Sphingobacterium zhuxiongii: GFH32_12680
Help
Entry
GFH32_12680 CDS
T06292
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
Organism
sphe
Sphingobacterium zhuxiongii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
SdrD_B
Choline_bind_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGA27121
UniProt:
A0A5Q0QDW2
LinkDB
All DBs
Position
3016542..3021809
Genome browser
AA seq
1755 aa
AA seq
DB search
MNKFGRIAIKTFLWIIGSIIALALLIVFLVRLPAVQNYIVGKVTNYLENKIGTQVEIGHI
NITFPKKLVLENVFFADQSKDTLLAGEQLLVDINMFKLLKNTVEINEFELKGITAKINRN
LPDSSFNFSYIINAFATEKESTATADSTSALVFNIDKVLFERIRFVYKDDVIGTSADLYL
NHFDTRIKTFDLTKNMSFNMPKINIDGLQAKIKQWSVVSQDEAPDASDFGINDPSVEASS
LLPNLATEVLGLKNIYVQYDDEASNINTKFDIKELIANVDEIDLNKELVKLKEVKLTNSE
SEVFLGKPAVKAKTDTSASSPINWVVSVEKLGIAHTNVWFKDDTQPRMKGLDYFNLKLTD
LAGAMDNIYYSADSISGNLTNLAVKDHSGFQLKQLKGDFVYTNTGAIVKDFLIETPNSII
RDNIKVSYPSLEAVSNNPSLVEIEATLKKTQIDMRDIRYLAPDLEKEATMKPLMDKKFYI
DGKVLGKLNDLRIPKVEFKTLNNTHLIASAHIKGLPDMNKMYLDLDIRKMTTSRADLNRL
IAPSLLPDSIQLPKNISLVGTFKGGMSGFDTDLKLVTEQGNATVNGRLDMGRDTTYNAFV
SVDNFNLGEFLKQDSVLGYIAAQAQVKGTGLNPKTMIADATGTLKRLDAMGYGYRDIDFD
FTADRGDISANLHSPDPNIQLNASIQANMHGQYPKLYAEMMVDSINLKNLKLMDQNLKYH
GKIIADFETLDLDHLNGSLQIANSSIAYNDERYVLDTVALKAQADTNRNILILSSEFLNA
HLAGKYKLTELGSSIQDIIRTYYNPSNNHDKLEYSPQQFEFSARINNARIIREFLPELEE
LQDITLDGTFNSADKSLMAKLMAPKILYDGTEIENIGMDIITVDSTMYYNALIEHIKVSG
VELRNTVFSGNVIENKVDLGLWIKDKDDKEQYHLGANMSVDANNYNFSLKEDGLMLNYEK
WGINPNNLLSFGKAGVRANDFHLSKDGQEMIIQSKDSTLNAPIDLTFNNFRIETITRMLN
SENLTLGGGINGTATVSRLESSPVFVSDLTIDKFFFGKDTVGNVMLKVNNIKENTYSADV
RITENGNDVQLIGDVIIPPNGDMQIDATLDLKPMTVKTIEAFSMGQLRGSQGDLSGSLRI
TGTSAAPRINGELTFNDAIINASMLNSNMKIDGQKVYFNDQGIAFKQFNLVDSKNNVARL
NGSIRTSTYTDFVFNLNLTTDDFEVMNSTREDNDLFFGKMYVTSNLRITGDLNKPRIDGN
VKANDRTDFNFIVPNEDPGLAQRDGVVKFVDKSDTARANVFARLDSMTTATTLSGYDIAL
NLSTDPQAKFKIILDEGTQDALDIQGIAEINTTIDANDKITMSGTFTVEDGDYTFSFGPI
SKDFRFQKGSTITWNGDPLDARLDITALYSGKFATLELVQNQIGAESQNLYKQRIPFNVK
LILTGELFKPQINFDIDVDENNAVASQDVISKVNIALSNIREDPAELNKQVFSLIALGRF
MSNNPFESLSGGGAELIARSTVSSFLTSQLNNLASDLIKGVELDFNLNSEEDYLTGTAQT
RTDLNVGISKMLFDDRLKITIGSNFEVEGNSRPGEKATNIAGDISLDYQLSKDGRYFARV
YRKNQYQATLQGQFVETGIGFIINMSYDRFKELFMSSKAIAAYNTDSRGFRKRFDVDRMD
TDSIYRDSVRLVIRDSLMKHSPEYRKRIEEEQKQELKKQQEQKDTTKNLPDTSKVTEPKK
AAIKNEEEEGESNEK
NT seq
5268 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaataaattcggccgtattgcaatcaaaacattcttatggataattggttccataatc
gctttggcgttactgatcgttttcttagtccgtcttcctgctgttcaaaattatattgtc
ggcaaggtcacgaactatttagaaaataaaattggtactcaagttgaaatcggacatatc
aacattacatttcccaaaaaattagtactcgagaacgtcttttttgccgatcagtcgaag
gatacattattggcgggggagcaattgttggtggatatcaacatgtttaaactcctaaaa
aacacggttgaaattaacgaatttgagcttaaggggattaccgctaagattaatagaaat
ctacctgatagcagctttaacttttcgtacatcattaatgcatttgctactgaaaaagaa
agtaccgcaactgctgactccacttctgccctcgttttcaatatcgacaaagtacttttt
gaacgaattcgtttcgtttataaagacgacgttataggaacttctgcagacttatattta
aatcattttgacacccgaataaagacctttgatttaacgaaaaacatgtccttcaatatg
cctaaaatcaatattgatggcttacaagcaaaaattaaacaatggtctgtcgttagtcaa
gacgaagcaccagatgcttcagattttggaattaatgacccatcggtcgaagcaagttca
ctgctacctaatctggcgacagaagtgctcggtctaaaaaacatttatgtacaatatgat
gatgaggcttcgaatattaatacgaagtttgacataaaagaactgattgcaaacgttgat
gagattgacctcaataaagaactcgttaaacttaaagaagttaagttaacaaattcggag
tctgaagtttttcttggtaaacctgctgtcaaagcaaagactgacacatcagcgtcgagt
ccaattaattgggttgtctccgtagagaagttaggtattgcgcatacaaacgtttggttt
aaagacgatacacaacctcgaatgaagggactggattacttcaatctgaaacttaccgat
ctcgcgggcgcaatggataatatctattactctgccgactctatctcgggaaatctgaca
aatcttgccgttaaagaccattcaggattccagttaaagcaattgaaaggtgatttcgta
tacaccaatacgggtgctatcgtgaaagatttcttgattgaaacaccaaactcgattatt
cgggataatatcaaggtttcttatccgtcacttgaagccgtttccaacaatccaagtcta
gtagaaattgaagctaccttaaagaaaacacagattgacatgcgtgatattcgatatctc
gccccggatcttgaaaaggaagcgacaatgaaaccattgatggataaaaaattctacatt
gatgggaaggtattgggtaaattaaatgatttaagaatccctaaagttgaatttaagacc
ttaaacaacacgcatcttattgcatcggctcatatcaaaggcttgccagatatgaacaaa
atgtatctagatctggatattcgcaaaatgacaacaagccgagcagatcttaatcgacta
attgctccttccctattgccagatagcatacaattaccgaaaaacatcagccttgtgggt
actttcaaaggtggaatgtctggctttgataccgatttgaaattggtaactgaacaaggg
aatgcaacggttaacggtcgattagacatgggacgcgacacaacctacaatgcattcgtg
tcggtcgacaatttcaatcttggcgaattcttaaagcaagattctgttttaggctatata
gctgctcaagcacaggtaaaaggtactggtttaaatccaaaaacgatgattgctgatgcc
accggaacgttgaaacgtttagatgccatgggctacggataccgagacattgattttgat
ttcaccgccgatcgaggagatatttctgcaaacctacatagtcctgatcccaatatacaa
ttgaatgctagcattcaagcgaatatgcatggtcaatatccgaagctttacgcagagatg
atggttgacagtattaatttgaagaacttgaaattaatggatcaaaatctaaagtatcac
ggtaagatcattgccgattttgagacacttgatttagatcatttaaatggttcgttgcaa
attgcaaactcatcgattgcatacaacgatgagcgttatgtattggatacggtcgcttta
aaagctcaagcggataccaataggaatattttaattttgagttcagaattcttgaatgcg
catcttgcgggtaaatataaattgactgaacttggttcttcgattcaagatattattaga
acatactataatccttcaaacaatcatgacaagcttgaatattcacctcaacaattcgag
tttagtgcgcgcataaataatgcgagaatcatacgagaattcttaccagaactcgaggaa
ctacaagatataacgttggatggtacctttaatagtgctgacaagtcattgatggcgaag
ttaatggctccgaagatcttatatgatggtactgagattgaaaacattggtatggatatc
ataaccgttgatagtacaatgtactataatgctttgattgaacatatcaaagtaagtggt
gtagagttgagaaatacggtattcagtggtaacgttatagaaaacaaagtcgacttaggg
ctttggattaaggataaagacgataaggaacagtaccatcttggtgcaaacatgtccgtc
gatgcaaataattataacttctcattaaaagaagatggtttaatgctgaactatgaaaaa
tggggcattaatccaaacaacttactgagtttcggcaaggcgggcgttcgagcgaatgat
ttccacctttccaaagatggacaggaaatgattatacagtctaaggattccaccttaaac
gcgccaatcgatctgacgttcaataattttagaatcgagaccataacgcgcatgttgaac
tccgaaaaccttacgctgggcggtggtattaatggtacggctactgtatctcgactagag
tctagtcctgtttttgtatcggatcttaccattgataaattcttttttggaaaggatact
gtcgggaatgtgatgttaaaggttaataacatcaaggagaacacatattctgctgatgta
agaatcacggagaatggcaatgatgtacaactaataggagatgttatcattcctccgaat
ggcgatatgcaaattgacgctacattggatttgaagccgatgacagtgaaaaccattgaa
gccttcagtatgggacaattaaggggatcacagggtgatttatcaggttcattacgaatt
acggggacctcagccgctccacgtattaatggagaactaacattcaatgatgcgataata
aacgcctcgatgttaaattctaatatgaaaatcgatggccagaaagtatatttcaatgat
cagggaatagctttcaaacaatttaacttggtagactcgaagaataacgttgctcgcctg
aatggatcaattagaacatcgacatatactgattttgtattcaatctgaatttaacaacg
gacgacttcgaagttatgaactcgacgagagaggataacgacttgttctttggcaaaatg
tacgtaacgtcgaatcttcgaattacaggagatttaaacaagcctagaattgatgggaat
gtaaaagctaatgaccgtacagactttaactttattgtaccaaacgaggatccaggactt
gcacaacgagacggagtcgtaaaattcgtcgataagagcgatacagcacgagcaaacgtt
tttgcacgattagattcgatgacaactgctactaccctatctggttacgatatagcattg
aatttaagtactgaccctcaagcaaaattcaaaatcatacttgatgaaggaacgcaagac
gctttggatattcagggtattgcagaaatcaacacaaccatcgatgcaaacgataaaatt
acgatgtcaggtacctttacagttgaagatggtgattataccttttcatttggtccgata
tccaaagattttagattccaaaaagggagtacaattacttggaatggtgacccgttagat
gctcgtctagatattacggccctttattctggtaaattcgccacattagaacttgttcag
aatcaaattggtgctgagagtcagaatttatataagcaacgaattcctttcaatgtgaag
ttgatattgacaggtgaactctttaagccacagattaactttgatatcgatgtggatgaa
aataatgcggttgcttcacaagacgtgattagtaaggttaatattgctttgtcgaatata
cgtgaagacccggctgaattgaacaaacaagtattctcattaatagcgttaggacgtttt
atgtcgaacaatccatttgagagtctttccggcggtggagcggaattaattgctagaagt
accgtgagttcattcttaacgagtcaattaaataatttagcgtccgatctaattaaagga
gttgaattagacttcaatttaaattccgaagaggactatcttactggaacagctcaaacg
cgaacagacttaaatgtcggtatttcgaaaatgttattcgacgatagattgaagattacg
attggatccaattttgaagtcgagggtaactcaagacctggcgagaaggcgacaaatatt
gcaggtgatatctctttagattatcaattgtctaaagacgggcgctatttcgctcgagtt
tatcgcaaaaatcaatatcaagcgaccttacaaggtcagtttgtcgaaactggtattggt
ttcatcattaatatgagctacgaccgctttaaagaattgtttatgagttcgaaagccatt
gctgcctacaatactgacagccgtggatttagaaagagattcgatgtggatcgtatggat
acggattcaatctatcgtgatagcgtacgtcttgtcattcgtgatagtctaatgaaacat
agcccggaatacagaaaacgtattgaagaggaacaaaaacaagaattgaagaaacagcag
gaacagaaagatacgacaaagaatcttcctgatacaagtaaagtaacagagcctaaaaag
gcagccatcaaaaacgaagaagaggaaggggaatcaaatgagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
