Spiroplasma phoeniceum: SDAV_002174
Help
Entry
SDAV_002174 CDS
T06376
Name
(GenBank) putative helicase
Organism
sphh
Spiroplasma phoeniceum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_30
AAA_19
Viral_helicase1
nSTAND3
DEAD
PhoH
ResIII
nSTAND6
PIF1
AAA_25
Intein_splicing
TsaE
AAA_5
AAA_22
SRP54
AAA
COG4_N
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXF97107
UniProt:
A0A345DSB6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1716899..1720771)
Genome browser
AA seq
1290 aa
AA seq
DB search
MTLIEFTIQGDKYNNKNLLLNLYFLTNPKSKFTDDDVKNLRLKNITTVQGLDTFLKHNIC
IADFFVCLINDQAKIKKDKKGSEKKLYDILIRFKSITLLDQMFDSNLSLTILGDIDPEIG
IVNVKNIFLTAMEKRKQEFETLATGVVLEIADNFRIDEAKLRTIFDSNVMANMKFLTSSF
AKEKERWLQYLRFQEQNLEYKRHNSCLYLNRKLTEYIKIPKTVPIGEKFHDVRFLSHNFW
YVDKKFFTNKNLTISHLFEEIIIVELELLLDNLDKYSILKKLNNLSLANLQINRTYQKDA
PLTLFSFNFSESYVQDGADIYDLGINISETKMQQKDIYDFKKELIKIYMLENNIMQESDI
DHETIKVTINQLEQYQIVNCFYEIKNEDEISFNELNKMIPSYGYLTYIGKGDSTLLRRSN
VILDKISKNDVANPYLINYIFNIEDIKLKTQSNLIMEEQLIFASNNLNGNQQKAITKALN
SQDIFLLQGPPGTGKTEFIAELVYQYAKLGKKVLISSQNHTAIDNVLTRLFKTPLLIPLR
LTSDEVRKKNRFNDFNPDKLIFNNYRFIYAHLSRQYLTKWDGIGSDYENQKYELQKLKAN
AKMLEKEINDYNHYTQKLNTLVTERETIINQKLQYLDYNRKLTIDINNIRNLLDFLVNIN
WAGIVTSTPDLVRLFNKHFGELLQKKNGFQIDDSYSLTETYKKLLTITTDNRLLRDKEIE
LATLKQVSQDLRDDDWMEQLTAVQNEILELKNQVTLKQENIVFQKEQEAFKNDLEQLLHQ
YEEQSVINQNKISEINEDKYEQEISCLEIEIGTLNHKINVLKVEVENIVNSINTIFNLNL
VVKDISGTINEIDKEINKIEQDLNFVLQEKATKFNFVNNMITFLNKNYQISDFLTQENIE
NNHFTAAMERDTINYANQFLQESVNVVAMTATSNQSYAQSKNKVLRDYNISDIDIKKFAF
DVVIIDEVSKLTPMEIFMPLVYGKTVILVGDYRQLPPLMPYQEEDVALINEIYDQNYSYN
DFLELVTNSLFKKIISKCDDSVKEILINQYRSHEDIMRIVNVFYENQLQLGDKTNQNNEK
QHYITVENKDGIKIFDSNKAIYWIDSSKDKTNMNFVYEQGESGSTSLFNWLEVDLTIKTL
ELIEAGYNNLKVKLKKQPKVAVISFYSLHVKKLRRAIKSLKFKNIKVEVSTVDDYQGRET
EIVIVNTVRNPRKQLNSNKEFIKKYERLNVAFSRAKNMLIIIGAVSFFTNIDVEIPTIAN
PNITKTIKAYYEILRIIDSYGLVWSAKDLL
NT seq
3873 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattgatagaatttacaattcagggtgataaatataataataagaatttattgtta
aatttgtattttttaacaaatccaaaaagtaaatttactgatgatgatgttaaaaacctt
cggttaaaaaatattacaacagttcaaggcctagatacttttttaaagcataatatttgt
attgctgatttttttgtttgtttaattaatgatcaggcaaaaattaaaaaagataaaaaa
ggatcagaaaagaagctttatgatattttaattcgttttaaatcaattactttgctagat
caaatgttcgattcaaacttatcattaacaatcttaggcgatattgatccggaaattggc
attgttaatgttaaaaatatttttttaacagcaatggaaaagagaaaacaagaatttgaa
acgttagctactggagtagtgcttgaaattgctgataattttcggattgatgaagcaaaa
ttacgaactatttttgattcaaatgttatggcaaatatgaaatttttgacttcatctttt
gctaaagaaaaagaacgatggttacaatatttacgctttcaagaacaaaacttagaatat
aagcgtcataattcttgtttatatttaaacaggaaattaacagaatatattaaaattcca
aaaacagttccaattggtgaaaaatttcatgatgtaagatttttatcacataatttttga
tatgttgataaaaaattttttactaataaaaatttaacaattagtcatttatttgaagaa
ataattattgtagaattagaactattgttggataatttagataaatattcaatattaaag
aaattaaacaatttaagtcttgctaatttacaaattaatcgtacatatcaaaaagatgct
ccattaacactattttcttttaattttagtgaaagttatgttcaagatggagcagatatt
tatgatttagggattaatatttctgaaacaaaaatgcagcaaaaagatatctatgatttt
aaaaaagaattaatcaaaatatatatgcttgaaaataatattatgcaagaaagtgatatt
gaccatgaaacaattaaagtaactattaatcaattagagcagtatcaaattgttaattgc
ttttatgaaataaaaaatgaggatgaaatatcatttaatgaattaaataaaatgatacct
tcttatggttatttaacttatattggaaaaggggactcaactttacttcgacgtagtaat
gttattttagataaaattagcaaaaatgatgttgcaaatccttatttaattaattatata
tttaatattgaagatattaaattaaagacacaatctaacttaattatggaagaacaatta
atttttgcttcaaataatttaaatggaaatcagcagaaagcaataacaaaagccttaaac
tcacaagatatttttttactgcaaggtccaccagggacagggaaaactgaatttattgct
gaattagtttatcaatatgctaaattaggaaagaaagttttaatttcttcacaaaatcat
actgcaattgacaatgttttaacaagattatttaaaacacctttattgattcctttacgc
ttaacaagtgatgaagttcgtaaaaaaaatcgttttaatgattttaatccagataaatta
atttttaataattatcgttttatttatgctcatttatcacgacaatatttaacaaaatga
gatggaattggaagtgattatgaaaatcaaaaatatgaactacaaaaattaaaagcaaat
gctaaaatgttagaaaaagaaattaatgattacaatcattatactcaaaagttaaataca
ttagttactgagcgagaaacaatcattaatcaaaaattgcaatatttagattataatcga
aaattaacaattgatattaataatattcgtaatctattagatttcttagttaatattaat
tgagctggaatagttacttcaactccggatcttgtccgattatttaataaacattttggg
gagttgttgcaaaaaaaaaatggatttcaaattgatgattcatattcattaacagaaaca
tacaaaaaactattaacaattactactgataataggttgttaagggataaggagatagaa
ttagcaacattaaaacaagttagtcaagacttacgtgatgatgattgaatggaacaatta
actgctgttcaaaatgaaattttagaattaaagaatcaagttacattaaaacaagaaaat
attgtgtttcaaaaggaacaagaagcatttaaaaatgaccttgaacaattattacatcaa
tatgaagaacaaagtgttattaatcaaaacaaaattagtgaaattaatgaagataaatat
gagcaagaaatttcttgtttagaaattgaaattggaacattaaatcataaaattaatgtt
ctaaaagttgaagttgaaaacattgttaatagtattaatacaatttttaatttaaattta
gtagtaaaagatattagtggaacaattaatgaaattgataaagaaattaataaaattgaa
caggaccttaattttgttctacaagaaaaagcaacaaagtttaattttgtaaataatatg
attacctttttaaataaaaattatcagatatcagattttttaacacaagagaatattgaa
aataatcatttcacagcggcgatggaacgagatacaattaattatgctaatcaattttta
caagaaagtgtcaatgttgttgcaatgactgcgacttcaaaccaatcatatgcacaaagt
aaaaataaagttttacgggattataatatttctgatattgatattaaaaaatttgctttt
gatgttgttattattgatgaagtaagtaagttaacaccaatggaaatttttatgccatta
gtatatggtaaaactgttattttagttggtgattatcggcaattgccaccacttatgcca
tatcaagaagaagatgttgcgttaattaatgaaatttatgaccaaaattatagttataat
gattttttagaattagtaactaattcattatttaaaaaaattatctcaaaatgtgatgat
tcagtaaaagaaattctaattaatcaatatcgtagtcatgaagatattatgcgaattgta
aatgttttttatgaaaatcagttgcagttaggtgataaaactaatcaaaataatgaaaaa
caacattatattactgttgaaaataaagatggtataaaaatttttgatagtaataaagca
atttattgaattgattcatcaaaagataaaactaatatgaattttgtttatgaacaaggt
gaaagtggtagtacgagtctttttaattgattagaagttgatttaacaataaaaacatta
gaattaattgaagcaggatataataatttaaaagttaaattaaaaaaacaacctaaagtt
gcagttattagtttttatagtctacatgttaaaaaattacgaagagctattaaaagttta
aaatttaaaaatattaaagtagaagtttcaacagttgatgattatcaaggacgagaaacc
gaaattgttattgttaatacagttcgcaatcctcgtaagcaattaaattctaataaagaa
tttattaagaaatacgaacggttaaatgttgcattttcaagagcaaaaaatatgttaatt
attattggagcagttagtttttttactaatattgatgttgaaattccaacaattgctaat
ccaaatattacaaaaacaattaaagcatattatgaaattttacgaattattgatagttat
ggtcttgtttgaagtgcaaaagatttattataa
DBGET
integrated database retrieval system
