Entry |
|
Symbol |
uvrA
|
Name |
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
|
KO |
K03701 | excinuclease ABC subunit A |
|
Organism |
splt Spiroplasma platyhelix
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:splt00001]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
SPLAT_v1c00920 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:splt03400]
SPLAT_v1c00920 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:splt03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SPLAT_v1c00920 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
SPLAT_v1c00920 (uvrA)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(107429..110305)
|
AA seq |
958 aa
MNEEQKYIIVKGAREHNLKNINISIPKNQLVVITGVSGSGKSSLAFNTIYAEGRRRYVES
LSAYARQFLGNSEKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSNNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARVG
TPYCKNGHGEISNQTLKEMIKQIQTLKDETRIEILAPIVTSKKGTYQDLLAQLKKENFLR
VKVDNKIYTLDEEIELNKNMRHDIDIVIDRIVFKNDDVTISRVHDALEVALEHSNELAKV
TINDTNETWLFSQKYACKVCGFSLPNLEPRLFSFNAPAGACPECKGVGVRLEVDEDLLMP
DMSLSINQGGIEYYKNIVNTTNLEWQKLQVLCHHYLIDLNLPLNKLTKEQIQFIMRGSKE
PINYSLTSANGRKYPNYDYIEGVATLIERRYIETTSDLAREYYRKFMTQRICVTCKGSRL
NEDVLSVKIHTTLKDKKQLLNISELTKLDIEESLEAIKHIQLLPHQQEIAKLVLVEINKR
LNFLINVGLNYLSLSRNAQTLSGGESQRIRLATQIGAQLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNNK
LIATLKTMRDLGTTLLVVEHDEDTMLAADWLIDIGPKAGIHGGKVVAEGTPEEVMANPKS
ITGQYLIGTKYIELPHTRRSGNGQVLEIKNATVNNLNNLSAKFPLGKFICITGVSGSGKS
SLINEVLYNDLHKILMKKNQKPNSIIKGYENVDKIIAISQEPIGRTPRSNPATYTSVFDD
IRDLFASSPEAKIRGYTKSRFSFNVPGGRCERCNGDGVIKISMHFLPDVYVACEVCEGKR
YNSETLQVKWKGKNIFDVLEMPVETALEFFANQAKIYKKLSVLEEVGLGYIKLGQQATEL
SGGEAQRIKLAAYLQKRATGKTMYILDEPTTGLHIDDIKKLIKVLNKIVDNGDTVIVIEH
NLEVIKVADYIIDLGPEGGKYGGKIIATGTPEQVIKNENSYTGEFLKPIIARDLKRLK |
NT seq |
2877 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaatgaagaacaaaaatatatcattgttaaaggtgcaagagaacataatttaaaaaac
attaatatcagtattcctaaaaaccaattagtagtcataactggtgtttcaggaagtggt
aaatcttctttagcttttaatacaatttatgctgaaggaagaagaagatatgttgaatca
ttgtcagcttatgctcgacaatttttaggtaacagtgaaaaacctgatgttgattcaatt
gatggcctatcgccagcaatttcaattgatcaaaaaacaacaagtaataatccgcgatca
actgttggaacagtaacagagatttatgactacttacgtttattatacgcaagagtagga
actccttattgtaagaatggtcatggtgagattagtaatcaaactttaaaagaaatgatt
aaacaaattcaaactttaaaagacgaaacaagaattgaaatcttagctccaattgtcact
agtaaaaaaggaacttatcaagatctactagcacaattgaagaaagagaactttttacgt
gtcaaagttgacaataaaatctacactttagatgaagaaattgaattaaataaaaatatg
agacatgatattgatattgtgattgatagaattgttttcaaaaatgatgatgtcacaatc
tcaagagttcatgatgctttagaagtagctttagaacatagtaatgaactagcaaaagta
acaattaatgatactaatgaaacatgattattttctcaaaaatatgcttgtaaggtttgt
ggtttttcactacctaatttagaacctcgtttgttttcattcaatgctcctgcaggagct
tgtccagaatgtaagggtgttggtgttcgtttagaagttgatgaagatttactaatgcct
gacatgagtctatcaattaatcaaggtggaattgaatattataaaaatattgtcaacaca
acaaatttggagtgacaaaaattacaagttctatgtcatcactatctaattgatttgaat
ctacccttaaataaactaacaaaagaacaaattcaatttattatgcgtggtagcaaagaa
ccaatcaactatagtctaacatcagctaatggtagaaaatatcctaactatgattatatt
gaaggtgtagcaactttaattgaaagacgctatattgaaacaactagtgatctagcacga
gaatactatcgtaaatttatgacacaaagaatttgtgttacttgtaaaggttcaagacta
aatgaagatgttttaagtgtcaaaattcatacaactctaaaagataaaaaacaattatta
aatattagtgaactaacaaaattagatattgaagaaagtttagaagcaatcaaacatatt
caattgttacctcaccaacaagaaattgctaaattagttcttgtagaaattaacaaacgt
ttgaattttttaattaatgttggcttaaattatttaagtctatcaagaaatgcacaaact
ctttcaggaggagaatcacaaagaattcgtctagcaacacaaatcggtgctcaactaaca
ggtgtgctatatgttttagatgaaccttcaattggtcttcaccaaagagacaacaataaa
ttgattgccactttaaaaacaatgcgtgatttaggaacaacactattagtagttgaacat
gatgaagatacaatgctagcagcagattgattaattgacatcggcccaaaagcaggaatt
catggtggcaaagttgttgcagaaggtacaccagaagaagttatggcaaacccaaaatca
atcactggtcagtatttaattggaactaaatatattgaacttccccatacaagaagaagt
ggtaatggtcaagttttagaaattaaaaatgccactgtcaataatttaaataacttatca
gcaaaattcccattaggaaaatttatttgtatcaccggtgtttctggtagtggaaaatca
agtttaattaatgaagttctatataatgatttgcataaaattttaatgaaaaaaaatcaa
aaaccaaatagcataattaaaggctatgaaaatgttgataaaatcatcgctatctcacaa
gaaccaattggcagaacaccaagaagtaacccagcaacttacacttctgtttttgatgac
attagagatttatttgctagtagccctgaagctaaaattcgtggctacacaaaaagccgt
ttctctttcaatgttccaggtggaagatgtgagcgatgtaatggtgatggtgtaattaaa
atttcaatgcatttcctacctgatgtttatgttgcttgtgaagtttgcgaaggcaaacgt
tacaatagtgaaacactacaagtaaaatgaaaaggaaaaaatatttttgatgttttagaa
atgcctgtcgaaacagcattagaattctttgccaaccaagcaaaaatttataaaaaacta
tcagtcttagaagaagtcggattaggatacatcaaacttggtcaacaagctactgaacta
tctggtggtgaagcacaaagaattaaactagctgcctacttacaaaaacgagcaacaggt
aaaacaatgtatatccttgatgaaccaacaacaggtcttcatatcgacgatattaaaaaa
ttaatcaaagtcttaaataaaattgtcgataatggtgatacagttattgttatcgagcat
aatttagaagttattaaagtagcagactatattatcgatttaggtcctgaaggtggaaaa
tatggtggaaaaattatcgccactggtacacctgaacaagtaattaaaaatgaaaattct
tacacaggagaatttttaaaaccaatcattgctcgtgatctaaagagacttaaataa |