Thiospirochaeta perfilievii: EW093_14510
Help
Entry
EW093_14510 CDS
T06210
Name
(GenBank) PDZ domain-containing protein
KO
K04772
serine protease DegQ [EC:3.4.21.-]
Organism
sper
Thiospirochaeta perfilievii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sper00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
sper01002
]
EW093_14510
Peptidases and inhibitors [BR:
sper01002
]
Serine peptidases
Family S1: chymotrypsin family
EW093_14510
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Trypsin_2
PDZ_2
Trypsin
PDZ
PDZ_6
Peptidase_S46
GRASP55_65
Mycop_pep_DUF31
F420_ligase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEN05862
UniProt:
A0A5C1QHY4
LinkDB
All DBs
Position
3126529..3127815
Genome browser
AA seq
428 aa
AA seq
DB search
MLKKILILSLSIFLIGCTTSRSYLESRYINIAEEVLPSVVEIISVGIEEDSKNKWFDFFQ
DQEDFQRDDINTGVGSGVILYKESDSYFILTNKHVVGNLDEVSVLLYNNELLKGSVIGFD
VRFDIAVVKIETDLELSVAEISLSSRLRVGQFVAALGSPMSYAQSISMGIISNIGRFGGP
KDNLSNYIQTDAAINHGNSGGPLVNMKGEVVGINTWISSPTSGNIGLGFSMPIENVYPSF
LSIIENGFVPVGWIGISSYGFPDSDFYNVNSGAFINQVVVGSPAYKTGLLPGDIILGINE
TKISSSEELFLKISLLKPKDIANLKINRYSDELNISLELGESDKNVLETSKNVFPGFILS
ENENGLKIIEILPKSIGLSSGFKKGDIISSINGNRVIELQEFYKFINLGNNQLIITREDK
ELQLELKY
NT seq
1287 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaaaattcttattttatctttatctatatttttaattggatgtactacatca
agaagttacctagaatcaagatatattaatattgcagaggaggttttaccctcagttgtt
gaaataatctctgttggaatagaagaggactcaaagaataagtggtttgatttctttcaa
gatcaagaagattttcaaagagatgatattaatacaggtgttggttcaggtgtaattctc
tataaagagagtgattcttattttatattaactaataaacatgttgttggtaacttagat
gaggttagtgttcttttatataataacgaattattaaaaggtagtgttattggatttgat
gtaagatttgatattgctgttgttaaaattgagacagatttggaattaagtgtagcggaa
atatccctctctagtaggcttcgtgttggacagtttgttgcagcccttggtagtccaatg
agttatgctcaatcaatctccatgggtattataagtaatattggaagatttggaggacca
aaggataatttaagtaactatatacaaactgatgcagcaataaaccatggaaactcaggg
ggtcccttagtaaatatgaagggagaggttgttggaataaatacctggatttcatcccct
actagtggaaatataggtttaggtttttctatgcctatagagaatgtctacccatcattt
ttgagtattatagaaaacgggtttgttcctgttggttggataggcataagctcctatggt
tttcccgattcagacttttacaacgttaatagtggggcatttatcaatcaagttgttgta
ggctcccctgcatataaaacaggactgcttcctggagatataattttaggtataaatgag
actaaaattagctcttcagaagagttatttttaaaaatttcactattaaaaccaaaagat
attgcaaaccttaaaattaacagatattctgatgaactaaatatttctcttgaattagga
gagagtgataagaatgttcttgagacttctaaaaatgtttttccaggttttattttatct
gaaaatgaaaatgggttaaaaatcattgaaatattaccaaaatcaataggtttatcatcg
ggttttaaaaagggtgatataataagttctattaacggtaatagagtcatcgaacttcaa
gagttctacaagtttataaatctgggtaataatcagttaattattactagagaagataaa
gaacttcaattagaattaaagtattaa
DBGET
integrated database retrieval system