Spiroplasma sp. TU-14: STU14_v1c07190
Help
Entry
STU14_v1c07190 CDS
T06095
Name
(GenBank) RpiR family transcriptional regulator
Organism
spit
Spiroplasma sp. TU-14
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SIS
HTH_6
HTH_24
MarR
MarR_2
Sigma54_DBD
Bro-N
HTH_Tnp_1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOX44055
LinkDB
All DBs
Position
813264..814106
Genome browser
AA seq
280 aa
AA seq
DB search
MKIITYDKENQLTELQIQLIEKLNNDIQSVLELTINELADSLFINTSTLSRLIKKLGFEN
YSKFKVWVAGKYNNIKEFDIQEDDTTLHNVIDNIYKLHTYALDETYRNLKMNQLERIIDT
IHNSNRIIIWGISRHSLICDNLNLHLNVLKYNSTYLSNYYATIQIIETLGAEDLLILVSK
SLQDAEYHFLIEIASKRNVQIILLTINKEYKGPANLQKLTLENTEILNFYIDNPRYVSRL
MLINIIFGMLIAKYHPTHNEEYQDYYLAIDEWHEYVKKMK
NT seq
843 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataataacatatgacaaagagaaccagttaactgaattgcaaattcaattaatt
gaaaagttaaataacgatattcaaagtgttttagagttaactatcaacgaattagcggac
agtctttttattaatacatcaacattaagtcggttaattaaaaaattaggttttgaaaat
tatagtaaatttaaagtgtgagttgccggaaaatataataatattaaagaatttgatatt
caagaagatgacacaaccttacataatgttattgataatatttataaattacacacctat
gctctggatgaaacttatcgcaatttaaaaatgaaccagttagaacgaattatcgataca
attcataatagtaaccgcattattatttggggcattagccgtcatagtttaatttgtgat
aatttaaatctccacttaaatgttttaaaatataattcaacttatttatcaaactattat
gcaacaattcaaatcattgaaacgcttggagcagaagatctcttaatcttagtttctaaa
agtttacaagacgctgaatatcatttcttaatcgaaattgcatcaaaacgaaatgttcaa
attattttactaacaatcaacaaagaatataaagggcccgctaatttacaaaaattaact
ttagaaaatacggaaattttaaatttttatattgataacccccgttatgtttcacgttta
atgttaattaatataatatttgggatgttaattgctaaataccatcctacccataatgaa
gaatatcaagattattacttggcaattgatgaatgacatgaatatgttaaaaaaatgaaa
tag
DBGET
integrated database retrieval system