDL
LVSCDANAINLVRDESSWFVDSGATSLEVIGIGTVCLESNNGSKLVLNNVKHAPDVRLNL
ISVGYLDDEGYVNTLGVGQWKLTRGLMVVARGDKLSNLYVFQGSMSRDSVNLVENDTSSE
LWHRRLSHMSEKGIDSLAKKNLLSGVKQAKLKKCVHCLAGKQKRVSFQSHPPSRKLDLLE
LVHSDLCGPFKVRSHGGALYFVTFIDDHSRKLWVFPLKSKDQVLDVFKSFQALVERQTGK
TLKCIRSDNGGEYIGPFDRYCREQGIRHQKTPPKTPQLNGLAERMNRTLVERVRCMLSDA
KLSDSFWAEALNTAAYVINLSPAVALDGDVPDRVWTGKNVSYDHLRVFGCKAFVHKKLVR
SRDVVFFEDQTIEDFDKADKADFQSSESLVDVDPVPLTIAPEENLHNDENQVDNEDGDHV
QNDRHDVVDAPVQDDVRIPSSRYSPNEYVLLTDGGEPESLDEAMESEEKERWFDAMEDEI
KSLHDNHTFDLVKLPKDRKALKNRWVFRVKHEDGNPVPRYKARLVVKGFNQKRGVDFDEI
FSPVVKMSSIRVVLGLAASLDLEVEQMDVKTAFLHGDLDEEIYMEQPEGFEVKGKENYVC
KLKKSLYGLKQAPRQWYRKFGSFMSQQGFKKTSSDHCVFVQKFSDGDFIIVLLYVDDMLV
VGHNTCRIQKLKQELSKSFAMKDLGPARQILGMQIVRDRKAKKLVLSQEKYIQKVLRRFN
MDKAKVVSTPLAMHFKLSTKQCPSSDDEKEDMKKVPYASAVGSLMYAMVCTRPDIAHAVG
VVSRFLSNPGREHWNAVKWVMRYLCGTSSLSLCFGTGRPILCGYTDSDMAGDVDTRKSTS
GYLVTFAGGAVSWQSRLQKCVALSTTEAELIAVVEACKELLWMKRFLGELGCAQERYVLY
CDSQSAIHLGKNSTFHGRSKHIDVRYHWIRDVLDSKLLELEKIHTNDNGSDMMTKALPRG
KFEDCCMVFQFCIRKFRSTGSKFPI
NT seq
7818 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagctaatctccgatttaattgcacgaacaacatggccgaatatgaagcttgtatc
ctcggtttcaaaatggccattgacatgaatgtccacgagctattggttattggagactca
gatttgttgattcatcagaggtacttagagaccgggagttatcctgaagatgccacatcc
aaccaaaagaagtcgatacaccgtatggctcttaatttctttctaagtggagaaatcctg
tataggaggactccagatttaggtctcctcagatgcgtcgatgcttttgaagtcgcaaat
cttattgaacagatacatgccgaagtttgtggcacgcatatgaatgggctcactttaaca
agaaagatccttcgagccagttatttcaggattactatggaaaatgattgtttcaagttt
ggagtaccagaatctatcattattgataatggtgtgagtcttaaaaatcacttgatgaga
gttatatatgagtacaaaggaaaatttgcaccaaattggaaaggtccttacatggttcgt
aaaatactatctggaggtgctttggtcctgtcggagatggatggcacccatggccgaaac
cgatcaactcagatgctgtcaagagatactatgcatgaacttcaattgctttgctttgat
atcagcaaattcctccgatcgatgaatatggagaagtcaagggaggagaaagttctccca
aaatttaacggtgttcctgtagacgcaagaattatttcatactacttataccagagactg
gagagtatgaatggtttatttcagtcaatttccaacaatatgaagtctataaggaacgtc
cagctagattcgaagatgaaagatcttctatttgtcaagaagatgcatttacctgtgttt
gcttctaataagcctcagtctttgaatgatgaagaatgggaatttgagcatctgcagggt
gttcttgaccagctgtccggaatgggtgtaaagtttgatgatgagatacagggactttgg
cttcttaatactctgccagactcttgggaaactcttcgagtttctttgactaattctgct
cccagtggtgttgtaaccatggaatatactaagagtggtgtcttgaatgaagaaatgaga
agaagatctcaagcctcatcttcttcagcttcacactccgatgttttggttactgaagat
agggggagaaacaagtccagaggtcagaatgatagaggtaaaagtagaagcaagtcaaag
tctaaatacaagaatattacatgtgactattgccacaagaatgggcatatcatgaaatat
tgttacaagcacaagagagatatgagacaacaaaagagagaaggcgataatgaaaatcgt
gttgctgttgttgctaatgatgatcttcttgtttcttgtgatgcaaatgccattaatctt
gttcgtgatgagtctagctggtttgtggattctggtgctacttctcatgttattggcatt
gggacagtttgtttggaaagtaacaatggttccaaactagttctcaataatgtcaagcat
gctccagatgttcgcttgaatttgatttctgtgggatatcttgatgatgagggttatgtt
aatacacttggtgttggccagtggaagcttactagaggtttgatggttgtggcccgtggt
gacaagttgtctaacttgtatgtatttcagggctccatgtccagagactcggtaaatttg
gtggagaatgatacttcatcagagttatggcatagaaggctgagtcatatgagcgagaag
gggattgatagtttggctaagaaaaatttgctttctggagtgaaacaagcaaagttgaag
aaatgtgttcattgcttagccggtaaacagaaaagagtttcttttcagagtcatccgcct
tcaagaaagcttgatttgctggagttggtacattctgatttgtgtggtccttttaaggta
agatctcatggtggtgcactttactttgtgacttttattgatgatcattctcgcaaactc
tgggtatttcctttgaagtccaaggatcaagtacttgatgtgttcaagagttttcaggcc
ttggttgaaagacaaacagggaagacattgaaatgcatccgctcagataatggtggtgag
tatattggtccttttgatagatattgcagagagcagggtattaggcatcagaaaactcct
ccaaagactcctcagttaaatggtttagcagagaggatgaacagaactctagttgagagg
gttagatgtatgctttcagatgctaagctgtcagattccttttgggcagaagcacttaat
actgctgcttatgttatcaatttatctcctgctgttgctttagatggtgatgtccctgac
agagtttggactggtaagaatgtttcttatgatcatcttagagtctttgggtgtaaagcc
tttgtacataagaaacttgttagaagccgtgatgttgtgttctttgaagaccaaacaatt
gaagattttgacaaagctgacaaggctgattttcagagtagtgagagcttagttgatgtt
gatccagttcctttgactattgcaccggaagaaaatcttcataatgatgaaaatcaagtt
gataatgaagatggtgatcatgttcagaatgaccggcatgatgttgttgatgctccagtg
caagatgatgtgagaattccttcatctcgttattctcccaatgagtatgtactcttgact
gacgggggagaacctgagagtcttgatgaggccatggaaagtgaagaaaaagaaaggtgg
tttgatgctatggaagatgagattaaatccttgcatgataatcatacctttgatttggtt
aagttacctaaagacagaaaagctttgaaaaacaggtgggtttttcgggtgaaacatgaa
gatggtaatccagttccacggtacaaagctagattagttgtcaagggatttaatcagaaa
aggggagttgattttgatgagatattctctccagttgtgaagatgtcatccattcgtgtg
gttctaggcttggctgcaagtctagatttagaggttgagcaaatggatgttaaaactgct
ttcctccatggtgacttagatgaagaaatttatatggagcaaccggaaggttttgaagtc
aagggtaaagagaattatgtttgcaaattgaagaagagcttgtatggtttgaaacaagct
cccaggcagtggtacaggaagtttggttcttttatgagtcagcagggcttcaagaagact
tcttcagaccattgtgtttttgtgcaaaagttctctgatggtgactttattattgtgttg
ctttatgttgatgacatgcttgttgttggtcataatacttgcaggattcagaagttgaag
caagagttgagtaagtcttttgctatgaaagacttaggaccagcaaggcagattcttggc
atgcagattgtccgtgatagaaaggccaagaaattggtattatcacaagagaagtacatt
cagaaagtacttcgcagattcagcatggacaaagctaaggttgtcagtacacctttagct
atgcacttcaaattgagcacgaaacagtgtccttctagtgatgatgagaaggaagatatg
aagaaagttccttatgcttcagctgttggtagtttgatgtatgcgatggtttgtacaaga
ccggatattgctcacgctgttggagttgttagccgttttctttctaatccgggaagagaa
cattggaatgctgtgaagtgggttatgagatatctctgtggcacttctagtctgagtttg
tgttttggtacagggaagcctattctttgtggttatactgattcagacatggctggtgat
gttgatactcgcaagtctacttcagggtacttggttacttttgcagggggagctgtgtct
tggcaatctaggttgcaaaaatgtgttgctctatctactacagaagctgagcttattgct
gtcgttgaagcttgtaaagaattgctttggatgaagagattcttgggggaacttggttgt
gctcaagagaggtatgtgctttattgtgacagtcaaagtgctatacatcttggcaagaat
tctacgttccatggtcggtctaaacacattgatgtgagataccattggattcgagatgtg
ttggattctaagttgcttgagcttgaaaagattcatacaaatgacaatggttccgatatg
atgactaaagctttgccaagagggaagtttgaagattgttgcatggtcatgaaagatctt
ctatttgtcaagaagatgcatttacctgtgtttgcttctaataagcctcagtctttgaat
gatgaagaatgggaatttgagcatctgcagggtgttcttgaccagctgtccggaatgggt
gtaaagtttgatgatgagatacagggactttggcttcttaatactctgccagactcttgg
gaaactcttcgagtttctttgactaattctgctcccagtggtgttgtaaccatggaatat
actaagagtggtgtcttgaatgaagaaatgagaagaagatctcaagcctcatcttcttca
gcttcacactccgatgttttggttactgaagatagggggagaaacaagtccagaggtcag
aatgatagaggtaaaagtagaagcaagtcaaagtctaaatacaagaatattacatgtgac
tattgccacaagaatgggcatatcatgaaatattgttacaagcacaagagagatatgaga
caacaaaagagagaaggcgataatgaaaatcgtgttgctgttgttgctaatgatgatctt
cttgtttcttgtgatgcaaatgccattaatcttgttcgtgatgagtctagctggtttgtg
gattctggtgctacttctcttgaagttattggcattgggacagtttgtttggaaagtaac
aatggttccaaactagttctcaataatgtcaagcatgctccagatgttcgcttgaatttg
atttctgtgggatatcttgatgatgagggttatgttaatacacttggtgttggccagtgg
aagcttactagaggtttgatggttgtggcccgtggtgacaagttgtctaacttgtatgta
tttcagggctccatgtctagagactcggtaaatttggtggagaatgatacttcatcagag
ttatggcatagaaggctgagtcatatgagcgagaaggggattgatagtttggctaagaaa
aatttgctttctggagtgaaacaagcaaagttgaagaaatgtgttcattgcttagccggt
aaacagaaaagagtttcttttcagagtcatccgccttcaagaaagcttgatttgctggag
ttggtacattctgatttgtgtggtccttttaaggtaagatctcatggtggtgcactttac
tttgtgacttttattgatgatcattctcgcaaactctgggtatttcctttgaagtccaag
gatcaagtacttgatgtgttcaagagttttcaggccttggttgaaagacaaacagggaag
acattgaaatgcatccgctcagataatggtggtgagtatattggtccttttgatagatat
tgcagagagcagggtattaggcatcagaaaactcctccaaagactcctcagttaaatggt
ttagcagagaggatgaacagaactctagttgagagggttagatgtatgctttcagatgct
aagctgtcagattccttttgggcagaagcacttaatactgctgcttatgttatcaattta
tctcctgctgttgctttagatggtgatgtccctgacagagtttggactggtaagaatgtt
tcttatgatcatcttagagtctttgggtgtaaagccttcgtacataagaaacttgttaga
agccgtgatgttgtgttctttgaagaccaaacaattgaagattttgacaaagctgacaag
gctgattttcagagtagtgagagcttagttgatgttgatccagttcctttgactattgca
ccggaagaaaatcttcataatgatgaaaatcaagttgataatgaagatggtgatcatgtt
cagaatgaccggcatgatgttgttgatgctccagtgcaagatgatgtgagaattccttca
tctcgttattctcccaatgagtatgtactcttgactgacgggggagaacctgagagtctt
gatgaggccatggaaagtgaagaaaaagaaaggtggtttgatgctatggaagatgagatt
aaatccttgcatgataatcatacctttgatttggttaagttacctaaagacagaaaagct
ttgaaaaacaggtgggtttttcgggtgaaacatgaagatggtaatccagttccacggtac
aaagctagattagttgtcaagggatttaatcagaaaaggggagttgattttgatgagata
ttctctccagttgtgaagatgtcatccattcgtgtggttctaggcttggctgcaagtcta
gatttagaggttgagcaaatggatgttaaaactgctttcctccatggtgacttagatgaa
gaaatttatatggagcaaccggaaggttttgaagtcaagggtaaagagaattatgtttgc
aaattgaagaagagcttgtatggtttgaaacaagctcccaggcagtggtacaggaagttt
ggttcttttatgagtcagcagggcttcaagaagacttcttcagaccattgtgtttttgtg
caaaagttctctgatggtgactttattattgtgttgctttatgttgatgacatgcttgtt
gttggtcataatacttgcaggattcagaagttgaagcaagagttgagtaagtcttttgct
atgaaagacttaggaccagcaaggcagattcttggcatgcagattgtccgtgatagaaag
gccaagaaattggtattatcacaagagaagtacattcagaaagtacttcgcagattcaac
atggacaaagctaaggttgtcagtacacctttagctatgcacttcaaattgagcacgaaa
cagtgtccttctagtgatgatgagaaggaagatatgaagaaagttccttatgcttcagct
gttggtagtttgatgtatgcgatggtttgtacaagaccggatattgctcacgctgttgga
gttgttagccgttttctttctaatccgggaagagaacattggaatgctgtgaagtgggtt
atgagatatctctgtggcacttctagtctgagtttgtgttttggtacagggaggcctatt
ctttgtggttatactgattcagacatggctggtgatgttgatactcgcaagtctacttca
gggtacttggttacttttgcagggggagctgtgtcttggcaatctaggttgcaaaaatgt
gttgctctatctactacagaagctgagcttattgctgtcgttgaagcttgtaaagaattg
ctttggatgaagagattcttgggggaacttggttgtgctcaagagaggtatgtgctttat
tgtgacagtcaaagtgctatacatcttggcaagaattctacgttccatggtcggtctaaa
cacattgatgtgagataccattggattcgagatgtgttggattctaagttgcttgagctt
gaaaagattcatacaaatgacaatggttccgatatgatgactaaagctttgccaagaggg
aagtttgaagattgttgcatggtctttcagttttgcatccggaaatttcgatctaccgga
agcaagtttccaatttga
DBGET
integrated database retrieval system
