Sphingobacterium sp. CZ-2: E3D81_06840
Help
Entry
E3D81_06840 CDS
T06166
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
sphz
Sphingobacterium sp. CZ-2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sphz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sphz02000
]
E3D81_06840
Transporters [BR:
sphz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E3D81_06840
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TonB_dep_Rec_b-barrel
TTR_TEN1-4
CooC_C
PCC_BT
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBR13886
UniProt:
A0A4P7DVM1
LinkDB
All DBs
Position
1507976..1511077
Genome browser
AA seq
1033 aa
AA seq
DB search
MVMAVLSISFAMAQNQQIQGKVLDESNKPVSGVTILNASNNRALTATKDNGEFTVTVPAN
TTLIFRGIGFTERRIKINVNQTSLTVRLSATDNQVEEVVVRGYVARSKEKTTGSSYSLGE
KDIKDNPAINIESLMQGKVPGLNIQVNTGAPGFRGSTQIRGLSTLSTQGTGNESILMPTS
PLYVIDGVPMDADRASEFGLQQQGPGISPLSLIPPEDVESIEILKDAQATSLYGSRGAYG
VIIINTKRGNSEVPRINYTHSSFMRSIPKLRETLGGNMERNLKLLQIYTNARTQGELDKI
MQTPSLADSLNSYFNNSTNWQGLFYQNTFNQNHNFSMDGGNQQLSYKANLNFYDETGVIK
NTGFTRYSSNLRMDYRPSRRFEFVGQVFAQLGKMNKGDGTGILQTGVASGGQSSTLLPPP
GFFTASSDYVAAIRTRNDNKTKLIKPFIEAGVEIIDNLRFRTTLSYELSSGTEEKFSPAA
SSGQFSEVYAFNNRYSQFYSRNNLNYSKTLKEDHDLFFSIFNEIIHVTNQNSVITQRRTP
NDQFEGPLGYDGYFSSGGGILSFKNEKALSFAFAGNYSYKSRYVLDLTYRLDGSSLNGFE
NLYTKNPSIGLKWNIHREDWIKGLPWINTAALRGTWGVNVMPTATLDRIYGKYNIYGNYN
QQTGIGIDSYLIPNPDLKPTTSMQYNLGFDLIILNNKIDIIYDTYYKRTENLYQESYLNN
TTGFSTLSSNEGGLVNYGHEVSLRLRPLKGDKFFWMLSVNGAYNRDVLLQLPSIFNGQLI
RWDGSAAKQHILNRVGTHAFSNYVLVNRGVYATDADVPVDPRTGLRYRTPDGTFFQAGDP
IWVDQNGDYILDDRDYTRSGSAQPNFIGGIQNEMSYKGISLTIAASYTAGRTIFNNALAE
RMRLLANPYGLQSVVPLDDLDMWRQDGDIAKYPNAYDFSRAGNINPLRNDQTLWEENGSY
LKINQVSLAYNFDREFLKRYRLQRFRVYATMDNVYTFSKYSGPNPEGVTSLGRDLSNGYP
VPRGYALGLNLSF
NT seq
3102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgatggctgtcctttccatttcatttgccatggcccagaaccagcagattcaagga
aaggtattggatgaatccaacaagccggtaagtggggttacaatattaaacgcctcgaac
aaccgcgccttgacagcaaccaaagataatggcgaatttaccgttacggttccggccaat
acgaccttgatttttcgaggtattggatttacagaaagaaggatcaagatcaatgtgaac
caaacttctttgacggttcgcttgagtgcaacagataaccaagtggaagaagtcgtggta
cgtggttatgtagcccgttccaaggaaaaaaccaccggttcatcctattccttaggtgag
aaagatatcaaagataatcctgccatcaatattgagtccttgatgcaaggaaaagttcct
ggattgaacattcaggtgaataccggtgcgccaggtttccgtggatccacacagatccgg
ggtctatccaccctttccacacaaggtacgggtaatgaatcgatcctgatgccgacctct
cctttgtatgtaatcgatggggtcccgatggatgcggacagagcttcagagttcggtctt
caacaacaaggtccgggtatcagcccactttccttgattccaccggaagatgtggagagc
attgagattctaaaagatgcccaagcaacatccttatacggatctagaggagcatatggt
gtaatcatcatcaataccaaacgaggtaattcagaggtgccaaggatcaattatacgcat
tcctcctttatgaggtcgatccctaaactacgggagaccttgggcggtaatatggaaaga
aacctaaaattgcttcagatctataccaatgctcgtacgcaaggggaattggataaaatt
atgcagacgccttccctagcggatagtctaaactcctacttcaacaattccaccaactgg
cagggcttgttctatcagaacacgtttaaccagaaccacaacttcagtatggatggtgga
aatcagcaattatcctataaagccaacctcaatttctacgatgaaaccggggtcatcaag
aatactggatttacccgttattcgtcgaacttaaggatggattaccgtccttccagacga
tttgagtttgtaggtcaggtgtttgcccaactgggaaagatgaacaaaggggatggaaca
ggtattctacagaccggggtagccagtggaggtcagtcttccaccctattgccacctcca
ggattctttaccgcctcttcggattatgttgccgcgatcagaacacggaacgacaataaa
accaaattaataaaaccctttattgaagctggggtggagatcattgataatctccgattc
cgtacgacactgagttatgaactgtcttccggcacagaggagaaattctcgccagcagcc
tcttcgggccaattctctgaagtatatgccttcaataaccgttattcgcaattctatagc
cggaataacctgaactattcaaaaacattgaaagaagatcatgatttgttcttcagcatt
ttcaatgagatcatccatgtgaccaaccagaattcggtcattacgcaacgtcgtactccg
aacgatcagtttgaaggtccattgggttatgatggttatttttccagtggtggtggtatc
ctgagttttaaaaatgagaaggcactatcttttgctttcgcaggaaactacagctataaa
tcacgctatgtactggatctgacctatcgtttggatggatcttccttgaatggatttgaa
aacctgtataccaagaatccatccatcggattgaaatggaacatccatcgggaagattgg
atcaagggattgccttggatcaataccgcagcgctacgtggtacctggggagtaaacgtg
atgcctacggcaaccttagaccggatctatggtaaatacaatatctacgggaactacaat
cagcaaacagggatcggtatcgactcctatctgattccaaatcctgatttgaaaccgacg
acttccatgcagtacaacttaggatttgacctgatcattctgaacaacaagatcgatatc
atctatgatacctattataaacgtacagaaaacctgtatcaggaatcctatttgaacaat
accaccggtttctccacgctgtcctcaaacgaagggggtttggtaaactatggtcatgag
gtttccttgcgattgagaccattgaaaggcgataagttcttttggatgctatcggtcaat
ggcgcctataaccgggatgtccttttgcaattgccaagtatcttcaatggtcaattgatt
cgttgggatggttctgcggccaaacaacacatcctgaaccgcgtaggtacgcatgccttc
tccaattatgtattggtgaaccggggtgtatatgcgacagatgcggatgttccggtagat
ccgagaaccggccttcgctataggacaccggatggtaccttcttccaagctggagatccg
atctgggttgatcaaaatggggattatattctggatgatagggattatacccgttcaggc
agtgctcaaccgaatttcatcggcggaattcagaatgaaatgtcctacaaaggcatctcc
ttgacgatcgccgcttcttatacagccggaagaacaattttcaataatgcattagcggaa
cgtatgcggctgttggcaaatccttacggtttacaatcggtagttccattggatgatctg
gatatgtggcgtcaggatggtgatatcgccaagtacccgaatgcttatgatttctcccgt
gcgggcaatatcaatcctctgcggaatgatcaaaccttatgggaagagaacggatcttac
ctcaaaatcaatcaggtatccctagcctataattttgatcgggaatttttaaaaagatac
aggttacaacgtttccgggtctatgccaccatggacaatgtttacaccttttcaaaatat
tctggacctaaccctgagggagtgaccagtttaggccgtgacctttccaatggttacccg
gttcctagaggttatgcacttggtttaaacttatccttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
