Shewanella pealeana: Spea_2907
Help
Entry
Spea_2907 CDS
T00606
Name
(GenBank) Polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA
Organism
spl
Shewanella pealeana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PP-binding
ketoacyl-synt
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
KR
KAsynt_C_assoc
PKS_DH_N
PS-DH
adh_short
ApeI-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV88225
UniProt:
A8H6N8
LinkDB
All DBs
Position
3544440..3552491
Genome browser
AA seq
2683 aa
AA seq
DB search
MSQTSKPTKSAKVTEQAQDSQADSRLNKRLKDMPIAIVGMASIFANSRYLNKFWDLISEK
IDAITELPSTHWQPEEYYDANKSTPDKSYCKRGGFLPDVDFNPMEFGLPPNILELTDSSQ
LLSLIVAKEVLADANLPEGYDRDKIGITLGVGGGQKISHSLTARLQYPVLKKVFASSGIS
DQDSEMLIKKFQDQYVHWEENSFPGSLGNVIAGRIANRFDFGGMNCVVDAACAGSLAAMR
MALTELTEGRSEMMITGGVCTDNSPSMYMSFSKTPAFTTNETIQPFDIDSKGMMIGEGIG
MVALKRLEDAERDGDRIYSVIKGVGASSDGKFKSIYAPRPEGQAKALNRAYDDAGFAPHT
LGLIEAHGTGTAAGDAAEFAGLCSVFRDENDTKQHIALGSVKSQIGHTKSTAGTAGLIKA
ALALHHKVLPATINVSQPSPKLDIENSPFYLNTETRPWLPRADGTPRRAGISSFGFGGTN
FHFVLEEYNNEHSRIDSEKAKYRQRQVAQSFLVSASDKATLINELSTLSASATQAEFILK
DAAANYPLRELKANAPRIGLVANSSEELVNQIKQAVSKLESSDDSAWQLPGGTSYRANAA
IDVANKESGKVAALFAGQGSQYLNMGRELTCYYPEMRQQFVTADKVFAANNKMPLSQTLY
PKPVFNKDDLKTQEATLTNTANAQSAIGAISMGQYELFTAAGFNADMVAGHSFGELSALC
AAGVISSDDYYKLAFARGDAMATKAPAKDGVEADAGAMYAIITKSAADLEAVEATIAKFD
GVKVANYNAPTQSVIAGPTDSTGEAAKALSQLGYKAINLPVSGAFHTELVGHAQAPFAKA
IDAAKFTKACRALYSNATGTVYDTSATKIKASFKKHMLQSVRFTAQLEAMYDAGARVFVE
FGPKNILQKLVQGTLADKANEICTISINPNPKGDSDFQLKQAAVQLAVAGIKLDNIDPYQ
ADIAAPEKKSPMSISLNAANHISKATRAKMAKSLETGIVTSKVEHLIEEKIIEVEKVIEV
ERIVEKVVEVEKLVEVAVPAQAGVVQGSSIQASSVIDSGIESQVVSKNSKPAAHSVSGDA
LSNFFAAQQQAAQLHQQFLEIPQQYGETFTTLMTEQTKLAGSGIAIPESLQRSMEQFHQL
QAQTLQSHTQFLEMQTGSNIAALNLLNGSPATYAPVIENKVIQTEVVQREVVAQPAIIAT
PATPVQPAPVQTTAVQTAPTQAPQVKTAPVATTPQVQAPQVVRQAAPAQAAVVPTNTSPV
AVISAETALSATLSSEKVQATMLEVVAEKTGYPTEMLELEMDMEADLGIDSIKRVEILGT
VQDELPGLPELSPEDLAECRTLGEIVNYMNSKLTNTSAAAALNVSAAEGSAVSSTPVHSG
LSAETALSAQKVQATMMSVVAEKTGYPTEMLELEMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELP
GLPELNPEDLAECRTLGEIVAYMGSKLPAEGSANTSAAAALNVSAAEGSLSATQVQSTMM
SVVSEKTGYPTEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLG
EIVAYMNSKLTNTSAAAAQVPQVNAAPTTNGLSAETALSATLSSEKVQSTMMSVVAEKTG
YPTEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVAYMGS
KLPAEGSMNSQHSSTVVSTTETPVNGLSAAKVQSTMMSVVAEKTGYPTEMLELSMDMEAD
LGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMNSKLSTAGATVASTVAA
ATDAVKSVADTIASTLELPPHSEVALKKLNAADKLQDCFAADTTIVINDDGHNAGVLAEK
LTKQGLKVAVVRLPDGQPQSPLSSDVASFQATSIDETGITAIINQVEQQLGQIGGFIHLQ
PEANESNQADAVNLNEQGFTHLSQAFLWAKLLQPKLTASSDKRRSFITVSRIDGGFGYLN
IDALKDAELNQAALAGLTKTLSHEWPSVFCRALDIAVDVDATHFADAIASELFDANNQLA
EVGIAADKQGNVSRVTLVAGEASEKHSASALNSSDKILVTGGAKGVTFECALALAKRTQS
HFILAGRSELLAIPAWAENKQISELKPAAIAHIISTGSKPTPKQVETLVWTVKSSIEINT
ALEAFNQVGASAEYVSMDVTDTAAITAALNGRSNEITGLIHGAGVLADKHIQDKTIEELA
RVYGTKVNGLKALLAALDSSKVKLLAMFSSAAGFYGNTGQSDYAMSNDILNKAALQFSAR
NPQAKVMSFNWGPWDGGMVTDALKKMFTDRGVYVIPLKAGAELFATQLLGETGVQLLIGT
SMQGGDSTKADGSSQAEGSKEAASVKKLNAGEVFNTSRPLAPVALTPMTLTRALNPNAMV
FIQDHRISGNPVLPTVCAIQWMREAASKMLGAQVKVLDYKLLKGIIFDSKDAQEITLELT
PTDNGQMSALISSQGRPQYKATLAVSSERFTTKSFDLMGDAVTSASELYSNGTLFHGPRL
QGIKQVFNFDDAGLLAHCELPQVDSSDCGEFVATTHIGGSQPFAEDLLLQAMLVWARLKY
GAASLPSSIGEFISNKPLAFGDKAILELEVVKTNARSLEANVTLYHENGELSAMMKGAKV
TISKNLNSAFLNETALSVGESALSDSKKALSAEEKALSKGERA
NT seq
8052 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccagacctctaaacctacaaagtcagctaaagtgactgagcaagcacaagactca
caagctgattcacgcttaaataagcgccttaaagacatgcctatcgccatcgttggcatg
gcaagcatctttgctaactctcgttacttgaataagttttgggacttaatcagcgaaaaa
atcgatgccatcaccgaattgccatcgactcactggcaacctgaagagtattacgatgcg
aacaagagcaccccagataagagctactgtaagcgcggtggcttcttgccagatgttgac
ttcaacccaatggagtttggcctgccgccaaatatcctagaactaaccgactcatcacag
ctgctttctctgattgttgctaaagaagtactagccgatgccaacctgcctgaaggttac
gacagagataagattggtatcactttaggtgtcggtggcggccaaaaaattagccacagc
ctaacggcgcgtctacagtacccggtactgaagaaagtattcgcgagcagcggcattagc
gaccaagacagtgaaatgttgatcaagaagttccaagatcaatatgttcactgggaagaa
aactcattccctggctctctcggtaacgtaattgctggtcgtatcgctaaccgtttcgat
tttggtggcatgaactgtgtggtcgatgcagcctgtgctggctcactcgcggctatgcgc
atggctcttaccgagctgaccgaaggtcgctcagagatgatgatcaccggtggtgtgtgt
accgacaactcgccgtctatgtacatgagcttctcaaaaacaccagcctttaccactaac
gaaactattcagccatttgatatcgattcaaaaggcatgatgattggtgaagggattggc
atggtcgcacttaagcgccttgaagatgccgaacgcgatggcgatcgcatttactcagtc
attaaaggtgtgggcgcttcatcagatggtaagtttaaatctatctacgcccctcgccca
gaaggccaagcaaaagcattaaaccgcgcctatgatgacgcaggttttgcgccgcacact
cttgggcttatcgaagcgcacggcacaggcaccgctgctggtgacgccgctgagtttgcc
ggcctttgctcagtatttcgcgacgagaacgacactaaacaacacatcgcactgggctca
gtgaagtcacaaattggccacactaaatcaactgcgggcactgcaggcctaatcaaggct
gcattggcactacaccacaaagtgttgccggcaacaattaacgtcagccaaccaagcccg
aagcttgatatcgagaactcaccgttttatctcaatactgagactcgtccatggttgcct
cgcgccgatggtacgccgcgccgtgcaggtattagctcatttggttttggtggcactaac
ttccacttcgtactcgaagagtacaacaatgagcacagccgcatcgatagcgagaaagct
aagtatcgtcagcgtcaagttgcccaaagcttcttagtcagtgctagcgataaagcgacg
ctgataaatgagctaagcacactgagtgcttctgctactcaagctgagttcatcttaaaa
gatgccgcagcaaactatccactgcgtgaacttaaagccaatgcaccacgtatcggcctc
gtcgcaaatagtagcgaagagctagtcaaccaaatcaagcaagcggtctctaagcttgaa
tcgagtgatgatagcgcatggcagcttccaggcggcactagctaccgcgcaaatgctgca
attgatgttgcaaacaaagagtcgggtaaagttgccgcgctgtttgcaggccaaggctcg
cagtatctaaacatgggccgcgagctgacttgttattacccagagatgcgtcagcaattt
gtaactgccgacaaagtctttgccgctaacaacaagatgccactgtcgcaaacactttat
ccaaagcctgtgttcaataaagatgatttaaagacacaagaagcaacactgaccaatacc
gctaatgcacagagtgcaatcggcgctatctctatgggtcagtatgagctattcactgct
gccggttttaatgccgatatggttgcgggtcatagctttggtgagctgagcgcattgtgc
gctgccggtgttatctcatctgatgattactacaagctcgcttttgctcgcggtgatgcc
atggcgactaaagcaccagcaaaagatggtgttgaagccgacgctggcgccatgtacgcg
attattaccaagagtgcagcagatcttgaagccgttgaagcgactatcgctaaatttgat
ggcgtaaaagtggcaaactataacgcccctactcaatccgtgattgcaggtcctaccgat
tcaacaggcgaagcggctaaagcgctaagtcagctgggttacaaggcgattaatctacca
gtatcaggtgcattccacaccgaacttgtgggtcacgcccaagcaccatttgctaaagcg
attgatgcagccaagtttaccaaggcttgccgcgcactttactccaacgcgactggcaca
gtttacgataccagtgcaacaaagattaaagcttcgtttaagaaacatatgctgcaatcg
gtacgtttcactgcgcagcttgaagccatgtatgacgctggcgctcgagtatttgtcgag
ttcggtccaaagaacattttacaaaagttggtacagggcactctggcagataaagcaaat
gaaatttgcactatctcaatcaaccctaaccctaaaggcgatagcgacttccagcttaaa
caagccgcggttcagttagctgttgcaggtatcaagcttgacaacatcgacccgtaccaa
gccgatatcgcagctccagagaaaaaatcgccaatgagcatctcgcttaacgctgctaac
catatcagtaaagcgacacgcgctaagatggccaaatcattagaaactggcatcgtcacc
tctaaagtcgaacatctgattgaagagaaaattatcgaggtcgagaaagttatcgaagtc
gaaaggattgtcgaaaaagtcgttgaagtagagaagcttgttgaagtcgcagtaccagcc
caagctggtgtagtacaaggcagttcaattcaagccagttcagttatagattcaggtata
gagagtcaagtcgtgtctaaaaacagtaagccagcagctcatagcgttagcggtgatgca
ctaagcaacttctttgcagcccagcagcaagctgcccagcttcatcaacagttcctagag
atcccgcagcagtatggcgagacctttaccaccttgatgacagagcaaactaagcttgca
ggttcaggtattgcgatcccagagagcctacaacgctcgatggagcaattccaccagcta
caagctcaaacactacagagccacactcaattccttgagatgcaaacaggtagcaacatt
gccgcgctaaacctgctaaatggcagccctgcaacttatgctcctgtaattgagaataaa
gtcattcaaactgaagtggttcaaagagaagttgttgctcagcctgcgattattgcaacg
ccagccactcctgttcagcctgctcctgttcaaactacagcagttcaaacggctccgact
caagcaccgcaagttaaaacagcaccagttgctacgactcctcaagtgcaagcaccgcaa
gttgttcgccaagctgcgccagctcaagccgctgttgtaccgactaatacaagtccagta
gcagttattagcgctgaaacagccctgagcgcgactctttcttcagagaaagttcaagcg
actatgttagaagtggttgccgagaagactggctacccaactgagatgcttgaacttgag
atggatatggaagccgatctaggcatcgactctatcaagcgtgtagaaattctaggtaca
gtgcaagacgagctaccgggtctgcctgaactaagccctgaagatttagccgagtgtcgc
acactaggcgaaatcgttaactatatgaactctaagctgactaatacaagtgccgcggcg
gctcttaatgttagtgccgctgaaggctctgctgtttcatctacgccagtacatagcggt
ctttctgcagagacagccctgagcgcacaaaaggtgcaggctactatgatgtcagtagtt
gccgagaagacaggctacccaactgagatgcttgagcttgagatggacatggaagccgat
ctaggtatcgactcgatcaagcgtgttgagatcttaggcacggttcaagacgagctaccg
ggtctacctgagctaaaccctgaagatttagccgagtgtagaacactgggtgaaatcgtg
gcttatatgggcagtaaactgccggctgaaggctctgctaatacaagtgccgccgcggct
cttaatgttagtgccgctgaaggctcactatctgcaactcaagtccaaagcactatgatg
tcagtggttagcgaaaagacaggttacccaactgaaatgcttgaactgagcatggatatg
gaagccgatttgggtatcgactctatcaagcgcgttgaaattctaggtacagtacaagac
gagctaccgggtctacctgagcttaaccctgaagatttagccgagtgtcgcacactaggc
gaaatcgtggcgtacatgaactctaagctgactaatacaagtgccgcagcggcgcaagtt
cctcaagtgaatgctgcaccaactacaaacggcctttctgctgaaacagccttgagcgca
actctttcttctgagaaagtccaaagcaccatgatgtcagtagtagcagaaaagacgggg
tacccaactgaaatgcttgaactaagcatggatatggaagccgatttaggtatcgactct
atcaagcgcgttgaaattctaggtacagtacaagacgagcttccaggtctacctgagctt
aaccctgaagatttagccgagtgccgcacactaggcgaaatcgtggcttatatgggaagc
aagcttccagctgaaggctctatgaactctcagcactcttcgactgttgtttctacaaca
gagacgccagtaaacggtctaagcgctgccaaagtccaaagcaccatgatgtcagtagta
gcagaaaagacgggttacccaactgaaatgcttgaactgagcatggatatggaagccgat
ttgggtatcgactctatcaagcgcgttgagatattgggtacagtacaagatgagcttcca
ggcctgcctgagctaaaccctgaagatctagccgagtgtcgtacactaggcgaaatcgta
agctatatgaacagcaagctatcaactgctggcgcaacagttgcttcaactgttgcagct
gcaaccgatgcagttaaatcagtagcagacacaatagcatctactctagagcttcctcct
catagcgaggtagcgctaaaaaagcttaatgcggcggacaaactacaagactgtttcgcc
gcagacacgaccattgtgatcaacgatgatggtcacaatgcaggtgtgctagccgagaaa
ctgactaagcaaggccttaaagtagccgtagttcgactacctgacggtcagccgcaatct
ccgctttcaagtgatgttgccagcttccaagcgaccagcatcgatgaaacagggataact
gccattatcaatcaagttgaacagcaacttgggcaaattggcggctttattcacctgcaa
cctgaggcgaatgaaagcaatcaagccgatgcggttaaccttaacgaacaaggctttact
cacctaagccaagcgttcctatgggctaagctgctacagccgaagctgacagcatcaagt
gataagcgccgcagctttatcacggttagtcgtatcgatggtggctttggttatcttaat
atcgatgcgcttaaagacgcagagctaaatcaggcagcgctagcaggcctaaccaagacg
ctaagccatgagtggccaagtgttttctgtcgagcgctcgatatcgctgtcgatgttgac
gcaacgcattttgccgatgctattgctagcgaattatttgatgctaacaaccaacttgca
gaagtaggcatagcagcagataagcaaggtaatgttagccgcgtaaccttagttgccggt
gaagcaagtgagaaacacagtgcatcagcactaaacagttcagataaaatactggtgacc
gggggcgcaaaaggagtgaccttcgaatgtgcccttgctttagctaagcgtacacagtct
cactttattcttgcaggtcgtagtgagctactagctatacctgcatgggctgaaaacaag
caaattagcgagcttaaacccgctgccattgcgcatattatctctacaggtagcaagcca
acacctaaacaagttgaaaccttagtttggacagttaagagttcaatcgagatcaacaca
gcgctagaagcatttaaccaagttggtgcaagtgctgaatatgtcagcatggatgtgact
gacactgcagctatcacagctgcgcttaatggtcgctcaaatgagatcaccggccttatc
cacggcgctggcgtacttgctgataagcatattcaagataagacaattgaagagctagct
cgcgtttacggcactaaggttaacggccttaaagctctgcttgccgcgctcgactcaagc
aaggtaaaactacttgctatgttctcatctgctgcaggtttttacggcaacacaggtcag
agtgactacgccatgtcaaacgacatcctgaacaaggccgcgctgcagttctctgcacgt
aatccacaagcaaaagtgatgagctttaactggggtccttgggatggcggtatggttacc
gatgcgttgaagaagatgttcaccgaccgtggcgtatacgttatcccactaaaagcggga
gcagagctatttgctactcagctattaggtgagactggcgtgcaactgctaataggtact
tctatgcaaggcggtgactctactaaagctgacggctcttctcaggctgaaggctctaaa
gaggctgcttctgtaaaaaagcttaatgcgggtgaggtgtttaacacatcgcgcccgcta
gcacctgttgctttaacgcctatgacgttaacaagagccttaaaccctaacgcgatggtc
tttatccaagaccaccgcattagcggtaaccctgtgttgcccactgtatgtgcaatacag
tggatgcgcgaggcagcaagtaagatgctcggcgctcaagttaaagtactcgattacaag
ctactgaaagggattatcttcgacagcaaagatgctcaggagataacccttgaattgacg
cctactgacaacggccaaatgagcgcattaatcagcagtcaaggtcgccctcagtacaag
gctacgcttgcagtgtcaagtgagagatttaccactaaatcgttcgatttaatgggtgat
gctgttacatcggcatctgagctctacagcaacggtaccctattccatggaccgcgttta
cagggcataaaacaggtatttaactttgatgatgccggtctactggcgcattgtgaacta
ccacaggtagatagcagtgattgcggtgagtttgtcgctacaacgcatattggtggcagt
cagccgtttgctgaagatctactgctacaggcgatgctggtctgggcaagacttaagtac
ggcgcagcaagcttaccttcttctatcggtgaatttatctcaaataaaccgctagcattt
ggtgacaaagcaatacttgagcttgaggtcgtgaaaacaaatgctcgctcacttgaggcg
aatgttacgctttaccatgaaaatggtgagcttagcgcgatgatgaaaggggcaaaagtc
actatcagcaagaacctcaatagcgcttttttgaatgaaacagccttgagcgttggtgaa
tcagccttgagcgatagcaagaaagccttgagcgctgaagaaaaagccctgagcaaggga
gagcgtgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
