Spiroplasma sp. TU-14: STU14_v1c01900
Help
Entry
STU14_v1c01900 CDS
T06095
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
spit
Spiroplasma sp. TU-14
Pathway
spit03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spit00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
STU14_v1c01900 (rnj)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
spit03019
]
STU14_v1c01900 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:
spit03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
STU14_v1c01900 (rnj)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
DUF4120
Sigma_reg_C
DUF365
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOX43533
LinkDB
All DBs
Position
217436..219103
Genome browser
AA seq
555 aa
AA seq
DB search
MAKISFFALGGLDERGKNLYCIEVEQDIFIFDAGTKNPERGILGIDVVISNFDYLKENRA
RIKGIFITKPSDECSEGLTYMLKELPVPVYGSDLTCNVLKFHLQRFKVRGKEECFKVINA
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IVAKNKVLLFLSEASTASRRDYTAPNHKIKNYIERAVKEAEGRIILACFDQDLHKISELF
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NT seq
1668 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gaaacaggaaaaacaccaattattttagcaattgtgaatgaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
