Spiroplasma phoeniceum: SDAV_00558
Help
Entry
SDAV_00558 CDS
T06376
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
sphh
Spiroplasma phoeniceum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sphh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
sphh03019
]
SDAV_00558
03009 Ribosome biogenesis [BR:
sphh03009
]
SDAV_00558
Enzymes [BR:
sphh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
SDAV_00558
Messenger RNA biogenesis [BR:
sphh03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
SDAV_00558
Ribosome biogenesis [BR:
sphh03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
SDAV_00558
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
UvrD-helicase
AAA_19
Flavi_DEAD
PhoH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXF95549
UniProt:
A0A345DMW1
LinkDB
All DBs
Position
complement(410046..411428)
Genome browser
AA seq
460 aa
AA seq
DB search
MSNFNQFGFKRFLNLGLAELKFVEPTIVQEKVMPLLLKHQNVICKAHTGTGKTFAFCLPI
LNNINYEQAKNQSIIVTPTRELAKQIYDNIRFFKKFKLNLQVNYFIGGEDIKRQIEQLQR
IQPHIIIATPTRLKDLFEQQSLNLGKLTTFIIDECDMIFDLGFIENVDYILSKVNPNVQV
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RKAEIDEFKKQVRRSHIKESIKKIKKEKAKERANKLFNKN
NT seq
1383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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taa
DBGET
integrated database retrieval system
