Spiroplasma platyhelix: SPLAT_v1c04160
Help
Entry
SPLAT_v1c04160 CDS
T08168
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
splt
Spiroplasma platyhelix
Pathway
splt03030
DNA replication
splt03430
Mismatch repair
splt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
splt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SPLAT_v1c04160 (polC)
03430 Mismatch repair
SPLAT_v1c04160 (polC)
03440 Homologous recombination
SPLAT_v1c04160 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
splt03032
]
SPLAT_v1c04160 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
splt03400
]
SPLAT_v1c04160 (polC)
Enzymes [BR:
splt01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SPLAT_v1c04160 (polC)
DNA replication proteins [BR:
splt03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SPLAT_v1c04160 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
splt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SPLAT_v1c04160 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
PHP
DNA_pol3_finger
HHH_6
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NII
DEDDh_C
DNA_pol_A_exo1
HHH_3
Ribosomal_L38e
WH_CYT4
T2SSK
DUF6282
Zn_ribbon_FGT1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJB29180
LinkDB
All DBs
Position
complement(447634..452019)
Genome browser
AA seq
1461 aa
AA seq
DB search
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NT seq
+upstream
nt +downstream
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caataa
DBGET
integrated database retrieval system
