Spiroplasma phoeniceum: SDAV_00567
Help
Entry
SDAV_00567 CDS
T06376
Name
(GenBank) putative DNA primase
KO
K02316
DNA primase [EC:
2.7.7.101
]
Organism
sphh
Spiroplasma phoeniceum
Pathway
sphh03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sphh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SDAV_00567
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sphh03032
]
SDAV_00567
Enzymes [BR:
sphh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.101 DNA primase DnaG
SDAV_00567
DNA replication proteins [BR:
sphh03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Initiation Factors
Initiation factors (bacterial)
SDAV_00567
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNAG_N
Zn_ribbon_DnaG
Toprim_2
Toprim_4
Toprim
Toprim_3
DnaB_bind
Holin_SPP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXF95558
UniProt:
A0A345DMX0
LinkDB
All DBs
Position
complement(417255..419135)
Genome browser
AA seq
626 aa
AA seq
DB search
MALISNEKIDLIKSKVNIVTVMSKYLSLEKRGRNYWAVCPFHQDSHPSMSISPEKQIYRC
FACSAGGNVFTFLQEYENISFIEALKKVAVMTNISLYELTTYQEKPKYDKSEQLIFEINA
LASAYFSNNLETKKAYDAKEYLTKRNINNTEIELFQIGYAESGFDHLYHFLIKKEYSIND
IQQAGLITIKNGKVYDYFNNRLMFPIKNEDSYIIGFSGRVIGVNNQVAKYLNTPETKVFK
KEQLMYNIHRAKPFIRQQNNLILLEGYMDVISLEKLNLKNTVALMGTNLSEYHLKEIKRL
TNECLIFLDGDKAGINASLKATIKLLSHNLKVKIVLNETQQDPDELVNSGQGELIHTMLA
NAQHPINFALDYFQNKFNLQAANELEEFINIVAPLIKASPNQLEQELAVNNLVKITGISK
ETITTKIGQIKTYQKAVFSPAVSEPIPNGTNDNNYQQKSPPRFKPQQSKTVVVKNTKYKI
KNLKRYLLAEQNMVLQLLGSRKAADFYQRKIGNLNFDGYRLLANDIITYYNGHLGAENVK
INMLCQEISDPNLKKILMDIINKSTIKIKYNKKELEDYALLIDDFANEKEIAMLWNKLEK
ASNLIEQQAISMEIDKLNQRLKFKKG
NT seq
1881 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattaattagtaatgaaaaaattgatttaattaagtcaaaagtaaatattgttacc
gtaatgtcaaaatatttatcgcttgaaaaacggggtcgtaattattgagcagtttgtccg
tttcatcaagattcacatccttcaatgagtatttcaccagaaaagcaaatttaccgttgt
tttgcttgttcagctggaggcaatgtttttacttttttacaagaatatgaaaatattagt
tttattgaagctttaaaaaaagttgcggtaatgaccaatatttccttatatgaattgact
acttatcaagaaaaaccaaaatatgataaaagtgaacagttaatttttgaaattaatgcc
ttagcaagcgcttactttagtaataatttagaaaccaaaaaggcttatgatgcaaaggaa
tatttaacaaagcggaacattaataatactgaaattgaattatttcagattggttatgct
gagagtggctttgatcatttgtaccattttttaattaaaaaagaatattcaattaatgat
attcaacaagcgggtttaattacaataaaaaatggcaaggtgtatgattattttaataat
cgtttaatgtttccgattaaaaatgaagatagttatattattggtttttctggacgagta
attggggttaataaccaggtagcaaaatatcttaatactcctgaaactaaggtttttaaa
aaagaacaactaatgtataatattcaccgggcgaaaccgtttattcgccagcaaaataat
ttaattttacttgaaggatatatggatgttattagtttagaaaaattaaatcttaaaaat
accgttgctttaatgggaactaatttaagtgaatatcatttaaaagaaattaaaagatta
acaaatgagtgtttaatttttttagacggtgataaggctgggattaatgctagtttaaaa
gcaacaattaaattattaagtcataatctaaaagttaaaattgttttgaatgagacgcaa
caagaccctgacgaattagttaatagtggtcagggagaattaattcatacaatgttagca
aatgcccaacatccaattaattttgctcttgattattttcaaaataaatttaatttacaa
gcagcaaatgaattagaagaatttattaatattgttgcacctttaattaaagctagtcca
aatcaattggaacaagaattagcagttaataatttagttaaaataacaggaatatctaaa
gaaacaattacaacaaaaattggacaaattaaaacatatcaaaaagcagttttttcacct
gctgtgtcagaaccaattcctaatggaacaaatgataataattatcagcaaaagtcgcca
ccaaggttcaaaccacagcaaagtaagactgttgtagttaaaaatacaaaatataaaatt
aaaaatttaaaacgatatcttttagcagaacaaaatatggttttacaattacttggttct
cgaaaagcagcagatttttatcaaagaaaaattggaaatttaaattttgatggttatcgt
ttgttagcaaatgatataattacttattataatggacatttgggggcagaaaatgttaaa
attaatatgttgtgtcaagaaataagtgatccaaatttaaaaaaaatattaatggatatt
attaataaatcaacgattaaaattaaatataataagaaagaattagaagactatgcgctc
ttaattgatgattttgctaatgaaaaagagattgcaatgctatgaaataagttagaaaaa
gcaagtaatctaattgaacaacaggcaatttcaatggaaattgacaagttgaatcaacga
ttaaaatttaaaaaggggtag
DBGET
integrated database retrieval system
