Sphingobacterium sp. CZ-2: E3D81_14460
Help
Entry
E3D81_14460 CDS
T06166
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
sphz
Sphingobacterium sp. CZ-2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sphz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sphz02000
]
E3D81_14460
Transporters [BR:
sphz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E3D81_14460
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
BAP
NOMO1-like_2nd
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBR13304
LinkDB
All DBs
Position
3301070..3304162
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MMITTHRFMIKLESRVVSKILFLLGLILLAFFTAQAQTKTITGYVKDSNNAGLAGVTVQV
AGSSKATSTNDQGYFEMTNISVGQELIFSFQGFTEKRVTVQNQTILQVTLEFSSTVIEET
VVVGYGRQKKRNLTGSIVSVGSNEIEKTSLQDPISILQGRAAGVQISSNSGAPGSEMMIR
VRGNSSLNSGNNPLFVVDGIPIESNSISSLNGTENFGLNPLADINPNDIASIEILKDAAS
TAIYGSRAANGVVMITTKRGAEGKPEVLVNATTGISNLTRNLSVLNAAQYREAVLDSYFA
LPNPEEPYYTIIDSLNPMNNGDVDWQDELMRTAKQYKIDVAVRGGTKAAKYAWSTSYLDQ
DGIILNSNYKRFTSRLNVDFDLTDYLRIGQSISYTNGVNNRTNAAGTGNLSIIRSLLVRP
PNMSMYLPDGSLNGYMIGMRNPVGMALYATNLNKSNRIIGSQYVEADIFKDLKFRSNFNL
DYISMKEEEFMPSILDYREGYNTGGVRNIGNLTWGNESYFTYQKSLENVHNFGGVLGMSF
QKWRFDRTGLDGMFFPSDDIRTLNAASVISNQGVNVASEHAMLSYFGRATYDYRGKYLLE
FNLRADGSSRFGRDNQFGFFPSASAGWRFKDEEMLKDASWLSDGKLRFSLGSTGNEAIGD
YTSQGEFTLGTNYLDFSGASPTVMPNASLSWETTTQYNLGLELGFWNNRVLFTTEAYLKQ
TRDLLYNVPIPNTTGFEFITQNIGNIENKGLEFSLQTKNLQGAFTWNTGLNISLNRNKVA
SLPENLLTNGYIQNGTYHILQEGLPIGVFYGWRFMGVYARDEDNVNKVTHGASGPVFVGG
DPIWKDLNGDNIINQDDREIIGYAEPKFFGGISNDFSYKNFHLNVFLQYSVGNEIYSELN
HQRNSVVRYNNLSTDALDRWREQGDITNFPRLIRDDPKQSDSRVQSRWVEDGSYIKLKNV
NLRYSLKPEWTQKIGLRKVDAFINANNLITWTKYTGFDPDVNSYSGLRVGLDEGSYPQSR
TFMFGLTFGL
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgataaccacccaccgatttatgattaaattggaaagtcgagtagttagcaaaata
ctctttctcttaggattgattttgttagccttctttactgcccaggcgcagaccaaaact
attacaggatatgtcaaggatagcaataatgctggtttggccggagtaaccgtccaagtc
gcaggcagctctaaagcaacaagtacaaatgatcaaggctattttgaaatgaccaatatt
tctgttggtcaagaattgatattcagctttcaaggatttaccgaaaaacgtgttactgtc
caaaaccaaactattcttcaagtcactttagaattcagttctacagtcatagaagaaaca
gttgtagtagggtatggtcgccaaaagaaaagaaacctgactggatcaattgtttcggtc
ggttccaatgagattgaaaaaaccagtttacaagatcctatttccattcttcaaggtcgt
gctgccggtgttcagatatcttcaaactccggtgcaccaggttcagaaatgatgattcgt
gtgagaggaaattcttctttgaactcaggcaataatccattgtttgtcgttgatggcatt
ccaattgagtcaaattctatctcctccttaaatggtacagaaaactttggcctcaatcct
ttggcagatatcaacccaaatgatattgcatccatagagatattaaaagatgcagcttcc
acagctatttatggttctagggctgcaaatggggttgttatgatcacgactaagcgaggt
gctgaagggaaacctgaagtccttgtcaatgctactacgggcattagtaatctcacccgt
aatttaagcgtgcttaatgctgcccaatatagagaagctgtcttggattcttactttgcc
ctaccaaatccagaagaaccgtattataccataattgattctttaaacccaatgaacaat
ggtgatgtagattggcaggatgaattgatgcgtacagcgaagcaatataaaattgatgtt
gcagtaagaggtggtaccaaagcggcaaaatatgcttggagcacatcctatttagatcaa
gatgggataattctaaattcgaattacaaaaggtttacttccagattgaatgttgatttt
gatctaacggattaccttagaataggccaaagtatttcttataccaatggggtgaacaat
cggaccaatgctgcaggaacggggaatttaagtatcattcgaagtttattggttagacct
ccaaacatgtccatgtacttaccagacggttccttgaatggttatatgatcggtatgcgc
aatccagttggaatggcattatatgccactaacctcaataaaagtaatcgtataatagga
agtcaatatgtagaggctgatatatttaaagacctgaaattcagatcaaattttaacttg
gattatatatccatgaaagaggaagaatttatgccttcgatattagattatcgtgaggga
tataatacaggaggggtaagaaatattggtaatctcacttggggaaatgaaagttatttc
acctaccaaaagagtttggagaatgtacataattttggaggggttttgggtatgagtttc
cagaagtggcgatttgatcggacgggacttgatggaatgttctttccaagtgatgatatc
agaacgctgaatgccgcatcggtcatttctaaccaaggagtgaatgtggcttccgaacac
gccatgttatcctattttggacgtgctacctatgattatagaggtaaataccttctagaa
ttcaatctacgagcagatggatcatcccgatttggtagagataatcaatttggatttttt
ccatctgcctcagccgggtggagatttaaggatgaagaaatgcttaaagatgccagttgg
ttaagtgatggtaaattgaggtttagtttaggaagtactggtaatgaagcgattggagat
tacacttcacagggtgaatttaccttaggaacgaattaccttgatttttcaggagcatcg
cctactgttatgccaaatgcgagtttgagttgggagacaacgacacagtataaccttggt
ctggaattgggcttttggaacaatcgggttttatttacgacagaagcgtatttaaagcaa
acacgtgatttattatataatgtaccaattccaaatactacaggtttcgagtttattact
cagaacattggaaatattgaaaacaaaggcttagagtttagcttacaaactaaaaactta
caaggtgcattcacctggaatacaggtcttaatataagtttgaaccggaataaagtagca
tctttgccagaaaacttattgacgaatgggtatatccaaaatgggacatatcatatttta
caagaaggactgccaatcggtgtattttatggatggcgttttatgggtgtatatgcgcgt
gatgaagataatgtaaacaaagttactcatggtgctagcggacctgtttttgtgggcggt
gatcccatttggaaggatttaaatggagataatatcatcaatcaggatgaccgtgaaatt
attggttatgctgaaccaaaattctttggtggtatttctaacgattttagttataaaaat
ttccatctcaatgtattccttcagtattccgttggaaatgaaatatatagtgaattgaac
catcaaagaaactctgttgtacggtacaataatctttctacagatgcacttgacaggtgg
cgagagcagggagatatcactaattttccaagattgattagggacgatccaaagcaatca
gattcacgtgttcaaagtaggtgggtagaagatggttcttacatcaagttgaaaaatgta
aacctacgttatagtctcaaacccgaatggacccaaaaaattggactcagaaaggttgac
gcctttattaatgccaataatttaatcacttggaccaaatatactggttttgatcctgat
gtaaattcgtattccggacttcgggtgggcctggatgaggggtcttacccgcagagccgt
acgtttatgtttggtttaacatttggactttaa
DBGET
integrated database retrieval system
