Thiospirochaeta perfilievii: EW093_08290
Help
Entry
EW093_08290 CDS
T06210
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
sper
Thiospirochaeta perfilievii
Pathway
sper03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sper00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
EW093_08290
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sper03400
]
EW093_08290
Enzymes [BR:
sper01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
EW093_08290
DNA repair and recombination proteins [BR:
sper03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
EW093_08290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
ResIII
AAA_30
DEAD
AAA_11
Ku_PK_bind
DUF7088
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEN04705
UniProt:
A0A5C1Q9I5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1822032..1825673)
Genome browser
AA seq
1213 aa
AA seq
DB search
MIQEFRVEKDNSININLRENLLLEASAGTGKTYTLERVVLNLIKNIDYNLTIKDILVVTF
TNKATREMKERIRKILISEYKVQEDPQVKYRIEQAISEFDEASIYTIHGFCQNTLQTFPF
ESLSLFNQEINRDSVILENSVWDYLRSLETTDNSKLLEEFYSFRGNKEFSLVVKELMSLY
DRGEFNGELNLFPGTEDSLEIYNMKADFESGNGRLIQLIQTFKMYNPTLMLEASKAMSVS
TRITSFEKVVKGFEGVDISEGFYPFIEKLYTKGFCDNLFKLSSSFLEGKSKKGLTINDID
ETSREIILNTDELFAHLEPLFDGKNFDKNPIDRFLSGEFIKKALKEVDIFYKKRQESMGV
LSYNDLIDNLHKRVMDKGDESLLIALRKKYKVALIDEFQDTDKKQWDIFNRVFGGSKEHN
FLLIGDPKQSIYGFRGADLEIYYKAKESVLEKNRYFLGTNYRSEDGIVTGVNKIFSSVFA
IKGMGNTAQTTFIDANSSGKDSRFIDESNKNIEFLLYDEELEDGKTLTASMCKRGYFNLI
VNKIVYLLNNNKELLPGEISILVENHKDSIFLRDKLLKKSVPVVISKQKNVYKSNEALDL
LNLLKALNRPGGNGEIKTLLLSNIFAYSLKEIHEMEENGGLEILSTVLLEWSQRVVHSGL
ISVWKDVEASSKKGHLQTRLLSTINGERSYTNYKHLIEDLNIIQKSERLNSLGLYQRLHS
LIESSTDDEENSVRLDRDSQAVQIMTIHASKGLEFPVVFFAGGFDSGVKRSSGYGVKYAE
KGGVWTLDFLSRYKSSLLAERDEWEEKKRLYYVALTRAGSKLYLPIFKRSDLLGISSLYS
AQDWDETKLLLEDRAGDKLEMCEQPIHRQLKFSNSKISKELKLALTQKIFDDISREFYVD
KEFYQSEDPGSYKIKQSELNLSFNGVSTGFRDRVTWLSSYSALTRNSHGSTSKEDADRND
DEEVITPEYKKSDELNSFNLPGGATFGDFIHELFEEIDFSKYKLPLDEFLLDEDVENLTV
LGAKKHFDLDWLRGNGLVVKKIIWNTLNSRLPMNGVGVPLGEFGPERRIHEREFYFRVDK
KSRFSTHGLELSVDKGYVKGFIDLILNNNGVLYIADWKSTTIKGEESFSTYSSLNVEKSM
NEHNYHLQGLIYTVALYIHLKKTKENFDYSKDIGGYYYLFVRGMSPESDTGICFYKPLES
EVLSFINDIRGEL
NT seq
3642 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcaagagtttagagttgaaaaagataatagtataaatattaatctaagggagaac
ctgctcttagaagcatcagctggaacagggaaaacatacaccctagagagagtggttcta
aatctaattaaaaatatagattataatctgactataaaagatatccttgtggtaactttt
acaaataaagctactagggagatgaaggagcgaatcagaaaaattttaatttctgagtat
aaagtccaagaggacccacaggtgaaatatagaatagaacaggctataagtgagtttgat
gaagcctcaatctatactatacacgggttttgccaaaatacgttgcaaacctttcccttt
gaatctctctccctatttaatcaagagattaatcgggattctgtaattttagagaactca
gtttgggactacttaaggtcccttgaaactacagataatagtaagcttttagaggagttt
tactcttttagggggaataaggagttctctttagtagttaaagagttaatgagcttatac
gataggggcgagtttaatggtgaattaaatctattccccgggactgaagatagcttagag
atttataacatgaaagctgattttgaaagtggcaatggaagattgatacagcttatacaa
actttcaaaatgtataacccaactctaatgttagaggcatcaaaggcaatgtctgtatca
acaaggattacttccttcgagaaggtggtaaaggggtttgaaggtgtagatataagtgaa
gggttttacccatttatagaaaaactatatacaaagggtttttgtgataatttatttaaa
ttatcttctagtttcctagagggaaaaagtaaaaaaggtttaacaataaatgatattgat
gagacatcaagggagattattttaaatacagatgaattatttgcccatttagaacctcta
tttgatggtaaaaactttgataagaatcctatagataggtttttgtctggggagtttata
aaaaaggccttaaaagaagttgatatcttctataaaaagagacaggagagcatgggtgtc
ctttcatataatgatttaatagataatctacataaaagggttatggataagggtgatgaa
tcccttttaatagctttaagaaaaaagtataaggtagctttaattgatgagtttcaagat
actgataagaagcagtgggatatttttaatagggtttttggtggtagtaaagagcataat
ttcctacttattggtgacccaaaacagtctatatacgggtttcgtggtgcagatttagag
atttattataaggccaaagagagtgttttagagaagaatagatatttcctaggaacaaat
tataggtccgaagatggtatagtaactggtgtaaataaaatatttagtagtgtttttgca
attaaaggaatgggtaatactgcccaaactacatttatagatgcaaatagctcgggtaaa
gatagtcggtttattgatgaaagcaataaaaatattgaatttctactttatgatgaggag
ttagaggatggtaagacactaactgcgagtatgtgtaaaagaggctactttaatcttata
gttaataagattgtatacttattaaataataataaggagctgctacctggggagatatca
atattagtagagaaccataaggactctatctttttaagggataagctactaaaaaagtca
gtacctgtagtaatttctaagcagaaaaatgtatataaatccaatgaagccctggatcta
ctaaatctacttaaagcgttaaatagaccaggagggaatggggagataaagaccctactt
ttatcaaatatttttgcctacagccttaaagagattcatgagatggaggagaatggaggt
ttggagattctttctactgtgttgttagagtggagccaaagagttgttcattccggttta
atctctgtatggaaggatgtggaggctagttcaaaaaaagggcatctccaaacaaggcta
ttgtctactataaatggagagaggtcctatacaaactataaacacttaatagaggattta
aatataattcaaaagagtgagaggttaaatagtcttggtttatatcaaaggcttcatagt
ttgattgagagttcaacagatgacgaagagaactctgtaagattagatagagactcccaa
gcagttcaaataatgacaattcatgcaagtaaagggttagagtttccagtggtctttttt
gctggaggttttgatagtggagtaaaaagaagttcaggttacggtgtaaaatatgcagaa
aaaggtggagtttggactctagattttttatcaaggtataagagttctctacttgcagaa
agggatgagtgggaagagaaaaaaaggttatactatgttgctttaacaagagccggttct
aaactctatcttcctatttttaagagaagtgacttattaggtataagtagcctatactcc
gcccaagattgggatgaaactaaacttctcttagaggatagggcaggggataaacttgaa
atgtgtgagcagccaatacacaggcagttaaaattttctaatagtaagatctctaaagag
cttaaattggctcttactcagaagatatttgatgatatatctagggagttttatgttgat
aaagagttttatcaaagtgaggaccctggtagttacaagataaaacaatcagagttaaat
ctatcctttaatggagtttccactggttttagagatcgggttacatggttatcaagttac
tctgccttaaccaggaatagccacgggtcaacatccaaagaagatgcggatagaaatgat
gatgaagaggttattactccagagtataaaaaatctgatgagctaaatagttttaatcta
ccagggggtgctacatttggagactttatacatgagctctttgaggaaattgattttagt
aagtataaactaccactagatgaatttctgctagatgaggatgttgagaacttaacagtt
ttaggtgcaaaaaagcattttgatttagactggttaaggggaaatggattagtagttaaa
aagattatttggaacactttaaatagtagactgcctatgaatggggtaggtgtccccctt
ggagagtttggaccggagagaagaatacatgagagggagttctattttagagtggataag
aagagtcgtttttcaacccatggattagagctaagtgtagataaggggtatgtaaaaggg
tttattgaccttattttaaataataacggtgttttatatattgctgactggaaaagtact
acaattaagggagaggagagtttctctacatatagcagtttaaatgttgaaaagagtatg
aatgaacataactaccatttgcagggattaatatatacagtagccctttatatacatcta
aaaaaaacaaaggaaaattttgattattctaaagatattggtggttattattacctcttt
gtaaggggtatgagtccagaatctgacacaggaatatgtttttataaacctctagaatct
gaagttcttagttttattaatgatataaggggtgagttatga
DBGET
integrated database retrieval system