Spiroplasma phoeniceum: SDAV_004
Help
Entry
SDAV_004 CDS
T06376
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
sphh
Spiroplasma phoeniceum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sphh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sphh03032
]
SDAV_004 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sphh03400
]
SDAV_004 (gyrA)
Enzymes [BR:
sphh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SDAV_004 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
sphh03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SDAV_004 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sphh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SDAV_004 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
SIS
Toprim_C_rpt
NTase_sub_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXF95022
UniProt:
A0A345DLD4
LinkDB
All DBs
Position
4798..7263
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MMKSENDGYDYDGKIRDIDIADEMKNGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMW
DLKMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMD
GDAPAAMRYTEAKMSKIAGELIKDIEKETTIFIDNYDGSEEEPTFLPGYFPNLLVNGASG
IAVGMATNIPPHNLNEVIDGVIAVTKNPEITTVELMKIIKGPDFPTGALITVGNGLIKAY
ETGNGAITIRSKIDIEENNNKRRIIVSEIPYQINKAKLLERIAELIRDKIINGISDLRDE
SNMEGVRIVLELKRDAQENVILNKLYKLTPLQTNFSLNILALYKNQPRVMGLKQILKYFI
EHQIDIIIKRSQFELKKNCNRLIILEGLKIALDNINEVITIIKQSQTTQIASNALINKFN
LVVEQARAILEMRLQRLTGLEIEKIINEIKDIKVAITELEEIINNSEKQINIMIKELTEI
KKKYGDERRSHIIKEELTEIDPEELIRREDILIMLTQDGYVKRVADDTFKLQNRGGKGII
GLANIEDSLKKIISANSIDSLLIFSNFGKVYKLRAYQIETYSRHARGLPIINLIAIDKTE
SIQTIIAIDESISKEDNLFFVTKKGLIKKTKISEFNQIRQTGKVAIELKDNDELVSVIIT
KGHDDVIIGNNIGKVIRFNEEEIRPMTRQSVGVKGIANDAVGETIGVSSGRYGKYVLSVT
ENAYAKKTAIEDYRLTGRNTNGVKSMNLTYKTGYLKFVQAVNGDEDILVGTKKGNIIRVS
LEQIPLFGRTTSGVKIMRLEQGDKLEVIEILKKKIIIERER
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaatcagaaaatgatggatatgattatgatggtaaaattcgtgatattgatatt
gctgatgaaatgaaaaatggctttttagattatgcaatgtcagttattgtttcacgtgca
attcctgatgttcgtgatggattaaaaccagttcatcgccgtattatttatgcaatgtga
gatttaaaaatgacttacgataaacaacataagaaatcagctcgaattgttggtgaagta
attgggaaatatcatccccatggtgatactgctgtttatgaagcaatggttcggatggca
caagatttttcttatcgttatcctttaattgatgggcatggaaattttggttcaatggat
ggtgatgctccagcggcaatgcgatatacggaagcaaaaatgagtaaaattgctggtgaa
ctaatcaaagatattgaaaaagaaacaacaatttttattgacaattatgatggcagtgaa
gaagaaccgacttttttaccaggatattttccaaatttattagttaatggtgctagtgga
attgctgttggaatggcaactaatattccacctcataatttaaatgaagtaattgatggt
gttattgcggtaacaaaaaatcctgaaataacaactgttgaattaatgaaaattattaaa
ggacctgattttccaacaggagcattaattacggttggaaacggcttaattaaagcttat
gaaacagggaatggagcaattacaattcgttcaaaaattgatattgaagaaaataataat
aaaagacgaattattgtgtcagagattccatatcaaattaataaagcaaaattgttggaa
cgaattgcagaattaattcgcgacaaaattattaatggaattagtgatcttcgtgatgaa
tcaaacatggagggagttcgtattgttttagaattaaaacgtgatgctcaagaaaatgtt
attttaaataagttatataaattaacaccacttcaaactaatttttcgttaaatatttta
gcattatacaaaaaccaaccaagagtaatgggtttaaaacaaattttaaaatattttatt
gaacatcaaattgatattattattaaacgtagtcagtttgaattaaagaaaaattgtaat
cgtttaatcattttagaaggattaaaaattgcgcttgataatattaatgaagtaattaca
attattaaacaatcacaaacaacacagattgcatcaaatgctttaattaataaatttaat
ttggtagttgaacaagcacgagcaattttagaaatgcgcttacaaagattaactggatta
gaaattgaaaaaattattaatgaaattaaagatattaaagtagcaataactgaattagaa
gagattattaataatagtgaaaaacaaattaacattatgattaaggaattaacagaaatc
aagaaaaaatatggtgatgagcggcgtagtcacattattaaggaagagttaacagaaatt
gatccagaagaattaattcgccgggaagacattttaattatgttaacacaagatggttat
gttaaacgagtagctgatgatacttttaaattacaaaatcgtggtggaaaagggattatt
ggtttagcaaatattgaagatagtttaaaaaaaattattagtgctaatagtattgactca
ttattaattttttcaaattttggaaaagtgtataaattacgagcttatcaaattgaaaca
tattcacgacatgcacgggggttaccaattattaatttaatcgcaattgataaaacagaa
agcattcaaacaattattgctatagatgagtcaatttcaaaagaggataatttatttttt
gtgacaaaaaaaggtcttattaaaaaaacaaagataagtgaatttaatcaaattcgtcaa
acaggaaaagtagcaattgagttaaaagataatgatgaattagtaagcgtgattattaca
aaaggacatgatgatgttattattggaaataatattggaaaagtaattcgatttaatgaa
gaagaaattaggccaatgacacgacaatcagtaggggttaaaggaattgctaacgatgct
gttggagaaaccattggagtgagttcaggacggtatggtaaatatgttttatcagtaact
gaaaatgcttatgcaaaaaaaacagcaattgaagattatcgtttaacaggacgaaatact
aatggtgttaagtcaatgaacttaacatataaaacaggatatttaaaatttgttcaagct
gtaaatggtgatgaagatattttagtaggaacaaaaaaaggaaatattattcgtgtttcg
ctagaacaaattccattatttggtcgaacaacatcgggtgttaaaattatgcgattagaa
caaggtgataaattagaagttattgaaattttaaaaaagaaaattatcattgaaagagaa
agataa
DBGET
integrated database retrieval system
