KEGG   Spiroplasma platyhelix: SPLAT_v1c03550
Entry
SPLAT_v1c03550    CDS       T08168                                 
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
splt  Spiroplasma platyhelix
Pathway
splt03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:splt00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    SPLAT_v1c03550 (rnj)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:splt03019]
    SPLAT_v1c03550 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:splt03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     SPLAT_v1c03550 (rnj)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B RMMBL Lactamase_B_2 Anti-Pycsar_Apyc1 ODP Lactamase_B_3 Oxidored_nitro Lactamase_B_6
Other DBs
NCBI-ProteinID: UJB29119
LinkDB
Position
388026..389756
AA seq 576 aa
MLEEKKLNNEKIKPQEHKTSQVTKIFALGGLEEIGKNTYVVEEGNEIILIDAGVKFPDET
MPGIEAVIPDYSYLKENKEKIKAIFITHGHEDHIGGIPYLLKEIDTIPKIYAPKLAAALI
RHKLKDKGVRTKTKIEIIDGNSVIKTKKFTVNFFAVNHSIPDAFGVCVKSPNGRIVSTGD
YKFDWTPLGHQADLEKMAQMGKDGVTLFLADSTNAEVPGYTMTEMIIVKRISELFAKAKG
RILISTFASNVHRIQQIVEVASNHKRKVVVIGRSLERIINVIRQMGHLKVKDDCFIKPDE
AKKYHNNQIVILCTGSQGEPLAALSRIANREHRQIKIIPGDTVIFSSSAIPGNKLNVERV
INKLTRLNAIVEENSPLNWLHTSGHASQEEQKLMISLIKPKYFMPMHGDYRMLKTHKETA
ISVGVKEENAFICANGDQIIMEKGHCHLSNQRINADPIYVDGGKDMSEVTTTAIIRDRQI
LSKEGLIAIVVSIDSQNNKLLAPPTFISRGSFYVRDSAPLVAESIAIVTKAINDVLKNEK
VTFAILKNTIKSNLAPFIFKKKRRNPLIIPVILNKK
NT seq 1731 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttagaagaaaaaaaactaaataatgaaaaaataaaaccacaagaacataaaacatca
caagttactaaaatctttgctcttggtggtttagaagaaatcggaaagaatacttatgtt
gttgaagaaggcaacgaaattattctaattgatgcaggagttaaatttcctgatgaaaca
atgccaggaattgaagcagttatccctgattacagttacttaaaagaaaataaagaaaaa
attaaagcaatttttattactcatggtcacgaagatcatattggaggaattccttactta
ttaaaagaaattgacactattcccaaaatttatgcacctaaactagctgctgctttaatt
cgtcataaactaaaggataaaggtgttagaactaaaactaaaatcgaaataattgatggt
aactcagttatcaaaacaaagaaatttactgttaacttctttgctgtcaaccattcaatt
cctgatgcttttggagtatgtgttaaatcacctaatgggcgtattgtttcaacaggagat
tataaatttgattgaacaccattaggtcatcaagctgatttagaaaaaatggcacaaatg
ggtaaagatggtgtgactctatttttagctgactcaactaatgctgaagtgccaggttac
acaatgacagaaatgattattgttaagcgaattagtgaactatttgctaaggctaaagga
agaatcttaatttctacttttgcttcaaatgttcatcgaattcaacaaattgttgaagtt
gctagcaatcataaaagaaaagttgttgttattgggcgtagtttagagcgaattattaat
gttattcgtcaaatgggacacttaaaagtaaaagatgattgtttcatcaaaccagacgaa
gcaaaaaaatatcataataatcaaattgtaattttatgtactggttcacaaggagaacct
ttagcagctctttcaagaattgctaatcgtgaacatcgtcaaattaaaattattccaggt
gacactgtaatattctcttcttctgctattccaggtaataagcttaatgttgaacgtgtt
atcaataaattaacaagactaaatgcaattgttgaagaaaattcaccattaaattgatta
cacacttcaggtcatgcttctcaagaagaacaaaagttaatgattagcttaatcaaacca
aaatactttatgccaatgcatggtgactatcgaatgttgaaaactcacaaagaaaccgca
atatcagttggtgttaaagaagaaaatgcttttatctgtgccaatggtgatcaaattatt
atggaaaaaggtcactgtcatttaagtaatcaaagaattaacgctgatcctatttatgtt
gatggtggcaaggatatgtccgaagtcacaacaacagcaattattagagatcgccaaatt
ctttctaaagaaggtctaattgcaattgttgtttcaattgactcacaaaacaacaaatta
cttgcaccaccaaccttcatttctcgcggttcattctatgttcgtgattctgcaccttta
gttgctgaatcaattgccattgttactaaagcaataaatgatgtactaaaaaatgaaaaa
gttacttttgcaattttaaaaaatactattaaatcaaatttagcacctttcatttttaag
aaaaagcgtcgtaatccattaattattccagtaattttaaataaaaaatag

DBGET integrated database retrieval system