| Entry |
|
| Name |
(GenBank) hypothetical protein
|
| Organism |
spir Spirosoma pollinicola
|
| SSDB |
|
| Motif |
|
| Other DBs |
|
| LinkDB |
|
| Position |
5980421..5989717
|
| AA seq |
3098 aa
MQFTSIYFRLIKCLLQVFAVSFRRLAFRQIDRQSVWPASLQFPLITRISLNNASPARASA
LGLLLWLMASLSAQAQVSGRVYQDFNANGVYDISATIASADGTTLPVAVDKGIAGVVVNA
YGPTGSLAGTATTAADGTYTIAGATGNVRVEFSILPTNYLSGPVGTNSGTSVQFVTAPAT
NINFGINRPWDYSENNPALVTNCYVPLSRTGTYTASDVIVTVPNNAGSSVYSGGVGCTSC
PTAYNLPAPNHLATHAQVGSTFGLGWQASTKTLFAATYIKQFTDIGPQGTGAIYRINMTN
PSAPVVMTGAPNTVTGPIDLNLIFGAGTMGANPFSPYPDFNTVTGRQIVGDAVFNAGFSD
IDVSEDGKTLYALSFKDKKIYSIPIDGSPINSTTVKSAVIPVISGQTLANVRPTGMGIKD
GKVYVITQGSFAIDASNDYDTGVDFVGSVRYPYLNGTGIGTQHAVYAYDPATNTFTTTPV
LSFNNRDANSNWIWYWGIIYMDLVFDDKGAMILGGRNISNDVVGGTTGARLVRASKNGSG
VYDIEDGGSSGGITTGGSTVSNGSVSNGLYYYQVDPVDGGEGDSNGGLAQIPGHPNVIET
QYDPFEVYTAGLRWLNNTTGKSTKAVEIVAPSNPFSFNGVNFDNKAGVLGELEALSSPAP
IEIGNRVWNDTNNDGIQNAGETGIAGVSVSLCTGAGAPIATAVTDANGTYYFSSGSGTTT
GSVIYSLSALTANTNYQLKFPTTNSSKSLVTANAGADNIDSDAPASGVVSFSTASIGAND
HTFDVGYGAATCALSTTVTAGTCTPATNQYAVSGTLSLINNAAGGTATITDGTATTTVTI
AANATTASYILTGLTSDAASHTVTVSLPGCGTATVGYTAPGSCSSAASSCSITIKPTVSG
CYSVSGVSKATVSVEVGWSNAPTGNITVTYAGQTKTITPGSFTTSANSGTIVSPQVVAFE
VDLSTATSGQTAIATFNNSTTCTITSSAIILPAACLPTPCTTGQTGGTVFNDYNANGIHE
SGETTGIPSVTVKAFDCNGALVGTTTTDQYGRYTFTGLTASNYPIRVEFSGLPAIYGQGT
LNGSDGRTTVQFVNAASCTIDLGVLDPTDYCESNPKLVVPCYVYGDPQTGSLSGQRDAVV
MFDYNLAGAPDMTKMTEVAKAEQVGTLWGEAYDKDTKRLYMSATLKRHAGLGPLGLGGIY
VADLTNLSAPVTTAYIDVTTLGINVGSSTATDTWFGVTNLTRGLSTDPSKASVDLNAYKA
IGKAGIGGISLSADGKKLYFTNLYDKKLYVLNVGTGAATLDKSIDFLSAASCPNGDLRPW
ATKFYRGKVYAGVVCDAGTSQNQADMRAFVYQIDPSTNASSVIFDFPLTYPKGTPNTQFP
DRTGWYPWTDDWSLKIAPNNTVDKDRVVHPEPIFNDIEFDIDGSMVLAFGDRTAVQTGLN
NYGPYAPYSTNSSYQGNVGGDILRAYSTGISFVLENNAKAGPVTGAGLNNNQGPGFGEFY
NDKVASFHSEDIVGGLALLPGSGEVVAVAMDPSTSPLVLNAGGVRHFNNTTGAVNSGYAV
YKSNTGDGTYGKATGLGDLILTCSTPTYLEIGNRVWVDTNKDGIQDPCEKSMAGVNVALY
QGNTLIATATTDANGEYYFNNNPVSSTVVGTTSTTLIQPNTAYTVRFGTDGTTNQYDNTT
GILTTSIGKFNVTTAFSTAPTANTLNDSNALVSGGFLSANVTTGAAGSVNHTIDAGFICA
PTTVGSVSVVKATCTGTTANNDGQVLLTGVVCGDKAFIYTSGPAPSYTATGGLSVSASAV
SFTGLVNPSTSAGQSYSIIVYNGPCCFTTVTAVLPQQVCTAVPCSISATAAATCNNNGTL
DSNTDDYTSFVLTPYNAVQGSRFTITATQAGSPIAITFPDGTTTTSGASMSALSYAYPTP
FRTGVGTAGKGNIIITITDVNNATCTTHVTVVDPGTCAPAVCVGTTPTSVSYAYQTPFQT
TELANVPLLLNKFDNGGGTRTLTGVKLTYKIFEATNYLFENASSTSNDFVATTSGTARMK
LSGTTIITAGFPNVTTGDLTLPAGVTVAAQGTYSGDAPFGTSNVSTLKGMDSWLTPLLQD
IFIDPRLDPRWVTTATGNPGNDADIYVWAPQSFSSTGVTTYTATTDLTHFVGSGTIPLVA
STVNGFGFIGGGGNILSIQNTKAYACATVEYTYICTVCSLTATATPTVCNPVTNQYDVSG
TISLTSNLAGGVATITDGTVSTSVTVGVSATSVAYSLTGLTSDGANHTLTVTLAGCGSAT
VGYTAPASCTIAATILVTSATVCYGSSATLVASGCTGTITWSSGATGASFVTPALTATTD
YTATCTTSTGSTTSAVGTVTVMPQPVLSLQASATLVTVGTPVSLSAIGCVGTVSWPTGVT
GASISVTPANPTNVYSATCTTGPGCTTVATTTINTAPSASLVVISATVCYGSSATLVASG
CTGTITWSSGATGASFVTPALTATTDYTATCTTSTGSTTSAVGTVTVMRQPVLSLQASAT
LVTVGTPVSLSAIGCVGTVSWSTGATGAAISVTPANPTNVYSATCTTSPGCTTVASTTIS
TTLACSLSVTTTSLPKGQVGVAYNQTIVTTGGTAPLNFSVSGGNLPTGLSLNATTGIISG
TPTVSGSFPTTITVTDAKACQVKLSLSVFQIDPAPQTASLGDFVWYDTNKNGQQDGLETG
VAGVIVKLFDPTSSTVTPIASLTTDASGKYLFTNLTPGQYCVIFQTTTLPVGYSLTLANT
GADATDSDASPVTGKTATYTLTAGQQELSVDAGIIAPAISLNLDKLVDKSRAKVGDVLTY
TLVLTNTGTVTATNVVVSDVSTVGLRYVAGSASAPAGSTFTQGNPLSTWTIASLGAGQHL
DLTFQAIADSSGILYNTATIPGDTARVCTSIPYQVCKGSVYQFQLGVAVGSQSYQWYKDG
VALTGASSNTLLVTAAGSYSVAINGVAGCLTGSCCPFIIEEIADVASYSLAATTPTCNGT
VAQTNGQLTVTGLVSSTATSYTYQIVLGSSFDSGTLLTVNKTAVPLSSILSSSLAPGTYT
VRIYNASGCYRDVTAVILPANCVCPPPKCVPFVVQKIR |
| NT seq |
9297 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcaatttacgtctatctacttccggttaattaagtgtctgctgcaagtttttgcagta
tcctttcgtcgattggcatttcggcaaattgatcgacagtcagtttggcctgcgtcgctg
caatttcctttaatcactaggataagcctgaataatgcttcccctgcgcgtgcaagtgcg
ttaggcctactactttggcttatggcatcgctgtcagcccaggcacaggtatcgggccgg
gtttatcaggactttaatgcaaatggggtctatgacatatccgccacaattgcctcggca
gatggcacgaccctaccagtggccgttgataaagggattgccggggttgttgtcaacgca
tatggaccaacaggttcactggctggtacggccacgactgctgccgatggtacgtatact
attgctggtgctacgggcaacgtacgtgttgaattctctatacttcctacaaactattta
tcagggccagttggtacgaatagtggcacgtcggtgcagtttgtcacagctcctgctaca
aacataaatttcggaattaaccgaccctgggattatagcgaaaacaacccggcactggta
acaaactgttacgttccgctaagcaggacaggtacgtatacagcaagcgatgttatcgta
accgtccccaataatgcgggctccagtgtgtattcagggggtgtgggctgtacatcttgc
cctactgcttacaatttacctgcaccgaaccatctggcaacgcatgcgcaggttgggtca
acatttggattgggctggcaagccagtaccaagacgctttttgcggcaacctatatcaaa
cagtttaccgatattggccctcagggaacaggggctatttatcggatcaatatgaccaac
ccaagtgcgccggttgttatgacaggtgccccaaataccgtaactggtccaattgatctg
aacctgatttttggggccggtacaatgggagcaaatccgttttcgccttacccggacttc
aacacggtaactggtcgacaaatagttggtgatgccgtattcaacgctggtttttcagac
atcgacgtttcggaagatggaaaaacactttatgcgttaagtttcaaggataaaaaaata
tatagtatccccatcgacggatcgccaataaattcaacgacggtgaagtctgctgtcatt
cccgttattagtgggcaaacgctcgctaatgttcgaccaaccggaatgggaataaaagat
ggtaaagtatatgtgattacacaaggcagttttgctattgatgcctcaaatgactacgat
acaggtgtagacttcgttggtagtgtacgttatccgtatttaaatggcacaggaattggt
acgcaacacgcggtatacgcgtatgatccggctacaaacacgtttacaacaacccccgtt
ctaagcttcaataatcgggacgctaacagtaactggatctggtactggggcattatttat
atggatctggttttcgatgataaaggagccatgattttgggtggcagaaatatatcgaat
gacgttgtaggcggcacaactggtgctcgtttggttagagccagcaaaaatggttcggga
gtttatgacattgaagatggcggaagttcaggcggtattaccaccggtggttctacagtt
agcaatggtagtgttagcaatgggttatactattatcaggtcgatccagtagatggtggt
gaaggcgattcgaatggcggtctggctcagataccaggccatccaaacgttattgaaacg
cagtatgatccgttcgaggtctataccgcaggtctgcgttggttgaataatacaaccgga
aagagtacaaaagcggtcgagattgtcgctcccagcaaccctttttcattcaacggtgta
aattttgataataaagcgggggtattgggtgaattggaagccctttcgtctccggctcct
atcgaaatcggtaaccgagtttggaacgataccaataatgatggtattcaaaatgcgggt
gaaacaggtattgccggtgtcagcgtctcactctgcacgggcgcaggtgctcccatcgcc
actgctgtgaccgacgccaatggtacctattacttctcgtcgggcagcggcaccacgaca
ggttcagtcatttatagcctgtcggcgctaacggccaacacaaactatcaattaaaattc
cccacaaccaatagtagcaaatcgctggtaacggccaacgcgggtgccgacaacatcgac
tcagatgctccggcctctggcgttgtatcgttctccacggcgagtatcggtgctaacgac
catacgttcgatgtggggtatggagctgctacttgtgcgctttcgaccacggttactgct
gggacttgtactcccgctaccaatcaatatgccgtatcaggtactctatctttgatcaat
aatgcagcaggtggcacggccactatcactgatggaacggccacgactacagtcacgatt
gcagccaacgcaacgacggccagctatatcttaacgggcttgacgtctgacgcggccagc
cacaccgtaacggtgagcttacccggttgcggaacggccacggtgggttatacggctccg
gggagttgctcatctgcggcatcttcttgctcaatcaccatcaaacccactgtgtcaggt
tgttactccgtgagtggggtaagcaaggccaccgtcagcgtggaagtaggctggagcaac
gcgccaacgggaaatattaccgtgacctatgcgggccagaccaagaccatcacaccggga
tcatttacaacgtctgccaactcaggcacgatagtctcgccccaggtggtagccttcgaa
gttgatctaagcacggctacttcaggccagaccgccatcgccaccttcaacaacagcaca
acctgcaccatcaccagctcggcaattatcctacctgctgcctgcctgcctacgccctgt
acaacagggcaaactggtggtaccgtctttaatgactacaacgccaatggtattcatgag
tctggcgaaaccacggggataccgagtgtaacggttaaggcattcgattgcaatggtgca
ttggtcggcaccacaaccaccgaccagtatggtcgatatacgtttacaggactgacagcc
tccaattacccgattcgggtagagtttagcggtttgcctgctatttatgggcagggaacg
ctgaatggttcagatggccgcactacggtgcagtttgtgaatgcagccagttgtacgatt
gatctgggcgtattggatccgactgattattgtgaaagtaaccctaagttagttgtaccc
tgttatgtctatggtgacccccaaactgggtcattatcgggccaacgcgatgccgtagtc
atgtttgactataacctggcgggggctccggacatgacgaagatgaccgaagtggccaaa
gccgaacaggtaggcacgctctggggcgaagcctacgacaaggacaccaagcggttatac
atgtcggctaccctgaaacgacacgcagggcttggccccctgggcctgggcggtatctac
gttgcggatttgactaatctgtccgctccggttacgacagcctatattgatgtaacaacg
ctggggatcaacgtcggttcgtccaccgcaacggatacctggttcggtgttaccaatcta
actcgtggtttgtcaacagaccccagtaaagccagtgtcgaccttaacgcatacaaggcc
attggaaaagcgggtattggcggcatttcgttgtctgctgatggcaagaagctgtatttt
accaacctgtacgacaaaaaactatacgtcctgaacgtgggtacgggtgcagccaccctg
gataaatctattgatttcctgtcagctgcatcttgccctaacggggatctccgcccctgg
gctactaaattctacaggggaaaagtctatgcgggtgttgtttgtgatgctggcacctcg
caaaatcaggcagacatgcgggcatttgtttaccagattgaccccagcaccaatgcgtcg
tctgttattttcgacttcccactgacctatccgaaggggacgcctaatacccagtttcca
gatcggacaggctggtatccctggacagatgattggtcgctcaaaatagcccctaataac
acggttgataaagaccgggttgttcacccggaaccgatcttcaatgatatcgaatttgat
attgacgggtcaatggtactggcctttggtgaccgtactgccgttcagacaggtcttaat
aactacggcccctacgcaccgtacagcaccaattcctcgtatcaaggcaacgttggcgga
gatattcttcgggcttattcaaccggcatcagctttgttttagagaacaacgccaaagcg
ggtccggtgactggtgctggtcttaacaacaatcagggtcccggcttcggcgaattttat
aatgacaaggttgcttcttttcactctgaggatatcgtgggtggactggcgttactgcca
ggcagcggagaagtggttgccgttgcgatggatccttcgacaagtcctctggttctcaat
gctggtggtgttcgacattttaataatacgacaggcgcagtgaacagtggctatgctgtt
tacaaatctaatactggagatggcacctatggtaaggctacgggcttaggcgatttgatc
ctaacctgtagcacacccacctatctggaaatcggcaaccgggtttgggtagataccaat
aaggacggcattcaggatccctgcgaaaaatcgatggcgggcgtaaacgtggccctctat
caaggaaacacgcttatcgccacggctaccaccgatgccaacggggagtactatttcaac
aataaccccgtcagcagcacagtagtcggcacaacgtctacgacgctaattcagcccaac
acggcctatacggttcgttttggtacggatggcaccacaaatcagtacgacaacacgacg
ggtattctgacaaccagtattggtaagtttaacgtaaccacagccttcagcacagcgccc
acagccaacaccctcaatgacagcaacgccctggtatcgggcggcttcctgtcggccaat
gtgaccacgggtgcggccggttcggtgaaccatacgattgatgcaggcttcatctgcgcc
cctactacggtaggcagcgtgagcgtggtaaaagctacctgcaccggcactacggctaac
aacgatggtcaagtcctgttaacgggggttgtatgtggcgataaagcatttatctacaca
tcgggtccggctccatcgtataccgcaacgggtggcttatcggtatcagcttcggccgtt
agtttcaccggtttggtgaaccccagtacatcggcgggtcagagctattcaattattgtt
tacaacggcccctgctgctttacaaccgtaacggcagtgttgccgcagcaggtttgcacg
gcagttccttgcagcatctcagccacggctgctgccacctgcaacaacaacggcacactc
gatagcaacacggacgattacactagcttcgtcctgacgccatacaatgccgtgcagggc
agccgctttaccataaccgccacgcaggcaggctcgcccattgccatcacatttcccgat
ggaacaacaacgacttctggcgcatccatgagtgcgctgagttatgcctacccaaccccg
ttccgcacaggggtgggcacggctggcaaaggcaatatcatcatcaccatcaccgatgtc
aataacgccacctgtaccactcatgttacggtagtcgatcccggcacctgtgcaccggct
gtctgtgtgggaactacgccgacctcagtaagctatgcctaccagacgccgttccagaca
acagaactggctaacgtacctttactgctcaataaatttgataatggcggtggaacccgt
acgctgacgggggtgaaactcacctacaaaatattcgaggccaccaattacctcttcgag
aatgcctccagcacatcgaatgattttgtagcgacaacctcaggcactgcccgcatgaag
ctgagtggcaccaccattatcacggcaggcttccccaatgtcaccacaggtgatttaaca
ttacctgcgggtgtgaccgtagcggctcaggggacctattcgggcgatgccccctttgga
acctcgaatgtatcgacgcttaaaggaatggattcgtggttaacgcccctgcttcaggat
atcttcattgatccccggctcgatcctcgctgggtaacaacagctactggcaaccctggc
aacgatgctgatatttatgtatgggctcctcaatcattctcgtcgacgggagtaaccacc
tacacggccacgactgatctgactcattttgtaggaagcggaacgatccctctggtagcc
tctacggtaaatggctttggttttattggcggtggaggaaatatactctccattcaaaac
acaaaggcctatgcctgcgctacggtagagtacacctatatctgtacggtgtgttcgcta
acggccacggctacgccaacagtttgtaatccagtaacgaatcaatatgatgtatcaggc
acgattagtttaaccagtaatctggcaggtggtgtagctaccatcacggatggcacggtt
agtacgagtgtaactgtaggagtttctgctaccagtgttgcttactccctaacgggctta
acttcagacggagccaatcataccctaacggttacgttagcgggttgcggttcggcaacg
gtgggttatacagcaccggccagttgtacaatagccgcaactattttggttacttccgcg
acggtctgttacggttcatccgctacgctggtggcttcgggttgcaccggcaccatcacc
tggtcaagcggggcaacgggggcttctttcgtcaccccggccctgacggccaccactgat
tacacggctacctgtaccacctcgacggggtcaaccacctcggcggtgggcaccgtgacg
gtgatgccccaaccggtgctgagcctgcaagccagcgcaacgctggtgacggtgggcaca
ccagtgagcctgtcggccatcggttgtgtgggcacggtaagctggcccaccggcgttacg
ggcgcttccatcagtgtgaccccggctaaccccaccaatgtctactcggccacctgtacc
acaggcccgggttgcaccacggtagcaaccacgaccatcaacacagcgccctcggcgagt
ctggtggtgatctcggcgacggtctgttacggttcatccgctacgctggtggcttcaggc
tgcaccggcaccatcacctggtcaagcggggcaacgggggcttctttcgtcaccccggcc
ctgacggccaccactgattacacggctacctgtaccacctcgacggggtcaaccacctcg
gcggtgggcaccgtgacggtgatgcgccaaccggtattgagtctgcaagccagcgcaacg
ctggtgacggtgggcacaccagtgagcctgtcggccatcggctgtgtgggcacggttagc
tggtcaacgggtgcaacgggggctgctatcagtgtgaccccggccaaccccaccaatgtc
tactcggccacctgtaccacaagcccgggttgcactacggtggcctccaccaccatcagc
acgaccctagcctgctcactgagcgtaacgaccacgagcctgcctaaaggacaggtggga
gttgcttataaccagactatcgtaaccactggcggtacggctccgttgaacttctcggtc
tcaggtggtaacctgccaacaggcctgagcctcaacgccacgaccggtatcatctccggt
acaccaaccgttagtggatcattccccaccacgatcaccgttaccgatgccaaagcctgt
caggttaaactgtccctctcggtcttccagatcgacccggctccacaaaccgcatctttg
ggtgactttgtctggtacgataccaataagaatggccagcaggatggacttgaaacgggc
gtggccggggtaattgtcaagctgtttgaccccacctcgtcgacggtaacccctattgcc
agtctgacaactgatgccagtggcaagtacctgtttaccaacctcactccgggccagtac
tgtgtgatcttccagacaacgactttgcctgtgggctacagtctgactctggccaacacg
ggggctgatgccactgatagtgatgctagtccggtaacgggtaaaacggccacctacacg
ctcacggctggtcagcaggagctgagtgtcgatgcgggcatcatcgccccggccatcagc
ctcaatctggataaacttgttgacaagagccgggcaaaagtgggggatgtgctgacttac
accctggtgctgaccaacacaggcaccgtcaccgcaaccaatgtggtggtgagcgacgta
agcacggttggtttgcgctatgtagcggggtcggctagcgccccggcgggcagtaccttc
acgcagggcaatccgctcagcacgtggactatcgccagtctgggggcgggtcaacacctg
gatctgactttccaggccattgccgacagtagtggtattctttacaacacagctacgatt
ccgggcgatacggcccgcgtttgcaccagcattccttatcaggtctgcaagggaagtgtg
tatcaattccagttaggtgttgccgttgggagtcagtcgtatcaatggtataaggacggc
gtggccctaacaggcgccagctcgaatacattactggtaacggcagcgggttcctacagt
gtggccatcaatggggtggcgggttgtttgacaggctcttgctgtccgtttatcatcgaa
gagattgccgatgtggcatcttattcgctggcggctacgacgccaacctgtaacggcaca
gtggctcagaccaacggtcaactaacggtcacaggtttggtgagcagcacggctacgtca
tatacttaccagatcgtactagggagcagttttgacagtggcacgttgctaacggttaat
aagacggctgttcctctgagtagtattctgagcagtagtttggcgcccggaacgtacaca
gtacggatttacaatgcatccggctgttatcgtgacgtgacagcggtgattctacccgcc
aactgtgtttgtccgccaccgaagtgtgttccgtttgttgtacagaagatacgctga |