Shewanella pealeana: Spea_1533
Help
Entry
Spea_1533 CDS
T00606
Name
(GenBank) Ig domain protein group 1 domain protein
Organism
spl
Shewanella pealeana
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Invasin_D3
MG4
Glyco_hydro2_C5
Ig_SMCHD1_6th
DUF8186_C
DUF4198
DUF7629
DUF6795
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV86858
UniProt:
A8H2S1
LinkDB
All DBs
Position
1862800..1865223
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MKSAYSIFIAFIWSFILVGCSGGGSISEDDDGGTTPDPTTISIALSTTNSLISVAENAQI
TAKVTDSNGAAVSTLVSFSLNNATYGSFDPATGEVSTDNEGNAVVTLNTASINTGATVTA
TTSTGEAASINVTMVGDGGDAGNGASVAISLVDENDQPTSGISSLSPGFLVATVTGLSKE
TIVTFSTSRGEIPINTAVTENGVARAQILAGAEPGAANATVTILTGETASLPFTIGATNV
LMGSGTPFESGVASINPVSVSAGGTASISVTLQDDQGKLFTEPAEVIFSSICSAKASPEA
EISSPVIAVNGVATSTYLAKGCVGEDSVNVSANVGGKALTASAKLTVLPASIGSIYFVEA
LPENIRLKGTGGAEASTVKFKVLDSNGNPVKNQQVNFSLNTEAGDIEIDPANATTDANGI
AQTVVNSGTVATSVRVTAIVDGKTPEISSQSNLLVISTGLPDQDSFSLSVDNASPEGWDY
DGTEVNVTARLADAFNNPVPDGTAVSFTTEGGSIDPSCVTLNGTCSVKWTSQNPRPTGAV
LDSAPSETPKLGQPYGGRVTILATAIGEESFPDTNGNGRFDASEVTDFNSKHDVSGNSYD
LTEAFVDHNEDTVYNPETTGEDGGDLETFADFNNNSVFDGADGLYNGSLCALDVNGTAHS
GCSTTNKSLNVRASAVIVMAGSHAYSSTPVISDSCIDKPGEVDACDGLNDNNTLDILGKS
TGGVSIIVSDLHNQPLPSGTILTFKPSVGSLASNGTFTIPSTNKNGALPYSVVIKGADDP
ESGTLVIEAVTPNGDLTLIATISMTIH
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtcagcttatagcatttttattgcttttatatggtcatttattctcgttggttgt
agtggcggagggagtatttctgaagacgatgatggtggaacgactccagatccaacaact
atttcaatagcgttaagtacgacaaattcacttatttcggttgcagaaaatgcacagatt
acagctaaggtgaccgattcaaatggagcagcagttagcacgttagtctcattttcatta
aataatgcaacctacggctcttttgatcctgcaactggtgaagtctctactgataatgaa
ggcaatgcagtcgttaccttaaacacagcttctattaatacaggagccacggttacagca
acaacttctactggagaagccgccagtattaatgtcactatggtcggtgatggtggtgat
gcgggtaatggtgcatcggtagccatcagcttagttgatgaaaatgatcagcctacatca
gggatcagtagtctatctccaggtttcttggtggcgacagtgactgggctttctaaagag
acgattgttaccttttctacaagccgcggtgagatccctattaataccgcagtaaccgaa
aatggggtcgctcgagcacaaatactcgccggagctgaacctggggcagccaatgctaca
gtaacgattttaactggtgaaacagccagtctcccctttactattggagcaacaaacgtc
cttatgggaagtggtacgccatttgagtcaggtgtagcttcaattaatccagtcagtgta
tctgctggtggtaccgcaagtatttcggttaccttgcaagacgatcaaggcaagttgttc
actgaacccgcagaagtaatcttttcttctatctgttcagctaaagcatcacctgaagct
gaaattagttcacctgttattgccgttaacggtgttgcgaccagtacctatcttgcaaaa
gggtgtgttggagaggatagtgttaatgttagtgccaatgtaggtggtaaagcattaacg
gcttctgctaagttgacagtgctgccagccagtattggtagtatctatttcgtcgaggct
ctgcccgagaatattcgtttaaaaggcactggtggtgctgaagcatcgacagttaaattt
aaagtactagatagtaacggtaatccagttaaaaaccagcaagtgaacttttctctaaat
acagaagctggagatattgaaattgatcccgctaatgcaacaacggatgcaaatggtatt
gcacagacagtagtgaattcaggtacggttgcaacatctgtgagagtgactgccattgtt
gatggtaaaacgcctgaaatatctagtcagtcaaacttactggtgatttcaactggtttg
ccagatcaagatagtttctctttatcagttgataatgcgagtcccgaaggctgggattac
gatggcacagaagttaacgttactgctaggcttgccgatgcctttaataacccagtacca
gatggaacggcagtttcgttcactaccgaaggtggttctattgatccttcttgtgtaacg
ttaaatggcacttgttctgtaaagtggaccagtcaaaacccaagaccaactggtgcggtt
ctcgatagtgctccttcggaaacaccaaagcttgggcaaccatatggcgggcgtgtcact
attctcgcaaccgctatcggtgaagaatccttccctgatacgaacggtaatggtcgcttt
gatgcctccgaagttactgattttaatagcaagcatgatgtatcaggtaatagctatgat
ctaacagaagcatttgtcgatcataacgaagacacagtctataaccctgaaacaactggt
gaagacggcggtgatttagaaacattcgcggactttaacaataatagtgttttcgatggt
gcagatggtctatataacggtagtttatgtgcacttgatgtaaacggtacagctcattct
ggctgttcaacgacaaataaatcattaaacgttagagcgagtgccgtgatcgtgatggca
ggcagtcacgcttattcatcgactccggttatctcagatagctgtattgataaacctggt
gaagtcgatgcttgtgatggccttaacgataataatacgctagatattttgggtaaatcg
acaggtggcgtatcgattatagtaagtgatctacacaaccaaccgttaccttctggtacc
attttgaccttcaagccatcagttggcagtttggcaagtaatggcacatttactattcct
tcgactaataaaaatggcgccttgccgtacagtgttgtgatcaaaggtgctgatgaccct
gagtcaggtacgctagttattgaagctgttacgccaaatggtgatttaacactgattgcg
acaatatcaatgaccattcattga
DBGET
integrated database retrieval system