KEGG   Sphingobacterium sp. B29: BV902_26060
Entry
BV902_26060       CDS       T04670                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
sphn  Sphingobacterium sp. B29
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sphn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sphn02000]
    BV902_26060
Transporters [BR:sphn02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   BV902_26060
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg DUF4082 MG4
Other DBs
NCBI-ProteinID: APU99996
LinkDB
Position
complement(6099993..6102929)
AA seq 978 aa
MLNNSFLTESKKPQQQIKGKVLNADGKPISSVNITVKGTSKGTQSDVSGNFSLDAKQGDV
LVVTSIGYKAKEVTVSGETISVQLEEDQSQLEEVVVVGYGTQKIREVTSAVAHVSADQFR
QSGARNPLDLIQGKVAGLQVSRSGSNPNSGVATQLRGAISVTGSASPLFVIDGIPGGNPD
LLQQDDIESIDVLKDGSGAAIYGTSANAGVILITTKRGKPGKSVFNYSSYFRKDFVYNRP
DFLTPQEFRDKIASGELKQTDFGHSTDFFDELINKDNFSQNHNLSLSGGNESTTYRGSVN
FRNLEGIAKENSRKEYTVRTSINQKGFNDRLNFLLNIATNTNNANLLGGGGWESEATKNP
TLSNYNDDGSFRYDRTSTNEFARLFTETSYRKQQTSSLDGKADLNIIEGLKASVFGSVQR
NSYTDGAYRALNSEASLEDQDYPGGGYASKSNLLNEKYAFEPTLQYNTTVAEKHAITALA
GYSYRYEKDEGQSADNRGFINNNFHEDNLSEGQALRDGRANMDSYKNDNTLIAFFGRVNY
TYADKYMAQFILRREGSSKFGANNKWGSFPAVSVGWNISNEDFMKDIGFINNLKLRAGYG
ETGNTGFANNASRLTLGGGGKYLFPDESYRETYGPDRNPNPNLRWETKKETNIGVDFTML
SNKLSGSIDVFQRKTVDLLDTYTTPQPPYIRNNIYSNVGTLSSKGIELALSYRAIDRENF
KWNMDFTASTLKNVLDSYSNDIFKVKYKTFGEIGGAGALGDAFTTYEGHKIGEFFGKRFA
GFDDEGKWLFYNRNGEAVHNDAINNSRDDLNSSDLAVIGNAVPKYYISWTNNFSYKNFDL
RIFMRGKFDYDILNTTALSYGNKVWSENLLRDAFTKYKDINDTYMYSDYYLESGSHLKID
EVTLGYRFKLKSNTWVNNVRIYLTAQNLATITGYSGNDPDFVLDTGLGNEVNGQRLGIDS
RGPYPNTRSFLFGVNFGF
NT seq 2937 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaacaactcttttctaacggaatcgaaaaagccccaacaacaaattaagggaaaa
gtcttgaatgctgatggaaagccaatttcaagtgtaaacatcactgttaaaggaacatcg
aaggggacacagtcagatgtgtcaggtaatttttctttggatgctaaacagggagacgtg
ttggttgtcacttctattggttataaagcgaaagaagttacagtttctggtgaaaccatt
tctgttcaattggaagaagaccaaagtcagttggaagaggttgttgttgtcggttatggt
acgcaaaaaataagggaagttacttctgcagtagcccatgtaagtgcagaccaatttcgt
caaagcggcgcgagaaacccgttggatctcattcaaggaaaggtagcgggactgcaggtg
tctagaagtgggtcaaatcctaattcaggtgtagcgactcaattgcggggcgcgatttcc
gttactgggagtgcaagtccattgtttgttattgatgggatacctggaggtaatccggat
ctactgcaacaagatgatattgagtctatagatgtgctgaaagatggatccggtgctgcg
atttatggaacaagcgccaatgccggtgtcattctgattacgacaaaaaggggaaaacct
ggtaaatcggtattcaactattccagttattttcgcaaagattttgtctataatagacct
gattttttaactccacaagagtttagggataagattgcttctggtgagctaaaacaaact
gattttggccattctaccgatttttttgatgaattgattaataaagataatttttcacaa
aaccataacctttcactgtctggaggtaatgaatcaactacctatcgtggaagtgtcaat
ttccgaaatttggaaggtattgcaaaggaaaattcaagaaaggaatatacagtaagaacg
agtataaaccagaagggctttaacgatcgtttgaattttctcctcaatatcgctaccaat
acgaacaatgcgaacttgttaggcggtggtggctgggaaagtgaagctacgaaaaatccg
acgctctcaaattataacgatgatggatcttttcgttatgaccgaacgagtacaaatgaa
tttgctcgattgtttactgaaacaagttatcggaaacaacagacatcttctttagacgga
aaagcagatttaaatataattgagggattaaaggccagtgtttttgggtcggtacaacgt
aattcctatacagatggtgcttatagagcgctcaatagtgaagcgtctttagaagatcaa
gattatccgggtgggggatatgcttccaaatccaatctattgaatgaaaaatatgcattt
gaaccgacacttcaatataacactaccgttgccgaaaaacatgcaatcacagcattagca
ggatatagttatcgttatgagaaagatgagggacaaagtgcagacaataggggatttata
aataataatttccatgaagataatttgtcggaaggacaagcgcttcgggatggacgggct
aatatggacagctataagaatgacaatactttgatcgctttttttggccgggtaaattat
acctacgcggataagtacatggctcagtttattctaaggcgtgaaggttcgtctaaattt
ggagcaaataacaaatgggggagttttccggcagtatcagtggggtggaacatcagcaat
gaagattttatgaaagatatcggttttataaataatttaaaattacgtgctggttatggc
gaaacgggaaatacgggctttgctaataatgcctctcgattaactttggggggcggagga
aaatatctgttccctgatgagtcctaccgagaaacctacggacccgaccgtaatccgaac
ccaaacttgcggtgggagacgaagaaggaaacaaatatcggtgttgatttcacaatgttg
agcaataagctttcaggttcaattgatgtttttcaacgaaaaactgttgatcttttggat
acatatactaccccacagcctccttatataagaaataatatatattccaatgtaggtacg
ctttcttctaagggtattgagctagcgcttagctatcgtgctatagaccgtgagaatttt
aagtggaacatggattttacagctagtacgctaaaaaatgttttagatagttattcgaat
gatatatttaaagtaaaatataaaacatttggtgaaatcggcggagcaggagcattgggc
gatgcattcacaacgtacgaagggcacaagatcggtgaattttttggtaaacgatttgcc
ggatttgatgatgaaggaaaatggcttttttataaccgaaatggcgaagctgtgcacaat
gatgcaattaataattcaagagatgatttgaattcttctgatttagcggtaataggaaat
gcagtccccaaatattatatttcctggacgaataatttttcctataagaattttgatctg
agaatttttatgcggggtaaattcgattatgatatcttaaatacaacggcactttcttat
ggcaataaggtctggtcagagaatcttttgagagatgctttcaccaaatataaagatatt
aatgatacctatatgtattctgattactatttggaaagtggtagtcacttaaaaattgat
gaagttacattgggatatcgatttaaattgaaaagtaacacttgggtgaataatgtgcgc
atatatttgacggctcaaaatctggcaacaataacagggtattcagggaatgatcctgat
tttgtattggatacggggctgggtaatgaagtaaatggacaacgtttaggtattgatagt
agaggaccttatcccaatacgagatcgtttttgtttggcgtaaattttggtttttaa

DBGET integrated database retrieval system