Thiospirochaeta perfilievii: EW093_03880
Help
Entry
EW093_03880 CDS
T06210
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
sper
Thiospirochaeta perfilievii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEN03875
UniProt:
A0A5C1Q784
LinkDB
All DBs
Position
complement(843612..846671)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MSIGKFSVRNPVLINIAIVTILVLGFLSLNKLPREQFSEVPFFWVNVIVPYPGVSAEDIE
KSVTIPVENELKSIDKLKTIQSVSSEGLSVVRVEFDDGISNSDFESLFQDVRTRFSKVLL
PDGTLPALIDDFSSSDFLPVIEVIISGDSSYDVLANEATLLENRIKSVPEVSGVDIIGLR
EKQVVIEANRLKLNSLGISINEIVRAVSLQNVNVPGGTLETESRDYLLRTVGELDNIENF
NRVIVRRGESNSSVVKVSDIATVLDTYDPKGIISRFNGETSIALRVSKIPRGNSVGVIEG
VKKEIEDLEKKLPVGLKITLSGDSTIQIKDSINVLLNNAIFGLILLVIILLFFVGFRNAM
ITALGIPVTFAITFVVLEYFGETFNTNTLFGMVLVLGLIVDHAIVITENSFRLQHGGLSR
KEAAIQGVNQVVIPVIAATGTTVAAFLPLMILPGTIGKFLRVIPFTVSIALIASTFEAIV
FIPSHYADWPHGKKESVVFQRFTRFQNGFKSLIKSVYSKKKIVLPMLFLVVVAAFSLVPL
LNQDLFSAEDFTLFYIDIEMSPGTPISKTNDITKEFEKKILPLVGNGEIVSVISSVGFSS
GSSGNTSRSNVSQIVVDLSERTQGRTRSITDIMNEVQWETINIPGAENVKFSKATNGPPT
SKPISFRLFGENYDNLISASNSIIGRLSNYSDLYNIENNLEKGSPELRVKLNEDRASALG
LDVLTLGSFLRDSVEGRTATTFFKDNKEVEVIVRYNNDEELSLTYIDELMIPLPDGRLIP
FSSVANIVQGNALGGIKRVDGKREVTIESEAYSNDSVKDINRDIKSYFQEELQNRYPEIE
LVVGGEFADLGNLLFQILRVFLIGLFLIYLILGAQFKSYIQPFLIILTIPFAFAGVILYL
FISKTPFSTTVLYSGVALAGIAVNDSIVLLSFINELREKGYSVRDAIIESAETRLRPILL
TSLTTIAGLLPTAIGIGGKSVVWSPMAGSIIFGLIFSTLTALIVIPLVYGALFDKEGKK
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtataggtaaattttctgtaagaaacccagttcttataaatatagcaattgttaca
attcttgtattaggttttttaagcctaaataaactccctagggagcagttttccgaggtc
ccttttttttgggtaaatgtaattgttccataccctggagtatcagctgaagatattgaa
aaaagtgttaccatacctgtagagaatgagcttaagtctattgataaattaaaaacaatt
cagtctgtaagttcagagggtttaagtgttgttagggtagagtttgatgacggtatatca
aatagtgactttgagtccctctttcaagatgttagaacaagatttagcaaggtccttctt
ccggatggaactcttcctgctttaatagatgacttctcctcatcggactttctccctgtc
atagaggtgataatatctggtgattcctcctatgatgtattagccaacgaggcaacactt
ttagagaataggataaagagtgttcctgaagtttcaggtgttgatattattgggttacgg
gagaaacaggttgtaattgaggctaataggctaaagttaaatagcttaggtatctcaata
aatgaaatagttcgtgcagtctccctacaaaatgtaaatgttccaggaggaaccctagag
acagaatccagagattatctacttagaacagtaggagagttggataatatagagaatttt
aatagggtaattgtaagaagaggtgagtctaatagtagtgtcgtaaaagttagcgatatt
gcaacagttttagatacctatgatccaaagggaattatctctaggtttaacggagagact
tctatcgccttaagagtatctaaaatcccacggggaaactcagttggtgtaatagagggt
gttaagaaagagatcgaagatcttgaaaaaaaactgcctgttggtcttaagatcaccctt
tcaggggactctactattcaaataaaggatagtattaatgttctattaaacaatgctata
tttggtctgattttattagtaataattctactattttttgtagggtttaggaatgctatg
attacagcccttggtattcctgttacatttgctataacctttgtggttttagagtatttt
ggagagacttttaatacaaatactctatttggaatggttttggttctaggattaattgta
gaccatgctatagtaataacagagaatagttttagactacaacatggaggattaagtaga
aaagaggctgcaatccagggggtaaatcaagttgttatcccagttatagccgcaacagga
actacagtagcagcctttcttccattaatgattctacctggaacaataggtaagttctta
agagtaatcccatttacagtatcaatagctttaattgcatctacatttgaagcaatagta
tttattccatcccactatgctgactggccccacgggaaaaaagagagtgttgttttccag
agattcacaaggtttcagaacggattcaagagtttaataaaaagtgtttatagtaaaaaa
aagattgttctacccatgctttttctagttgttgtagctgcatttagtctagtccctcta
cttaatcaggatctttttagtgccgaggattttacacttttttatatagatatcgaaatg
tctccaggaacccctatatctaaaactaatgatataactaaagagttcgaaaagaagatt
cttccattagttggtaatggtgagattgtgtcagttatctcatctgttggtttctcctct
ggaagtagtggtaatacaagcagatcaaatgtatcccaaatagtggttgatctatctgag
agaacccagggtagaacaagatctataactgatattatgaatgaggttcaatgggaaact
ataaatataccaggagctgaaaatgttaagtttagtaaggctacaaatggtcctcccaca
tctaaacctatctcttttagactctttggggagaattatgataatctaattagtgcctct
aactctattataggtagactaagtaactattctgacctttataatatagagaacaatctt
gagaagggaagtcctgagttaagagttaaactaaacgaggatagggcctctgcactagga
ttggatgttttaaccctaggttcatttttaagagatagtgtagagggtagaacagcaaca
acatttttcaaggataacaaagaggtcgaagttattgttagatataataatgatgaagag
ctatctttaacttatatagatgaattaatgatacctttaccagatggtagattgatacca
ttctcttctgtagcaaatattgttcagggaaacgctctaggtggtataaaacgagttgat
ggtaaaagggaggttacaattgagagtgaggcgtactctaatgatagtgtaaaggatata
aatagggatataaaaagctactttcaggaggaattacaaaatagatatcctgaaatagaa
cttgttgtaggaggggagtttgcagatttaggtaatcttctatttcagattttacgagta
tttttaataggtctatttttaatatatcttattttaggagcacagtttaaatcctatatt
caaccttttttaataattttaacaattcccttcgcttttgcaggggttatactctaccta
tttatttctaaaactccattttcgactactgttttatattctggtgttgcactagctggt
atagccgttaatgactctattgttttactaagctttataaatgagttaagggagaagggg
tacagtgttagagatgcaataattgaatctgcagagacaaggttaaggccaatactatta
acatctttaacaacaattgcaggtcttttacctacagctattggaatagggggaaagtca
gttgtttggagtcctatggctggatcaattatttttggattgatattctctaccttaaca
gcactaattgtaataccacttgtatatggagctctatttgataaggaaggaaaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system