Spiroplasma platyhelix: SPLAT_v1c05630
Help
Entry
SPLAT_v1c05630 CDS
T08168
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
splt
Spiroplasma platyhelix
Pathway
splt03030
DNA replication
splt03410
Base excision repair
splt03420
Nucleotide excision repair
splt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
splt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SPLAT_v1c05630 (polA)
03410 Base excision repair
SPLAT_v1c05630 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
SPLAT_v1c05630 (polA)
03440 Homologous recombination
SPLAT_v1c05630 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
splt03032
]
SPLAT_v1c05630 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
splt03400
]
SPLAT_v1c05630 (polA)
Enzymes [BR:
splt01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SPLAT_v1c05630 (polA)
DNA replication proteins [BR:
splt03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
SPLAT_v1c05630 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
splt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
SPLAT_v1c05630 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SPLAT_v1c05630 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_polI_exo1
HHH_5
DNA_pol_lambd_f
HHH_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJB29327
LinkDB
All DBs
Position
615285..617906
Genome browser
AA seq
873 aa
AA seq
DB search
MKKALIIDGNNLIFKAYYATAKHGASLHSLQGVPTNALYAFIRMINKFITSNNYDALFVA
FDAGKNTFRTQRYDKYKATRKSAPQELLLQIDLVKQYLDLAEIPWSQETNYEADDLIGTI
SKNKVAKDYEINIISSDKDLFQLLDDNIKILQPQKGLSDLKVMDKNQLKVEYHLEPKQIP
DLKGLMGDNSDNLPGIKGIGPKTAIKLLQKYQTLENVIANVDKLTSKESSLIKENSAIGL
LTKELATIKLDTPLKKELNDCHYDIKLLDKPELQNFYKKYDMKSLIVSQKKIIEFKDSTI
KVLESWDAKFNAKLNYVWTEICWDNYHRDPLLAIAIKNEFGTFYCRKNMIANSKELQTFL
VDKKYQKITWDIKKTIVSIKKNFNINADGFIFDHMLASYLLYANENINLENIANILQVKN
NEDLDDGEFYGRASKKHIPESETLIAQYLELKLNFLVETYPILIEKLKTNDNWELYEKIE
LPTVYSLITMEINGIAVDTKQLKTMTENTKITLDKLEKELNQIAQKTLNPNSPKQISQYL
FEELKLANPKKGSTAYEVLITLKSAHPIIPVLLEYRKVQKLYATYLNGLEKYIFPDHKIH
TIYNQVQASTGRISSTEPNMQNITIRDDEQREVRRIFIASAENLKIVSCDYSQIELRILA
DISGDTNLINAFLKNHDIHAETASKIFNVSLDQVTKEQRTRAKAVNFGIIYGISSFGLSQ
QLKISIKESQEFIDKYFVVFPKIKEYINDTIKYCQKNGYVESLFNRRRAVPEINNNNKII
REFGQRIAMNMPIQGTAADIIKLAMIKIDTAIKEKKIKANLIAQIHDELIFEIDSNDLNT
EMTKINEIMSHVVKLKVPLIINGVSGNNWYDLK
NT seq
2622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagcattgattattgatggcaataatttaatttttaaagcatactatgcaaca
gcaaagcatggagcaagtttacattctctacaaggagttccaaccaatgcattatatgct
ttcatcagaatgatcaataaatttattacctcaaataattatgatgctttatttgttgcc
tttgatgcaggaaaaaatactttcagaactcaacgctatgataagtataaagctactcgt
aagtctgcgccacaagaactactattacaaattgatctagttaagcaatacttagactta
gccgagattccttgaagtcaagaaactaattatgaagctgatgatctaattggtacaatt
agcaaaaataaagtagctaaagattacgaaataaatatcatcagtagtgacaaagactta
tttcaattattagatgacaacattaaaatcttacaacctcaaaaaggtttaagtgatctt
aaagtaatggataaaaatcaattaaaagtagaatatcatttagaaccgaaacaaattcct
gatttaaaaggtttaatgggtgacaattctgataacttaccaggaattaaaggcattgga
cccaaaacagcaattaaactgctgcaaaaatatcaaacattagaaaatgttatcgctaat
gttgataaactaacaagcaaagaaagttcattaattaaagaaaatagtgcaataggtttg
ctaactaaagaactagcaactattaaattagatacaccattaaaaaaagaattaaatgat
tgtcactacgatattaagttgttagataaacccgaattacaaaatttctacaaaaaatat
gatatgaaaagtttaattgtctcacaaaaaaaaattattgaatttaaagatagcactatt
aaagttttagaatcgtgagatgcaaaatttaatgcaaaactcaactatgtgtgaacagaa
atttgttgagacaactaccatcgtgatccgctactagcaattgctattaaaaatgaattt
ggtactttttattgtcgaaaaaatatgattgcaaattctaaagaattgcaaactttttta
gttgataaaaaataccaaaaaattacttgagacattaaaaaaactatcgtttcaattaaa
aaaaattttaacattaatgctgatggctttatttttgatcatatgctagctagttaccta
ctatatgccaatgaaaatattaatttagaaaatattgctaacattttgcaagtaaaaaat
aatgaagatttagatgatggtgaattttatggccgagcaagtaaaaagcatattccagaa
tctgaaactttaattgctcaatatttagaattaaaattaaactttttagtcgaaacttat
ccaattttaattgaaaaattaaaaactaacgataattgagaattatatgaaaagattgaa
ttacccactgtctactctttaataactatggaaattaatggtattgcagttgatacaaaa
caattaaaaactatgactgaaaatacaaaaattactttagacaaattagaaaaagaactt
aatcaaattgctcaaaaaactcttaaccctaactcaccaaaacaaattagtcagtatctt
tttgaagaattaaaactagcaaatcctaaaaaaggtagtactgcctacgaagtattgatt
actttaaaatctgctcatccaattattcctgttttgttagaatatcgaaaagttcaaaag
ctttatgctacttatcttaatggcctagaaaaatatatattccctgatcacaaaattcat
acaatttacaatcaagttcaagcaagtacaggaagaatttcttcaactgaacctaatatg
caaaatattaccattcgtgatgatgaacaaagagaagtaagaagaatatttattgccagt
gctgaaaacttaaaaattgtttcatgtgactattcgcaaattgaattaagaatcttagct
gacatcagtggtgatacaaatttaatcaatgctttcttaaaaaatcatgatatccatgct
gaaacagcaagtaaaatttttaatgttagtttagatcaagttacaaaagaacaaagaact
agagctaaggctgtcaactttggcatcatctacggcatctcaagttttggtctcagtcaa
caattaaaaattagtataaaagaatcacaagaatttattgataaatattttgttgtattt
ccaaaaattaaagagtatattaatgacacaatcaaatattgtcaaaaaaatggttatgtt
gaaagtcttttcaatcgtcgcagagctgttccagaaattaacaacaacaacaaaattatt
agagaattcggacaaagaattgctatgaatatgccaattcaagggactgctgctgatatt
atcaaacttgcgatgattaaaattgacactgcaattaaagaaaagaaaattaaagctaat
ttaattgctcaaattcatgatgaattaatttttgagattgatagcaatgatttaaataca
gaaatgacaaaaattaatgagattatgagtcatgttgttaaattaaaagtaccattaata
attaatggtgtttctggtaataactgatatgatttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
