Shewanella pealeana: Spea_2557
Help
Entry
Spea_2557 CDS
T00606
Name
(GenBank) histidine kinase
Organism
spl
Shewanella pealeana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
HATPase_c_3
PAS_8
PAS
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV87877
UniProt:
A8H5P0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3110390..3113818)
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search
MNLTVLVGTIAIVYVLLLFLIAWGAERWFGGITKRIQTWVYGLSLAVYCSSWSFLGTVGQ
SAQDLWSFLPIFIGPILIFTFGFSLLRKMVIVSKAQNITSVADFIAARYGKSQLLAAIVT
FIALFGIMPYIALQLKAMVFSLNLFQPYGELFDGAKVSLIITAILAIFAILFGTRKLDAT
EHNPGMMLAIAFESLVKLGAFLLVGIVISFGVFDGFGDIWQQATERDLINEPNIRLESLT
PELLVGMAAFLCMPRQFHVMMVECENESTILKARWLFPLYLVLFGMFVAPLALAGQLLLG
DAVAADTYVINLPLALNQPWLAVVALLGTLSAATGMVIVAVVTISVMVSNEWLVPLMLRT
GQIREKNFSQFSQLLLNARRLAIVLILGLGYFSYLSFMDSDSLSSLGMLSFGAFAQLAPA
LIGGMYWKHGNRSGVFLGLAVGFSCWCYILLQGVVNSPTIVTSEFVLLESITPNVRDILI
ALLANCACYMLGSIWFRAGVAERMQASAFVTPGQLKKDINRKSSPVSQQDLLILASRFVS
PTRAYESFSAFSEEAVKSDSWHKVAPPELIAHTEHMLAGVLGASSASLVLDSVLQGRDLA
LDEVFSLVDEASSKIILSQDMLRGAIEHAYEGMSVVDKDLNLVAWNYKYAELYNYPEHFL
QAGMPISDVVRFNAARGFCGVGDIEAQVEKRVQHMRNGTPHVSERQRKDGKVIKIQGNPM
PSGGFVMTFTDITQYRLQAKALQQANETLEARVQERTYELSMLNSKLLEAKAQEEMANAS
KSRFLAAVGHDLMQPLNAARLFTASLSQYPNLDQEGKTTLNHVNSSLKIAGELLTDLLDI
SKLDSDMVEVNRRDFAIADLIDGLAVEFDAMSKDCLIKFNYVPSSATINSDASLLRRVLQ
NFLTNAYRYAKGNRVLLGCRRRGDELEIQVIDTGCGIDESETTEIFKEFKRLDNPESKSV
SGLGLGLAIADRISRVLSHEINVRSELGKGSMFSIRVPIGKENTAPKLKKEPSLLQPLAG
VKVLCIDNEEAILAGLESLLSRWQCEVICASDLADARIKLGLKGVAPDIILADYHLDNDQ
NGVDAMDGIRNLYGEHLPGILITANTQKELIDDMQRRGYHYMAKMVKPAALRALISSLVR
KK
NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacttgaccgtgttagttggcaccattgccattgtttatgtgctgctgctgtttcta
atcgcttggggcgctgagcgctggtttggcggcatcactaaacgcatacaaacttgggtc
tatggtttaagtctcgcagtatactgttcatcatggagttttcttggaacggtagggcaa
tctgctcaggatctgtggtcatttctgcctatctttatcggtccaatcttaatatttact
tttggctttagcttactacgtaagatggtgattgtttctaaggcacagaatatcacctct
gttgcagattttattgccgcacgctatggcaagtcacagcttctcgccgcgattgttacc
ttcatagccctgtttggaataatgccttatatcgcactgcagcttaaagctatggtgttt
agtcttaatctttttcagccctatggtgagttattcgatggggctaaagtatcactaatt
atcactgccatcttggccatttttgccattttatttggtacgagaaaacttgacgcaact
gaacataaccctggcatgatgttggcgatcgcctttgagtctctggtgaagctcggagcg
ttcttgctggtaggtattgtgattagtttcggtgtctttgatggttttggcgatatctgg
cagcaagccacagagcgagacttaattaatgagcccaatattcgcttagagtcgcttacg
cctgagttactggttgggatggcggcttttctctgtatgccacgccagtttcacgtgatg
atggtggagtgtgaaaatgagagcactatacttaaagcgcgctggttatttccactctac
ttagtgttgtttggcatgttcgtcgcgccgttagcattggctgggcagcttttactgggt
gacgcagttgcagccgatacgtatgtaataaaccttcctttagctcttaatcagccctgg
cttgcggtcgtagcgctcttagggacgctttctgcggcaactggcatggtgattgtcgcc
gtagtaaccattagtgtgatggtgagtaatgagtggttagtgccattgatgctgcgtact
ggtcagataagagagaaaaattttagccagttttcccaattgctacttaacgcaagacgt
ttggcaatcgttctgattttggggcttggttactttagctatctatcatttatggatagt
gactcgctttcatcactgggtatgctctcttttggcgcttttgctcagttagcacctgcg
cttataggtggtatgtactggaagcatggaaatcgcagtggtgtatttttagggcttgca
gtgggttttagttgttggtgctacatcttattacaaggtgtggtgaactcgccgacgatt
gtcacttctgagtttgtactgcttgaatcgattacgcctaatgtgcgcgacattctcatt
gcgttattagcaaactgtgcctgttatatgttgggctctatctggtttagagctggagtg
gcagagcgaatgcaggcgagcgcatttgtaacccctggacaacttaagaaagatattaat
agaaagagtagcccggtttcacagcaagacttacttattttagccagtcgctttgtgagc
cctactcgcgcctacgagagcttttctgcattctcagaagaggcggtaaaaagtgatagc
tggcataaagtggcgccgccagaacttatcgcccatacagagcatatgttagccggagta
ttaggggcttctagcgcctccttggtgcttgactctgtgctacaaggacgtgatttagcc
ctagatgaagtgtttagcttggtcgatgaagcctcctcgaagataattttaagccaagat
atgctacgtggcgctatagagcacgcctatgaaggcatgagtgtggttgataaagatctt
aatttggtggcttggaactataaatacgcagagctatataattatcctgagcatttcctc
caagctgggatgccaattagcgacgtggtgcgctttaatgcagcccgaggattttgtggt
gtaggagacatagaggcgcaagttgaaaagcgagtacaacatatgcgcaatggcacgcca
cacgtttccgagcggcaacgcaaagatggcaaggttattaaaattcaaggcaacccaatg
cccagtggtggttttgtgatgacctttaccgatattactcaatatcgtctgcaagccaaa
gcactgcagcaagcaaacgaaactttagaggccagagttcaagagcgtacctatgagcta
tctatgctcaatagcaagctgcttgaggctaaggctcaagaggagatggctaatgcgtct
aaaagtcgcttcttagcagcagtaggtcatgatttaatgcagccgttaaatgcagcacgg
ctgtttaccgcctctttatcgcaatatccaaatctcgatcaagaggggaaaacgaccctc
aaccatgttaacagctcactgaagattgcaggagagctgcttaccgacctattggatatc
tctaagcttgactccgatatggtagaagttaatcgacgtgattttgctattgctgattta
atcgatggtttagcggtcgagtttgatgcaatgtctaaggattgtttaatcaaatttaac
tatgtcccaagctcggcaaccatcaattcagatgcgagtctgttgcgacgtgtactgcaa
aatttcctaacaaatgcttatcggtacgctaagggcaatcgagtcttattaggttgtcga
cgccgtggtgatgaactggagatccaagttatagacacaggttgtggtatcgatgagagt
gaaacaaccgagatttttaaagagtttaaacggctggataaccctgagagcaagagtgtg
agcggcttagggttaggcttagcgattgcagataggatcagccgagtgctatcccatgag
atcaatgtcagatctgaactgggtaaaggctctatgttctctattcgagtaccaataggt
aaagaaaatactgcacctaaacttaaaaaagagccttcattgttacagcctctagcggga
gttaaggtgctgtgtatcgataacgaggaggcaattttagccggacttgagagtttatta
agccgttggcagtgcgaagtgatatgtgcaagtgatttggctgatgctcgcatcaagctc
ggattaaaaggggtagcccccgatattatccttgctgactatcatttggataacgatcaa
aatggtgtcgatgccatggacggtattagaaacctgtatggtgagcacctaccaggtatt
ttgatcaccgccaacacccaaaaggagttgatagacgatatgcagcgccgtggttatcat
tatatggcaaagatggtcaagcctgccgctttaagggcattaatctcaagcctagtaagg
aaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system