Spiroplasma sp. TU-14: STU14_v1c01050
Help
Entry
STU14_v1c01050 CDS
T06095
Symbol
potC
Name
(GenBank) spermidine/putrescine ABC transporter permease
KO
K11069
spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein
K11070
spermidine/putrescine transport system permease protein
Organism
spit
Spiroplasma sp. TU-14
Pathway
spit02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spit00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
STU14_v1c01050 (potC)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spit02000
]
STU14_v1c01050 (potC)
Transporters [BR:
spit02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Spermidine/putrescine transporter
STU14_v1c01050 (potC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Lipoprotein_8
SBP_bac_8
SBP_bac_11
DUF5056
DUF6753
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOX43448
LinkDB
All DBs
Position
120708..123323
Genome browser
AA seq
871 aa
AA seq
DB search
MKKFLKSSYMALIMLFIYVPIMILILFSFNSGESMSIFNGFSDRWYKQLANEQPFLQSII
VSVFTAVIATVISVVIGTLAAIGLSRARKITQKMTLSITNIPLINADIITAVSLMMLFIA
LGANFGMLTLVMAHISFDVPYVIITVLPRLRKVDPKLLEASLDLGAKPSQTLRKIILPIL
KPAIIAAAAIAFAMSFDDFIISYFTGGDDVNVATFIYTMKRIKPFINAFGTICIAIIAFV
IIGWNGWNIYKINYNRLRREMLKGTYKDKDIMRYEKKLALFYHQLNTKTFQSEKQKEHLR
WKIIKLEKKYDKTLVWIKNKKQTFIERQEIKENINKMSRKKFRWFARSWKPATLAIISVG
SIGLLTGVYISNNIYDLAVANWGGYITSDLISNFEKKYNVKVKYSVYDSNETLYNKLYTT
HYDVMVPSDYMVNKLAQEGRLEEIDYQKLNSVDKNFNIIKPNPTYDENNSGKWTIGNQYF
NDLNVDIAAVKKINPEFYKNCIETNIDPTQSKCFDKTYAASLNNGLLNILNKNEVKVTDK
LAVQSNADIKTIVNYSLPYFWGEVSLVVNPTKSNLDFLQDIFSKANVNLPGQAKGKFGYQ
REKWDSAINRDQIAINEVTYNNVYSNGISWDILWQAAAAKKRVLVNNDPRNLFMLANEKN
YFEPVPKTQSQVDVDYNELTTLLKYNNVALMNDELLNAVGDGNFDFAFMYNGDAIYADTL
FANSRKEASGTKLIITRPRATTQWTPQTTEGTNIWSDNMVLAKNARHKDLAYKFMNYVVQ
NSTALTEEANYTSPYQQVMDYENNYNYYSNGHNPDSGAMVNYRRDYVPVARFDQTLQQYI
AKPQISDGPFMLTDLDAYLLNKYNILIAGKN
NT seq
2616 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttcttaaatcatcttatatggcattaattatgttgtttatttatgttcca
attatgattttaattttgttttcatttaacagtggagagagtatgagtatctttaatggt
ttttctgatcgttgatataagcaacttgccaatgagcaaccatttcttcaaagtattatt
gtttctgtttttaccgctgttattgcaacagtaatttcggttgtaattggtacattagca
gcgattggtttaagtcgtgcccgcaaaattacacaaaaaatgacattatcaattactaat
attccattaattaatgctgatattattacggctgtttcgttaatgatgttatttattgcg
ttgggagctaactttgggatgcttaccttagtaatggcccatatttcgtttgatgttcct
tatgtaattattaccgttttaccacggttacgaaaagttgatccaaaattacttgaagca
tcattagatttaggagcaaaaccatcacaaacattacgaaaaattattttgccaatttta
aaaccagcaataattgctgctgctgcaattgcttttgcaatgagttttgatgattttatt
atttcatatttcacggggggtgatgatgttaacgttgcaacattcatttacacaatgaaa
cggatcaaaccttttattaatgcatttggaacaatttgcattgcaattattgcttttgtt
attattggttgaaacggttgaaacatttataaaattaattacaatcgcttacgtcgtgaa
atgttaaaaggaacctacaaagataaagatattatgcgttatgaaaagaaattagcgtta
ttctatcatcaacttaataccaaaacatttcaaagtgaaaaacaaaaagaacatttacgt
tgaaaaattattaaattagaaaaaaaatatgacaaaactttagtatgaattaaaaataaa
aaacaaacttttattgaacgacaagaaattaaagaaaacattaataagatgtcacgaaaa
aaatttcgttgatttgctcgtagttgaaaaccagcaacgttagcaatcatttcagttggt
tcaattggactattaacaggagtttatattagtaataatatttatgacttagcagttgca
aactgaggtggttatattacttcggacttaattagtaactttgaaaagaaatataatgtt
aaagttaaatatagtgtttatgatagtaatgaaacattgtataacaaactatatacaaca
cattatgatgttatggttccaagtgattatatggttaataaattagcacaagaaggacgc
ttagaagagatcgactatcaaaaattaaatagtgttgataaaaacttcaatattattaaa
cctaatccaacatatgatgaaaataattcaggtaaatgaacaattggtaatcaatatttt
aatgatttgaatgttgatattgccgcagtcaaaaagataaatccagaattttataaaaat
tgtattgagacaaatattgatccaacgcaatcaaaatgttttgataaaacatatgcggcg
tcattaaataatggtttgttaaatattttaaataaaaacgaagttaaggttactgacaaa
ttagcggtccaatctaatgctgatatcaaaacaattgtaaattacagtttaccatacttt
tgaggagaagtttcgttagttgttaatccaacaaaaagtaacttagattttttacaagac
attttttccaaagcaaatgttaatttaccaggacaagcaaaaggtaaatttggttatcaa
cgtgaaaaatgagattctgcaataaatcgtgatcaaattgctattaatgaagttacttac
aacaatgtttattcaaatggaatttcatgagatattctatgacaagcagcggcagctaag
aaacgagttctagtaaataatgatccacgaaatttatttatgttagcgaatgaaaaaaac
tattttgaaccagttccaaaaacacaaagtcaagttgacgtagattataatgagctaaca
acactgttaaaatataataatgttgctttaatgaacgatgagttgcttaatgctgttggt
gatggaaactttgactttgcttttatgtataatggtgatgctatttatgctgacacatta
ttcgcaaatagtagaaaagaagctagtgggacaaaattaattattactcgcccacgagca
acaacacagtgaacaccgcaaacaactgaaggaacaaatatttgaagtgacaatatggta
ttagcaaaaaatgctcggcataaagatttagcctataagtttatgaattatgttgttcaa
aattcaacagcattaacagaagaagcaaattatacttcaccttatcaacaagtaatggat
tatgaaaataattataactattatagtaatggtcataatcctgattcgggggcaatggtt
aactatcgtcgtgattatgtcccagtagcaagatttgatcaaactcttcaacagtatatt
gctaagccgcaaatttcagatggtccatttatgttaactgacttagacgcgtatctttta
aataaatataatattttaattgctggaaaaaattag
DBGET
integrated database retrieval system