KEGG   Spiroplasma phoeniceum: SDAV_002221
Entry
SDAV_002221       CDS       T06376                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
sphh  Spiroplasma phoeniceum
Pathway
sphh03030  DNA replication
sphh03410  Base excision repair
sphh03420  Nucleotide excision repair
sphh03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sphh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SDAV_002221
   03410 Base excision repair
    SDAV_002221
   03420 Nucleotide excision repair
    SDAV_002221
   03440 Homologous recombination
    SDAV_002221
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:sphh03032]
    SDAV_002221
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:sphh03400]
    SDAV_002221
Enzymes [BR:sphh01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SDAV_002221
DNA replication proteins [BR:sphh03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     SDAV_002221
DNA repair and recombination proteins [BR:sphh03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     SDAV_002221
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SDAV_002221
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N DNA_polI_exo1 5_3_exonuc HHH_2 HHH_5 Tcp10_C BT_3987-like_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXF97154
UniProt: A0A345DSG3
LinkDB
Position
complement(1756183..1758792)
AA seq 869 aa
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATVYNGEMLKSFDGTPTNAVYAFANMLNKILKTNNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLVDYKDGRSKTPNELILQFPIVKEFLDSYQIPFLEQEGYEADDLLGCL
AVMAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDETVLRAKWGITPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGEKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEQIKGALQQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTQFSPNQEKLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNSTENSNIKVK
IIEEWCSEFNENNTTVYLELLDENYHTAEIIGFGIVNSKGVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DTKYQKLTYHAKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDELFYGKGVKKQIPADVIKLSHFIGEKAAYINKLRPKIIELLKANQQYDLYYKIELPTA
FALARMEINGVKVNQHELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQDL
SLPDRKKGSTSQETLEEIKNNHVIIPNILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDDVQKEVRKIFVVSSPNNVLLSCDYSQIELRILAHMSK
DQDLIAAFNKNEDIHTNTAMKIFNLSKNEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI
SVAKAKAIINNYYQQFPTIKAFIDQQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVPEINDRNYMQREFG
KRIAMNMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI
VKTFMEDSIKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK
NT seq 2610 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaagtattgttaattgatggaaattctttgctttttagagcattttatgccaca
gtgtataatggcgagatgttaaaaagtttcgatggaacaccaacaaatgctgtttatgca
tttgcgaatatgttgaataaaatattaaaaacaaataactactatagtgttgttgttgct
tttgataaaggaaaaaagaattttcgtcatgatttattagttgactacaaagatggtcgg
agtaaaacgccaaatgaattaattttacaatttccaattgtaaaagaatttttagatagt
tatcaaattccatttttagagcaagaaggatatgaagctgatgatttattaggatgttta
gcagtgatggctgaaaaagaagatttttatgttgatattttttcaagtgataaagattta
tatcaattaattactaataaaacaaatattttagtgccacgtcaaggcgacagtgctgat
gttattgatgaaacagttttaagagcaaaatggggaattacaccattacaagttcctgat
ttaaaagggctaatgggtgatccttccgataatttaaagggtgttccaaaggttggtgaa
aaaacagcaataaaattaattaaggaatatcattcaattgaaaatttatatgataatatt
gagcagattaagggtgcattacaacaaaatttattaaatcataaggaaagtgcattatta
tgcaaaaagatagctactattttttgtgatattaatttagaacattttacttttactcag
ttttcaccaaatcaagaaaaattaatgcaattttatttaaaatataatatgaattcattt
gtaacaaagttgtttaataatcaagataatagtaccgaaaactcaaatataaaagtaaaa
attattgaagaatgatgttccgaatttaatgaaaataacactactgtttatttagaatta
ttagatgaaaattatcatactgcagaaattattgggtttggaattgttaattcgaaaggt
gttttttattttgattatattcatgcaaagcatgataaactatgacatcaatttttaaat
gatactaaatatcaaaagttaacttatcatgcaaagagtttaattgttgctttagctcgt
gataatatttttgttcaaaatattgagtatgatatgatgctagctggttatgtttataat
tcaaatgcaaaaaatagtttagatacttatattaatttatttgaaaaaaaacaaatttta
actgatgaattattttatggcaaaggggttaaaaaacaaattcctgctgatgtaattaaa
ttaagtcattttattggtgaaaaagcagcgtacattaataaattaagaccaaaaattatt
gagttattaaaagctaatcagcaatatgatttatattataagattgagttaccaacagct
tttgcattagcacgaatggaaattaatggtgttaaagttaaccaacatgaattaacaaca
caaaccttacgaattgaaaaaattgtgcaagaattaaataatgaaattaatgatattgca
caaaaagaaattaatcctaattcaccaaaacaaatttcagaattattatttcaagatctt
tcattacctgatcggaaaaaagggtcaacatcacaagaaacattagaagaaataaaaaat
aaccatgttattattccaaatatattagattatcgaaagtatcaaaaattatattcaact
tatttaaaagggatggaaaaatatatttttgctgatgggaaagttcatacaatttataaa
caaaccttaacaaatactggtcggctttcatctgtggaacctaatatgcaaaatattagt
attcgtgatgatgttcaaaaagaggtacgaaaaatttttgttgtttcatcgccaaataat
gttttattatcttgtgattattcacaaattgaattacgaattttagcacatatgtcaaaa
gaccaagatttaattgctgcttttaataagaatgaagatattcatactaatactgcaatg
aaaatttttaatttatcaaaaaatgaaattacaccaaatattcgtcgtagtgcgaaagct
gttaattttgggattatttatggaattagtgattttggtttagcaactgatttaaatatt
tctgttgcaaaagcaaaagcaataattaataattattatcaacaatttccaacaattaag
gcttttattgatcaacaagttgagttttgtaaacaaaatggttatgttacaacaattttt
aatcggaaacgttatgttccagaaattaatgaccgtaattatatgcaacgtgaatttgga
aagcggattgcaatgaatatgccaattcaaggtagtgcagcggatattattaaaattgct
ttaaaaaatattgaccaagaatttttaaaattaaatttaaaagcaaaaattattgcacaa
attcatgatgaattaatttttgaaattccgcaagttgaattaattcaagtgcaaaaaatt
gttaaaacatttatggaagattctattaaattagatgtaaagttaatagttgatatgaaa
actggtttaagttgatatgatttaaaataa

DBGET integrated database retrieval system