KEGG   Spiroplasma phoeniceum: SDAV_00571
Entry
SDAV_00571        CDS       T06376                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
sphh  Spiroplasma phoeniceum
Pathway
sphh03030  DNA replication
sphh03430  Mismatch repair
sphh03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sphh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SDAV_00571
   03430 Mismatch repair
    SDAV_00571
   03440 Homologous recombination
    SDAV_00571
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:sphh03032]
    SDAV_00571
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:sphh03400]
    SDAV_00571
Enzymes [BR:sphh01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SDAV_00571
DNA replication proteins [BR:sphh03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SDAV_00571
DNA repair and recombination proteins [BR:sphh03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SDAV_00571
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 DNA_pol3_a_NII RNase_H_2 DNA_pol3_a_NI TNF
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXF95562
UniProt: A0A345DMX4
LinkDB
Position
complement(422276..426634)
AA seq 1452 aa
MDQQLIKLFTANNLEFIGNYFDDAKVIKAEYSTSEGFFRVVIEINDFLPLEVLLKLEQTL
LENETLPTKISLRVRKEQYELETIFSYLEYIRLNKSELKNSFFSKLSPERFALTDNILKI
TVHSESEQKLVGEHCNYYQKKLRRYGFSDLQLALVFHLRENNILEINEQELIKYKETAQK
TEQLISKPTNGTNPVWRELNSYQRAKNGEASYERLIDIDQDAPNVTIYGKILSKERQLIS
TKKFIYVITITDYSDTIGAKFFTRTEQPDDFIEELKTNEWVSLFGDIRYDTYANEQMFFI
KKISRLEREDLYREDNAPEKRVELHLHTKMSVMDGVTDLAMLFKTLVHWNHKAIAFTDHL
NVQAYPEIYNLNKKYPDVKVIYGVEADVLDDKVWYFKNPHHHNLRTAKYVIFDLETTGLS
SSYDEIIEFGAVIMDGISGERQTINHLFKPSVKLSSFTTELTGITDELLADKPTFIESID
QILEYFKDAILIAHNAEFDLGFIQSWLKKAGRSEINNTVIDTLQLSRILEPHLKNYRLGT
IARCYNVIYNEEVAHRGDYDAIVLTDIYEHQLRKMINTYNIEFDDDIEKIHDPAVYKKLR
PKHMTILAKNQVGLLELFKLITAAHTKYFYSSPKLLRSVIEQHRSNLLIGSSCVNGDVFE
VARNKDASELAETIKFYDYVEIQPPSVYKHLVQMGDLSEERLLTVIKDIIFTAKKLNKLV
VATGDVHYLNPEDKIFREVYINAKGIGGRPHPLYDYKQRVTDNPDQFLRTTMEMMNEFKF
LNNDELIYEIVVTNPNLIADQIEKVEIIKDKLYTPKIEGSDQLLKELCYKNAYKIYGNSL
PEIVASRLERELNAIIKHGFAVIYWIAHKLVDKSLQDGYLVGSRGSVGSSFVATMSNITE
VNPLQPHYLCSYCSYSEFIVDGSVKCGYDLPVRTCPKCQKPLKGEGHDIPFETFLGFEAD
KVPDIDLNFSGEYQPIAHDFTKEMFGERSVYRAGTISTVAEKTAYGYVKGYFESKNILHL
KRRAELERIAKGCEGVKRTTGQHPGGIVVIPNEYEVEAFTPVNFPADDIKSNWLTTHFDF
HAIHDNVLKLDILGHVDPTALRMLQDLTGVDPKTIPTNDEAVLSLFRSLDVLNIKPEDIN
GENTGAIGIPEFGTFFVRKMLLDTKPTSFADLVQISGLSHGTDVWIGNAQELIRNQNISI
SEVIGCRDDIMVNLIYKRLPAQSAFKIMEDVRKGKGLTTEHEQLMRDNNVEQWYIDSCNK
IKYMFPKAHATAYVLMAWRVAWYKINYPVEYYATFFSTRTDVFDIKTILKGAETIKQVLR
DIQTRLDNKDFNAPNKPTQKEKDLIPVYEVALEMYARGIKMSNIDLKISRNKNFTVITNE
NNEKIILPPFSAIDGLGGAVGDSIINARHEKPFLSIADLQKRTNITKAHLESFEELGILK
DLSLDDQIAFEF
NT seq 4359 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaccaacaattgataaaactatttacagcaaataatttagaatttattggaaattat
tttgatgatgctaaagtcattaaagcagaatatagtactagtgaaggtttttttcgtgtt
gtgattgaaattaatgattttttaccactagaagttttactaaaattagaacaaacttta
ttagaaaatgaaacattacccacaaagatttctttacgggttcgaaaagaacaatacgaa
ttagaaactatttttagttacttagaatatattcgattaaataaatcggaattaaaaaat
agtttttttagtaaattatccccagaacgttttgctttaactgataatattttaaaaatt
actgttcattcggaaagtgaacaaaaattagtgggtgaacattgtaattattatcaaaaa
aaacttcgccgctatggttttagtgatttacaattagccctagtgtttcatttacgagaa
aataatattttagaaattaatgaacaagaattaattaaatataaagaaacagcgcaaaaa
acagaacagttaatttctaaaccaaccaatgggactaatccagtttgaagagaattaaat
agttatcagagagcaaaaaatggagaagcaagttatgaacggttaattgatattgatcaa
gatgctccgaatgtgacaatttatggaaaaattttaagtaaagaacgacagttaatttca
acaaagaaatttatttatgtaataacaattactgattatagtgatacaattggcgcaaaa
ttttttactcgaacagaacaaccagatgattttattgaagaattaaaaacgaatgaatga
gttagtctttttggcgatattcggtatgatacttatgctaatgaacaaatgttttttatt
aaaaaaatttctcgtttagagcgtgaagatttatatcgtgaagataatgcgcctgaaaaa
cgcgtggagttacatctccatactaaaatgagtgttatggatggagtaacagatcttgca
atgctttttaaaacattagtacattggaatcataaagcaattgcttttactgaccattta
aatgttcaagcttatccagaaatttataatcttaataagaaatatcctgatgttaaagtt
atttatggtgttgaagcagatgttttagatgataaagtctgatattttaaaaacccgcat
catcataatttacgaactgcaaaatatgttattttcgacttagaaacaactggcttaagt
agtagctatgatgaaatcattgaatttggtgcggttattatggatggtattagtggtgaa
cgtcaaacaattaatcatttgtttaaaccatccgttaagttatcatcatttacaactgaa
ttaacaggaattacagatgaattattagccgataaaccaacttttattgaatcaattgac
caaattttagaatattttaaggatgcaattttaattgcacataatgctgagtttgacctt
ggttttattcaatcgtggttaaaaaaagctggacgctcagaaattaataacacagtaatt
gatactttacaattatcacggattttagaaccacatttgaaaaattatcggttgggaaca
attgctcgttgttataatgttatttataatgaagaagttgctcaccgtggcgattatgat
gcaattgttttaacagacatctatgagcatcagctacggaaaatgattaatacttacaat
attgagtttgatgatgatattgagaaaattcatgaccctgctgtttataaaaaactgcga
ccaaaacatatgacaattttagcaaaaaatcaggtaggtttattagaattatttaaacta
ataactgctgcgcatactaaatatttttattcatcaccaaaattattacgaagtgtaatt
gaacaacatcgtagtaatttattgattgggtcatcatgtgttaatggtgatgtttttgaa
gtggcacgaaataaagatgcatcggaattagcagaaacaattaagttttatgattatgtt
gaaattcaacctcctagtgtatataaacatttagttcaaatgggggatttatcagaagaa
cgattattaacagtcattaaagatattatttttacagcaaaaaaattaaataaattagtt
gttgctactggtgatgtgcactatcttaacccagaagataaaattttccgtgaagtttat
attaatgcaaaaggaattggtggccgcccccatcctttatatgattataagcaacgcgta
actgataatcctgatcagtttttaagaacaacaatggaaatgatgaacgaatttaagttt
ttaaataatgatgaattaatttatgaaattgtagtaacaaatccaaatttaattgctgac
caaattgaaaaagttgaaattattaaagataaattatatacacctaaaattgagggtagt
gaccaattattaaaagaattatgttataaaaatgcttataaaatttatggtaattcatta
ccagaaattgttgcatcacgcttagaacgtgaattaaatgctattattaagcatggtttt
gctgttatttactgaattgcacataaattagttgataaatcattgcaagatggctattta
gtcgggtcacggggaagtgttggtagtagttttgttgcaacaatgagtaatattactgaa
gtaaatccattacaaccacattatttatgttcttattgtagttatagtgaatttattgtt
gatggttcagttaagtgtggatatgatttaccagttcgtacttgtccaaagtgtcaaaaa
ccattaaaaggggaagggcatgatattccctttgaaacatttttagggtttgaagcagat
aaagttccggatattgatttaaacttttcaggagaatatcagccaattgcacatgacttt
actaaagaaatgtttggagaacgtagtgtttatcgtgccggaacaatttcaacggtggca
gaaaaaactgcatatggttatgtgaaaggttattttgaaagtaaaaatattttacattta
aaacgtcgcgcagaattagaacgaattgccaagggttgtgagggagttaaacgaacaact
ggacaacatccaggtggaattgttgttattccaaatgaatatgaagttgaggcatttaca
ccagttaattttcctgctgatgatatcaaatcaaattgattaacaactcattttgatttc
cacgcaattcatgataatgttttaaagttagatattttaggtcatgttgacccaactgct
ttgcgaatgctgcaagatttaacgggagtggatccaaaaacaattccaacaaatgatgaa
gcggttttaagtctttttcgaagtttagatgttttaaacattaaaccagaagatattaat
ggtgaaaatactggtgcaattggtattcctgaatttggtactttttttgttcgtaagatg
ttattagatacaaaaccaacttcatttgcagatttagtccaaatttcaggattgtcacac
ggaacagatgtttgaattggcaatgcccaagaattaattcgaaatcaaaatattagtatt
tcagaagtaattggatgtcgtgatgatattatggttaatttaatttataaaaggttacct
gctcaaagtgcttttaagattatggaagatgttcgaaagggaaaggggttaacaactgaa
catgaacaattaatgcgggataataatgttgaacaatgatatattgattcgtgtaataaa
attaagtatatgttcccaaaagcccatgcaacagcctatgtcttaatggcgtgacgagta
gcatgatataaaattaattatccagttgaatattatgcaacatttttttcaactcgaaca
gatgtttttgatattaaaacaattttaaaaggagcagaaacaatcaaacaagttttacgc
gatattcaaactcgtttggataataaagattttaatgctcccaataaaccaacacaaaaa
gaaaaagatttaattcccgtttatgaagtagcattagaaatgtatgcccgaggaattaaa
atgagcaatattgatttaaaaataagtcgaaataaaaattttaccgttattacaaatgaa
aataatgaaaaaattattttaccgccattttctgcaattgatggtttgggcggagctgtt
ggcgatagtattattaatgctcgccatgaaaaaccatttttatcaattgctgatttacaa
aaacgaacaaatattacaaaagctcatttagaatcatttgaagaacttggaattttaaaa
gatttatcattagatgatcaaattgcgtttgagttttaa

DBGET integrated database retrieval system